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29个梨品种SSR特征指纹数据表的构建
被引量:
19
1
作者
薛华柏
杨健
+5 位作者
王龙
王苏珂
张慧蓉
乔玉山
章镇
李秀根
《果树学报》
CAS
CSCD
北大核心
2015年第6期1028-1035,共8页
【目的】为便于果树种质区分鉴定,资源交换、管理和利用,新品种特异性、一致性和稳定性(DUS)测试,以29个梨品种SSR指纹数据作为基础数据,演示了一种二倍体果树品种SSR特征指纹数据表的构建方法。【方法】经过SSR位点基因型数目统计,SSR...
【目的】为便于果树种质区分鉴定,资源交换、管理和利用,新品种特异性、一致性和稳定性(DUS)测试,以29个梨品种SSR指纹数据作为基础数据,演示了一种二倍体果树品种SSR特征指纹数据表的构建方法。【方法】经过SSR位点基因型数目统计,SSR位点排序,供试品种排序区分和数据标示,表格优化等数据整合处理步骤,构建了29个梨品种SSR特征指纹数据表。【结果】12对SSR引物中,CH04h02和NAUpy65d 2对引物能将供试的29个梨品种全部区分开,可作为鉴定这29个梨品种时的核心引物加以利用。【结论】该方法简便易行,特征指纹数据表数据信息展示全面直观,品种区分关系一目了然,便于交流共享和指纹图谱数据库共建。
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关键词
梨
分子标记
SSR
品种鉴定
指纹数据表
下载PDF
职称材料
80个梨品种SSR特征指纹数据表的构建
被引量:
6
2
作者
王龙
薛华柏
+3 位作者
杨健
王苏珂
苏艳丽
李秀根
《果树学报》
CAS
CSCD
北大核心
2016年第S1期43-51,共9页
【目的】通过鉴定80份梨种质资源SSR指纹数据,构建梨品种指纹图谱数库表,为实现梨种质资源鉴定及新品种DUS测试的可视化和简便化奠定数据基础。【方法】利用荧光标记技术检测SSR位点,并对SSR位点基因数目进行统计,SSR位点排序,并对供试...
【目的】通过鉴定80份梨种质资源SSR指纹数据,构建梨品种指纹图谱数库表,为实现梨种质资源鉴定及新品种DUS测试的可视化和简便化奠定数据基础。【方法】利用荧光标记技术检测SSR位点,并对SSR位点基因数目进行统计,SSR位点排序,并对供试品种进行排序区分和数据标示,构建了80个梨品种的特征指纹数据表。【结果】12对引物中,可利用NH039A、NH007b、NAUpy97a、NB105a、NB141b、NAUpy82r 6对引物区分所有供试品种,可作为区分这80个梨品种的核心引物。【结论】筛选出了区分供试80个梨品种的核心引物,为梨指纹图谱数据库的共建和共享提供了数据基础。
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关键词
梨
分子标记
SSR
品种鉴定
指纹数据表
下载PDF
职称材料
梨品种SSR特征指纹图谱与分子身份证构建
被引量:
12
3
作者
薛华柏
赵瑞娟
+5 位作者
王磊
杨健
王龙
王苏珂
苏艳丽
李秀根
《中国南方果树》
北大核心
2018年第S1期42-49,97,共9页
为了加强对梨种质资源和育成品种的管理,便于对相关材料进行区分鉴定、资源交换以及新品种特异性、一致性和稳定性(DUS)测试,利用筛选的25对SSR核心引物对分别属于沙梨、白梨、新疆梨、西洋梨和秋子梨的共124个梨品种进行扩增,构建梨品...
