我国人群感染指环病毒的高通量测序分析

目的分析我国人群感染指环病毒的多样性,为研究指环病毒科的感染与不同疾病发生以及宿主免疫状态之间的关系提供基础资料。方法从33份血液标本中提取病毒核酸,使用多重置换扩增技术富集指环病毒核酸,然后使用Ion Torrent PGM平台进行高通量测序,并进行生物信息学分析。结果共得到226个新的指环病毒序列,包括130条全序和96个ORF1。受检血液标本均检出包括TTV,TTMDV和TTMV等指环病毒;测序显示指环病毒中81.9%为TTV,48.5%的标本感染两个属以上的指环病毒。指环病毒ORF1至少81.13%发生变异,其中TTV属内也存在75.66%的变异,13.27%的序列在NCBI的核酸数据库中同源比对未成功。进化分析显示TTV基因3型又可分为3.1、3.2、3.3等3个亚型,以往命名的基因2型是基因3.3型的一个子分枝。新型TTV中51.9%属于基因3型。结论我国人群普遍感染指环病毒,以基因3型感染居多且基因组多样性高。

2023 5月全国水产养殖病害预测预报

5月,随着立夏节气的到来,气温、水温将逐步升高,全国普遍进入生产旺季。根据近年同期全国水产养殖病情测报数据和今年天气情况,我们对5月易发疾病进行了预测,供参考。病情预测5月水产养殖应该重点关注草鱼出血病、鲫造血器官坏死病、病毒性神经坏死病、鲤浮肿病、柱状黄杆菌病、细菌性肠炎病、刺激隐核虫病、车轮虫病、指环虫病、白斑综合征、十足目虹彩病毒病、对虾玻璃苗弧菌病、虾肝肠胞虫病等。

水产动物肝胆综合征的发生原因和防治措施

肝胆综合征是近年来发病率很高的鱼病之一,已经普遍流行于全国各地,给水产行业带来较大的损失。这类疾病危害的对象主要是草鱼、鲫鱼、鲤鱼、青鱼、罗非鱼、斑点叉尾、乌鳢、虹鳟、团头鲂等鱼类,也常见于鳖。对于鱼类,鱼种到成鱼都有可能发病,所以针对此类疾病,必须严格把关,认真采取有效防治措施。

指环病毒6实时荧光定量PCR检测体系的建立与验证

目的 建立指环病毒(Torque teno virus,TTV)6实时荧光定量PCR检测体系,并验证检测体系的敏感性与特异性。方法 根据GenBank中登录的TTV6基因序列设计引物与FAM-Eclipse探针,建立基于FAM-Eclipse探针法的实时荧光定量PCR检测方法,建立标准曲线并进行敏感性与特异性分析。结果 建立了能够特异检测TTV6的荧光定量PCR检测方法,标准曲线方程为y=-3.0921x + 28.36,扩增效率和R2分别为99.6%和1.000。该方法检测TTV6的敏感度为1.0×10拷贝/μl,与其他病毒无交叉反应。在临床呼吸道感染人群56份咽拭子样本中检出1例TTV6阳性。结论 基于FAM-Eclipse探针建立的检测TTV6实时荧光定量PCR检测体系具有特异性强与灵敏度高等优点,可为临床上TTV6的检出与定量病毒含量提供了一种有效的手段。

浅谈家庭饲养观赏鱼的传染性疾病及其防治技术(下)

(接上期)四、常用药物种类及其参考使用剂量不同疾病所采用的防治药物是不同的。饲养者首先要了解自己饲养的观赏鱼所需要预防或治疗的是什么疾病,才能"对症下药"。对于名贵观赏鱼的疾病诊断,最好先取一点鳃部组织和体表粘液放在玻璃片上,用显微镜检查是否有肉眼看不到的小型寄生虫。

