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两元指纹向量聚类问题的复杂性与改进启发式算法
被引量:
1
1
作者
刘培强
朱大铭
+2 位作者
谢青松
范辉
马绍汉
《软件学报》
EI
CSCD
北大核心
2008年第3期500-510,共11页
证明丢失值位数不超过2的指纹向量聚类问题为NP-Hard,并给出Figueroa等人指纹向量聚类启发式算法的改进算法.主要改进了算法的实现方法.以链表存储相容顶点集合,并以逐位扫描指纹向量的方法产生相容点集链表,可将产生相容点集的时间复...
证明丢失值位数不超过2的指纹向量聚类问题为NP-Hard,并给出Figueroa等人指纹向量聚类启发式算法的改进算法.主要改进了算法的实现方法.以链表存储相容顶点集合,并以逐位扫描指纹向量的方法产生相容点集链表,可将产生相容点集的时间复杂性由O(m·n·2p)减小为O(m·(n·p+1)·2p),可使划分一个唯一极大团或最大团的时间复杂性由O(m·p·2p)减小为O(m·2p).实际测试显示,改进算法的空间复杂性平均减少为原算法的49%以下,平均可用原算法20%的时间求解与原算法相同的实例.当丢失值位数超过6时,改进算法几乎总可用不超过原算法11%的时间计算与原算法相同的实例.
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关键词
算法
复杂性
指纹向量聚类
基因表达谱
团划分
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职称材料
题名
两元指纹向量聚类问题的复杂性与改进启发式算法
被引量:
1
1
作者
刘培强
朱大铭
谢青松
范辉
马绍汉
机构
山东工商学院信息与电子工程学院
山东大学计算机科学技术学院
出处
《软件学报》
EI
CSCD
北大核心
2008年第3期500-510,共11页
基金
Supported by the National Natural Science Foundation of China under Grant Nos.60573024, 60673153 (国家自然科学基金)
the Natural Science Foundation of Shandong Province of China under Grant No.Z2004G03 (山东省自然科学基金)
文摘
证明丢失值位数不超过2的指纹向量聚类问题为NP-Hard,并给出Figueroa等人指纹向量聚类启发式算法的改进算法.主要改进了算法的实现方法.以链表存储相容顶点集合,并以逐位扫描指纹向量的方法产生相容点集链表,可将产生相容点集的时间复杂性由O(m·n·2p)减小为O(m·(n·p+1)·2p),可使划分一个唯一极大团或最大团的时间复杂性由O(m·p·2p)减小为O(m·2p).实际测试显示,改进算法的空间复杂性平均减少为原算法的49%以下,平均可用原算法20%的时间求解与原算法相同的实例.当丢失值位数超过6时,改进算法几乎总可用不超过原算法11%的时间计算与原算法相同的实例.
关键词
算法
复杂性
指纹向量聚类
基因表达谱
团划分
Keywords
algorithm
complexity
fingerprint clustering
gene expression data
clique partition
分类号
TP301 [自动化与计算机技术—计算机系统结构]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
两元指纹向量聚类问题的复杂性与改进启发式算法
刘培强
朱大铭
谢青松
范辉
马绍汉
《软件学报》
EI
CSCD
北大核心
2008
1
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