2023年6月2日,浙江大学生命演化研究中心张国捷教授团队与丹麦奥胡斯大学Mikkel H SCHIERUP教授团队合作在《科学》(Science)上发表了最新的研究成果论文“Pervasive incomplete lineage sorting illuminates speciation and selection ...2023年6月2日,浙江大学生命演化研究中心张国捷教授团队与丹麦奥胡斯大学Mikkel H SCHIERUP教授团队合作在《科学》(Science)上发表了最新的研究成果论文“Pervasive incomplete lineage sorting illuminates speciation and selection in primates”(DOI:10.1126/science.abn4409)。该研究利用全基因组数据,对29个灵长类祖先节点的不完全谱系分流现象进行了分析。研究发现在灵长类所有演化节点上,灵长类基因组上有5%~64%区域发生了不完全谱系分流,说明在灵长类的演化历程中,不完全谱系分流对灵长类的物种分化过程产生了较大的影响。而有些基因组区域在多个物种分化事件中都经历不完全谱系分流,反映了这些区域受到特殊的选择压力。如与肤色和免疫相关的基因一直处于较高不完全谱系分流水平,丰富了这些基因在灵长类物种间的多样性。相反,极度保守、维持细胞最基本功能所必需的持家基因则较少经历不完全谱系分流,基本遵循物种的分化过程中在物种间形成的差异。展开更多
为阐明四川部分地区野生白三叶根瘤菌的遗传多样性及系统发育地位,对分离自四川雅安、康定、泸定、西昌、成都和乐山6个地区白三叶根瘤的69株菌进行系统研究。采用16SrDNA限制性片段长度多态性分析(restriction fragment length polymor...为阐明四川部分地区野生白三叶根瘤菌的遗传多样性及系统发育地位,对分离自四川雅安、康定、泸定、西昌、成都和乐山6个地区白三叶根瘤的69株菌进行系统研究。采用16SrDNA限制性片段长度多态性分析(restriction fragment length polymorphism,RFLP)和16SrDNA基因、持家基因(recA、atpD、glnII)、结瘤基因(nodC)、固氮基因(nifH)系统发育分析的方法进行了研究。结果表明,16SrDNA PCR-RFLP中所有供试菌株产生了4种酶切图谱类型,表现出较为丰富的遗传多样性。持家基因与16SrDNA基因系统发育分析结果基本一致,9株代表菌株主要分布在α-变形菌纲(Alpha-Proteobacteria)的根瘤菌属(Rhizobium),并与豌豆根瘤菌三叶草生物型(R.leguminosarumbv.trifolii)ATCC 14480T的亲缘关系较近。PCR可扩增出nodC和nifH基因片段,但从属于土壤杆菌属(Agrobacterium)的菌株LS1105中则扩增不出这两个基因。所有供试菌株被鉴定到了种的水平,证实了68株为白三叶根瘤菌,并通过不同采样地点菌株之间的比较,发现白三叶与根瘤菌的共生关系因地理分布不同而具有多样性,对于丰富白三叶根瘤菌资源及其开发利用具有重要意义。展开更多
葡萄果实发育后期基因表达水平的变化对果实品质形成具有重要影响,内参基因的选择是基因表达定量分析的关键影响因素。本试验以雷司令葡萄品种花后50、75和95 d的果实为材料,通过半定量RT-PCR,研究了常用持家基因Actin、Tubulin、GAPDH1...葡萄果实发育后期基因表达水平的变化对果实品质形成具有重要影响,内参基因的选择是基因表达定量分析的关键影响因素。本试验以雷司令葡萄品种花后50、75和95 d的果实为材料,通过半定量RT-PCR,研究了常用持家基因Actin、Tubulin、GAPDH1、8 S rRNA的表达变化,探讨其作为葡萄果实发育后期基因表达半定量分析内参基因的可行性。结果表明:18 S rRNA的表达水平高,且最稳定,其次是Actin,而Tubulin和GADPH的相对表达水平较低;对VvTLP、GHF17 P和VvASR3个功能基因在不同果实材料中的表达水平进行半定量RT-PCR,VvTLP和VvASR的相对表达水平较高,GHF17 P的表达水平较低,整体上均呈现递增的趋势;以Actin和18 S rRNA为内参得到的归一化结果基本一致,在4个持家基因中18 S rRNA和Tubulin是优选的葡萄果实发育后期基因表达研究的内参基因。展开更多
文摘2023年6月2日,浙江大学生命演化研究中心张国捷教授团队与丹麦奥胡斯大学Mikkel H SCHIERUP教授团队合作在《科学》(Science)上发表了最新的研究成果论文“Pervasive incomplete lineage sorting illuminates speciation and selection in primates”(DOI:10.1126/science.abn4409)。该研究利用全基因组数据,对29个灵长类祖先节点的不完全谱系分流现象进行了分析。研究发现在灵长类所有演化节点上,灵长类基因组上有5%~64%区域发生了不完全谱系分流,说明在灵长类的演化历程中,不完全谱系分流对灵长类的物种分化过程产生了较大的影响。而有些基因组区域在多个物种分化事件中都经历不完全谱系分流,反映了这些区域受到特殊的选择压力。如与肤色和免疫相关的基因一直处于较高不完全谱系分流水平,丰富了这些基因在灵长类物种间的多样性。相反,极度保守、维持细胞最基本功能所必需的持家基因则较少经历不完全谱系分流,基本遵循物种的分化过程中在物种间形成的差异。
文摘葡萄果实发育后期基因表达水平的变化对果实品质形成具有重要影响,内参基因的选择是基因表达定量分析的关键影响因素。本试验以雷司令葡萄品种花后50、75和95 d的果实为材料,通过半定量RT-PCR,研究了常用持家基因Actin、Tubulin、GAPDH1、8 S rRNA的表达变化,探讨其作为葡萄果实发育后期基因表达半定量分析内参基因的可行性。结果表明:18 S rRNA的表达水平高,且最稳定,其次是Actin,而Tubulin和GADPH的相对表达水平较低;对VvTLP、GHF17 P和VvASR3个功能基因在不同果实材料中的表达水平进行半定量RT-PCR,VvTLP和VvASR的相对表达水平较高,GHF17 P的表达水平较低,整体上均呈现递增的趋势;以Actin和18 S rRNA为内参得到的归一化结果基本一致,在4个持家基因中18 S rRNA和Tubulin是优选的葡萄果实发育后期基因表达研究的内参基因。
