期刊文献+
共找到2篇文章
< 1 >
每页显示 20 50 100
指纹基因群分析揭示锯齿型结直肠癌的预后和耐药特性 被引量:2
1
作者 苗华 曹付傲 +4 位作者 李旭 缪宗原 叶淳 张畅 王汉涛 《第二军医大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第11期1247-1253,共7页
目的利用指纹基因群(GES)分析技术挖掘现有公共芯片数据揭示锯齿型结直肠癌的预后和耐药特性。方法从基因表达谱数据储存公共平台(GEO)中下载4个有预后信息的结直肠癌表达谱芯片数据(GSE14333、GSE17538、GSE33113、GSE37892),用... 目的利用指纹基因群(GES)分析技术挖掘现有公共芯片数据揭示锯齿型结直肠癌的预后和耐药特性。方法从基因表达谱数据储存公共平台(GEO)中下载4个有预后信息的结直肠癌表达谱芯片数据(GSE14333、GSE17538、GSE33113、GSE37892),用批间误差校正和单基因信息抽提等信息技术获得1个整合的表达谱队列(n=600)。获得锯齿型结直肠癌表达谱有关数据及相应特异性指纹基因群,并与前面的表达谱队列合并,建立指纹基因群评分系统,依托已知锯齿型结直肠癌样本的基因群评分确定分组界值。根据分组界值,将600例结直肠癌分为锯齿型、过渡型和传统型结直肠癌组,利用Kaplan-Meier和Cox模型分析锯齿型结直肠癌的预后特征。同时,收集并下载与不可切除结直肠癌姑息治疗有关的表达谱数据(GSE28702、GSE5851),经表达谱数据抽提整理后,获得每个样本的锯齿型指纹基因群评分,通过比较治疗有效组和无效组之间评分的统计学差异来揭示锯齿型结直肠癌与药物耐药的关系。结果根据结直肠癌亚型评分界值,600个结直肠癌中有50个被分为锯齿型,126个被分类为过渡型,424个被分为传统型。锯齿型和过渡型结直肠癌与传统型结直肠癌相比具有几乎完全相同的预后能力,多因素Cox模型发现锯齿型和过渡型结直肠癌是患者术后复发的独立危险因素。单纯比较锯齿型和传统型结直肠癌,多因素Cox模型发现锯齿型结直肠癌是患者预后的不良因素(AHR=1.792,95%CI 1.011~3.177)。西妥昔治疗有效组的指纹基因群评分显著低于无效组(P=0.017),但FOLFOX治疗有效组和无效组的基因群评分无差异。结论结直肠癌锯齿型亚型是结直肠癌患者术后复发的独立危险因素,且与西妥昔单抗治疗耐药相关。 展开更多
关键词 锯齿型结直肠癌 指纹基因群 预后 肿瘤抗药性
下载PDF
Development of two microsatellite multiplex PCR systems for high throughput genotyping in Populus euphratica 被引量:1
2
作者 Eusemann Pascal Fehrenz Steffen Schnittler Martin 《Journal of Forestry Research》 SCIE CAS CSCD 2009年第A3期195-198,285,共5页
Eighteen microsatellite primer pairs previously developed at Oak Ridge National Laboratory for Populus tremuloides Michx. and Populus trichocarpa Torr. & Gray were screened for amplification in Euphrates poplar, P... Eighteen microsatellite primer pairs previously developed at Oak Ridge National Laboratory for Populus tremuloides Michx. and Populus trichocarpa Torr. & Gray were screened for amplification in Euphrates poplar, Populus euphratica Oliv. Thirteen loci were found to express polymorphisms ranging from two to 17 alleles. The eight most variable loci were selected to set up and optimize two multiplex polymerase chain reaction (PCR) assays. Three populations containing altogether 436 trees were used to characterize the selected loci and ascertain their applicability for parentage analysis and genotyping studies. Through cross-checking of clonal identity against sex of the genotyped trees we estimated the maximum error rate for merging genotypes to be less than 0.045. 展开更多
关键词 clone identification Euphrates poplar genetic fingerprint parentage analysis population structure SSR primers
下载PDF
上一页 1 下一页 到第
使用帮助 返回顶部