指环病毒7型、8型与10型实时荧光定量PCR检测体系的建立

目的建立指环病毒7型(TTV7)、8型(TTV8)、10型(TTV10)实时荧光定量PCR检测体系并进行临床验证。方法本研究根据GenBank已发布的TTV7、TTV8、TTV10基因序列设计特异性引物,构建重组质粒pMD19-T-TTV7、pMD19-T-TTV8、pMD19-T-TTV10,以其作为阳性标准品建立了基于FAM-Eclipse探针法的实时荧光定量PCR检测,并进行特异性、敏感性试验与临床样本检测。结果TTV7、TTV8、TTV10的实时荧光定量PCR检测体系标准曲线方程分别为y=-0.3402x+114.7800、y=-0.3511x+114.9400、y=-0.3489x+115.0200,相关系数都在0.99以上,与其他病毒无交叉反应,检测敏感性分别为108拷贝/μl、84拷贝/μl、98拷贝/μl。在临床小儿血清样本中的检测阳性率分别为10.9%、2.1%和4.3%。结论本研究建立的TTV7、TTV8、TTV10实时荧光定量PCR检测体系具有特异性强、灵敏性高等特点,可为临床血清样本TTV检测提供一个快速手段。

人指环病毒研究进展

人指环病毒是近年新发现的一种DNA病毒,在国际病毒分类委员会(International Committee on Taxonomy of Viruses,ICTV)最近的报告中被划归于指环病毒科。人指环病毒在全世界范围内广泛流行,本文将对人指环病毒的病原特征、流行病学特点、临床表现和实验室检测方法进行简要综述。

肖恩·帕克 三次改变世界的局外人

他先后3次以联合创始人的身份参与创办了Napster、Plaxo和Facebook,又先后3次被扫地出门。

5月全国水产养殖病害预测预报

五月份,全国平均温度14℃~25℃,平均降水101mm。有立夏和小满两个节气,这一时节,万物繁盛,炎暑将临,我国北方大部分地区气温迅速回升,但降水量却不多;南方大部分地区进入了多雨的季节,天气多变、晴雨交织、温度变化反复,容易造成养殖池塘溶氧低,底质恶化等情况,使一些水生动物疾病频发。

9月全国水产养殖病害预测预报

水产养殖经过一个漫长而炎热的夏季,就要步入夏秋季节转换的9月了,这一时期昼夜温差加大,养殖水体的载鱼量、投喂量达到全年的高峰,对大多数水产养殖品种的生长和摄食较为有利,养殖对象生长迅速。但与此同时水产养殖也面临池塘水质老化、藻类大量繁殖等问题,这些易导致水生动物多种疾病的发生。

江苏泰州地区HIV感染人群的血浆病毒群落研究

为探讨人类免疫缺陷病毒(Human immunodeficiency virus,HIV)感染人群血浆病毒群落组成,分析HIV感染人群血浆病毒群落的特点,研究病毒载量对HIV感染人群血浆病毒群落的影响,本研究通过Miseq高通量测序,对江苏泰州地区203份HIV感染人群的血浆样本进行了病毒宏基因组学分析。结果显示,高通量测序共得到243824条注释为病毒的序列,可注释到至少17个不同的病毒科(包括未分类病毒),包括12种哺乳动物类病毒(占99.87%),2种昆虫病毒(占0.05%),1种植物病毒(占不到0.01%),2种其他病毒(占0.02%)及未分类病毒;检出HIV病毒载量组的病毒群落中占据主导地位的是细小病毒科,其次是黄病毒科和指环病毒科,未检出病毒载量组中的主要病毒为黄病毒科,其次为指环病毒科和细小病毒科;系统进化分析显示,注释为细小病毒的序列与已知病毒的同源性较高,而注释为指环病毒和人佩吉病毒的序列中有部分序列与已知病毒同源性较高,另有部分序列与已知病毒的差异较大,疑似有新型病毒的存在;应用PCR扩增对部分病毒序列进行验证,将验证后的部分序列与原始序列进行比对,一致性达到近99%。

把关大夫金指环

关于提高网络安全系数．相信大家都会在上网之前装了不少防护类的软件吧。例如：防火墙、脚本防护系统、弹出式广告禁止工具、电子邮件病毒过滤工具等。但这些会让系统资源占用非常多，有时候上网多打开几个网页，就会弹出对话框提示内存不够。大家碰到这类问题肯定头痛极了。又要减少资源占用又要提高系统安全。唉，一个字“难”。近日在硬盘中找到了一个不错的系统把关大夫．她就是“金指环”。功能集合了上述提到的全部软件功能。希望能给大家提高系统安全的同时大大减少系统资源的损耗。