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IT-ISJ标记及其在陆地棉遗传图谱构建中的应用
被引量:
13
1
作者
郑靓
张正圣
+7 位作者
陈利
万群
胡美纯
王威
张轲
刘大军
陈笑
魏新琦
《中国农业科学》
CAS
CSCD
北大核心
2008年第8期2241-2248,共8页
【目的】开发可用于植物遗传多样性分析和遗传图谱构建的新型标记。【方法】根据植物结构基因内含子拼接位点的保守序列,设计扩增内含子的内含子-外显子拼接位点(intron targeted intron-exon splice junction,IT-ISJ)标记引物,并用于...
【目的】开发可用于植物遗传多样性分析和遗传图谱构建的新型标记。【方法】根据植物结构基因内含子拼接位点的保守序列,设计扩增内含子的内含子-外显子拼接位点(intron targeted intron-exon splice junction,IT-ISJ)标记引物,并用于陆地棉遗传图谱构建。【结果】利用704个IT-ISJ引物组合,对陆地棉高品质品种渝棉1号和多显性基因标记系T586进行多态性筛选,获得49个多态性引物组合,占筛选引物的7.0%。49个多态性引物组合在(渝棉1号×T586)F2:7重组近交系群体270个系中检测到58个位点。以58个IT-ISJ、150个SSR和8个形态标记进行连锁分析,构建的遗传连锁图包括22个连锁群、113个位点(49个IT-ISJ、62个SSR和2个形态标记)。连锁图覆盖714.5cM,占棉花基因组的16.1%,标记间平均长度为6.3cM。【结论】IT-ISJ标记多态性高,可有效地用于陆地棉遗传连锁图谱的构建。
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关键词
内含子定靶的内含子-外显子
拼接位点
(IT-ISJ)
陆地棉
遗传图谱
下载PDF
职称材料
马传染性贫血病毒基因组部分转录图谱
被引量:
1
2
作者
刘相冬
张宝山
+6 位作者
孔宪刚
王滨有
孙成群
刘永刚
周家喜
王凯波
刘建华
《病毒学报》
CAS
CSCD
北大核心
2001年第3期245-249,共5页
以马传贫驴白细胞弱毒和驴强毒分别接种培养细胞和试验动物 ,分别在体外和体内条件下 ,对病毒的各种转录产物进行克隆和序列分析。通过与病毒基因组的序列进行比较 ,用实验的方法绘制出了两株病毒在相应试验条件下的转录图谱 ,确定了各...
以马传贫驴白细胞弱毒和驴强毒分别接种培养细胞和试验动物 ,分别在体外和体内条件下 ,对病毒的各种转录产物进行克隆和序列分析。通过与病毒基因组的序列进行比较 ,用实验的方法绘制出了两株病毒在相应试验条件下的转录图谱 ,确定了各拼接产物的外显子构成以及拼接供体和拼接受体位点的具体位置。发现两种病毒在外显子 3的上游拼接受体位点 (SA2 )的位置与已报道的EIAV毒株均不相同 。
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关键词
马传染性贫血病毒
转录图谱
拼接位点
拼接
信号
病毒基因组
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职称材料
肾上腺皮质肿瘤与MEN1基因的相关性研究
3
作者
潘宏达
郭春苗
郭奕斌
《分子诊断与治疗杂志》
2010年第4期241-243,共3页
目的从分子水平上揭示散发性肾上腺皮质肿瘤的发病与MEN1基因突变的相互关系,为今后开展症状前诊断和产前基因诊断创造前提条件。方法在对先证者进行临床诊断的基础上,用微量快提法制备模板DNA,用自行设计的9对引物对先证者MEN1基因的...
目的从分子水平上揭示散发性肾上腺皮质肿瘤的发病与MEN1基因突变的相互关系,为今后开展症状前诊断和产前基因诊断创造前提条件。方法在对先证者进行临床诊断的基础上,用微量快提法制备模板DNA,用自行设计的9对引物对先证者MEN1基因的所有编码区以及外显子与内含子的交界部位进行PCR扩增和DNA序列分析。结果先证者MEN1基因第4内含子存在隐蔽性拼接位点IVS4 as(-9)G>A的杂合突变,而正常对照无此突变。结论所用检测方法快速简便、微量经济,可用于肾上腺皮质肿瘤的快速确诊。所发现的MEN1基因的IVS4 as(-9)G>A隐蔽性拼接位点突变为国内首报的病理性突变。
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关键词
肾上腺皮质肿瘤
MEN1基因
隐蔽性
拼接位点
基因诊断
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职称材料
题名
IT-ISJ标记及其在陆地棉遗传图谱构建中的应用
被引量:
13
1
作者
郑靓
张正圣
陈利
万群
胡美纯
王威
张轲
刘大军
陈笑
魏新琦
机构
西南大学农学与生物科技学院/农业部生物技术与作物品质改良重点实验室
出处
《中国农业科学》
CAS
CSCD
北大核心
2008年第8期2241-2248,共8页
基金
国家自然科学基金项目(30370898
30571187)
+1 种基金
国家高技术研究发展计划("863"计划)(2006AA10Z1D3
2006011001043)
文摘
【目的】开发可用于植物遗传多样性分析和遗传图谱构建的新型标记。【方法】根据植物结构基因内含子拼接位点的保守序列,设计扩增内含子的内含子-外显子拼接位点(intron targeted intron-exon splice junction,IT-ISJ)标记引物,并用于陆地棉遗传图谱构建。【结果】利用704个IT-ISJ引物组合,对陆地棉高品质品种渝棉1号和多显性基因标记系T586进行多态性筛选,获得49个多态性引物组合,占筛选引物的7.0%。49个多态性引物组合在(渝棉1号×T586)F2:7重组近交系群体270个系中检测到58个位点。以58个IT-ISJ、150个SSR和8个形态标记进行连锁分析,构建的遗传连锁图包括22个连锁群、113个位点(49个IT-ISJ、62个SSR和2个形态标记)。连锁图覆盖714.5cM,占棉花基因组的16.1%,标记间平均长度为6.3cM。【结论】IT-ISJ标记多态性高,可有效地用于陆地棉遗传连锁图谱的构建。
关键词
内含子定靶的内含子-外显子
拼接位点
(IT-ISJ)
陆地棉
遗传图谱
Keywords
IT-ISJ (intron targeted intron-exon splice junction)
Upland cotton (Gossypium hirsutum L.)
Linkage map
分类号
S562 [农业科学—作物学]
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职称材料
题名
马传染性贫血病毒基因组部分转录图谱
被引量:
1
2
作者
刘相冬
张宝山
孔宪刚
王滨有
孙成群
刘永刚
周家喜
王凯波
刘建华
机构
哈尔滨医科大学公共卫生学院
中国农业科学院哈尔滨兽医研究所兽医生物技术国家重点实验室
出处
《病毒学报》
CAS
CSCD
北大核心
2001年第3期245-249,共5页
文摘
以马传贫驴白细胞弱毒和驴强毒分别接种培养细胞和试验动物 ,分别在体外和体内条件下 ,对病毒的各种转录产物进行克隆和序列分析。通过与病毒基因组的序列进行比较 ,用实验的方法绘制出了两株病毒在相应试验条件下的转录图谱 ,确定了各拼接产物的外显子构成以及拼接供体和拼接受体位点的具体位置。发现两种病毒在外显子 3的上游拼接受体位点 (SA2 )的位置与已报道的EIAV毒株均不相同 。
关键词
马传染性贫血病毒
转录图谱
拼接位点
拼接
信号
病毒基因组
Keywords
EIAV
transcription map
splicing sites
splicing signal
分类号
S852.652 [农业科学—基础兽医学]
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职称材料
题名
肾上腺皮质肿瘤与MEN1基因的相关性研究
3
作者
潘宏达
郭春苗
郭奕斌
机构
四川大学华西临床医学院临床医学系
福建医科大学附属第二医院内科
中山大学中山医学院医学遗传室
出处
《分子诊断与治疗杂志》
2010年第4期241-243,共3页
基金
CMB部分基金项目(2003)
文摘
目的从分子水平上揭示散发性肾上腺皮质肿瘤的发病与MEN1基因突变的相互关系,为今后开展症状前诊断和产前基因诊断创造前提条件。方法在对先证者进行临床诊断的基础上,用微量快提法制备模板DNA,用自行设计的9对引物对先证者MEN1基因的所有编码区以及外显子与内含子的交界部位进行PCR扩增和DNA序列分析。结果先证者MEN1基因第4内含子存在隐蔽性拼接位点IVS4 as(-9)G>A的杂合突变,而正常对照无此突变。结论所用检测方法快速简便、微量经济,可用于肾上腺皮质肿瘤的快速确诊。所发现的MEN1基因的IVS4 as(-9)G>A隐蔽性拼接位点突变为国内首报的病理性突变。
关键词
肾上腺皮质肿瘤
MEN1基因
隐蔽性
拼接位点
基因诊断
Keywords
Sporadic adrenocortical tumour
MEN1 gene
Cryptic splice sites (CSS)
Gene diagnosis
分类号
R736.6 [医药卫生—肿瘤]
下载PDF
职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
IT-ISJ标记及其在陆地棉遗传图谱构建中的应用
郑靓
张正圣
陈利
万群
胡美纯
王威
张轲
刘大军
陈笑
魏新琦
《中国农业科学》
CAS
CSCD
北大核心
2008
13
下载PDF
职称材料
2
马传染性贫血病毒基因组部分转录图谱
刘相冬
张宝山
孔宪刚
王滨有
孙成群
刘永刚
周家喜
王凯波
刘建华
《病毒学报》
CAS
CSCD
北大核心
2001
1
下载PDF
职称材料
3
肾上腺皮质肿瘤与MEN1基因的相关性研究
潘宏达
郭春苗
郭奕斌
《分子诊断与治疗杂志》
2010
0
下载PDF
职称材料
已选择
0
条
导出题录
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参考文献
引证文献
统计分析
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