为了加强对梨种质资源和育成品种的管理,便于对相关材料进行区分鉴定、资源交换以及新品种特异性、一致性和稳定性(DUS)测试,利用筛选的25对SSR核心引物对分别属于沙梨、白梨、新疆梨、西洋梨和秋子梨的共124个梨品种进行扩增,构建梨品种SSR特征指纹数据表,再将各品种在数据表中各SSR位点的基因型数据进行排序和赋值,串联赋值字符生成124个梨品种的SSR分子身份证号码。结果表明,25对引物表现了较强的品种区分能力,仅用其中9对引物(Pb2L5N03978、Pb4L11N0673、Pb2L2N01186、Pb2L11N19979、Pb2LUN24633、Pb2L2N00685、Pb3L8N5448、Pb3L5N1095、Pb3LUN6569)即可区分115份梨品种;但25对引物未能将'张掖长把'和'兰州长把','巍山红雪梨1号'和'巍山红雪梨2号','火把梨''晚熟火把梨'和'祥云火把梨','弥渡小红梨'和'祥云小红梨'等4组共9个品种区分开。利用优选排序的上述9对引物位点及Pb2LUN23926引物位点的基因型数据构建了供试124个梨品种的SSR特征指纹数据表,生成了SSR分子身份证号码。本研究提供了一个在梨品种SSR特征指纹数据表的基础上,对基因型数据进行编号生成梨品种SSR分子身份证号码的新方法。
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关键词
梨
SSR
指纹
图谱
分子身份证
特征
指纹数据表
下载PDF
职称材料
题名
29个梨品种SSR特征指纹数据表的构建
被引量:
19
1
作者
薛华柏
杨健
王龙
王苏珂
张慧蓉
乔玉山
章镇
李秀根
机构
中国农业科学院郑州果树研究所
南京农业大学园艺学院
出处
《果树学报》
CAS
CSCD
北大核心
2015年第6期1028-1035,共8页
基金
现代农业(梨)产业技术体系(CARS-29)
国家高技术研究发展(863)计划(2011AA10020604
2013AA102606-2)
文摘
【目的】为便于果树种质区分鉴定,资源交换、管理和利用,新品种特异性、一致性和稳定性(DUS)测试,以29个梨品种SSR指纹数据作为基础数据,演示了一种二倍体果树品种SSR特征指纹数据表的构建方法。【方法】经过SSR位点基因型数目统计,SSR位点排序,供试品种排序区分和数据标示,表格优化等数据整合处理步骤,构建了29个梨品种SSR特征指纹数据表。【结果】12对SSR引物中,CH04h02和NAUpy65d 2对引物能将供试的29个梨品种全部区分开,可作为鉴定这29个梨品种时的核心引物加以利用。【结论】该方法简便易行,特征指纹数据表数据信息展示全面直观,品种区分关系一目了然,便于交流共享和指纹图谱数据库共建。
关键词
梨
分子标记
SSR
品种鉴定
指纹数据表
Keywords
Pear
Molecular marker
SSR
Cuhivar identification
Fingerprint data table
分类号
S661.2 [农业科学—果树学]
下载PDF
职称材料
题名
80个梨品种SSR特征指纹数据表的构建
被引量:
6
2
作者
王龙
薛华柏
杨健
王苏珂
苏艳丽
李秀根
机构
中国农业科学院郑州果树研究所
出处
《果树学报》
CAS
CSCD
北大核心
2016年第S1期43-51,共9页
基金
现代农业(梨)产业技术体系建设专项(CARS-29)
河南省自然科学基金(162300410150)
文摘
【目的】通过鉴定80份梨种质资源SSR指纹数据,构建梨品种指纹图谱数库表,为实现梨种质资源鉴定及新品种DUS测试的可视化和简便化奠定数据基础。【方法】利用荧光标记技术检测SSR位点,并对SSR位点基因数目进行统计,SSR位点排序,并对供试品种进行排序区分和数据标示,构建了80个梨品种的特征指纹数据表。【结果】12对引物中,可利用NH039A、NH007b、NAUpy97a、NB105a、NB141b、NAUpy82r 6对引物区分所有供试品种,可作为区分这80个梨品种的核心引物。【结论】筛选出了区分供试80个梨品种的核心引物,为梨指纹图谱数据库的共建和共享提供了数据基础。
关键词
梨
分子标记
SSR
品种鉴定
指纹数据表
Keywords
Pear
Molecular marker
SSR
Cultivar identification
Fingerprinting data table
分类号
S661.2 [农业科学—果树学]
下载PDF
职称材料
题名
梨品种SSR特征指纹图谱与分子身份证构建
被引量:
12
3
作者
薛华柏
赵瑞娟
王磊
杨健
王龙
王苏珂
苏艳丽
李秀根
机构
中国农业科学院郑州果树研究所
四川农业大学园艺学院
出处
《中国南方果树》
北大核心
2018年第S1期42-49,97,共9页
基金
国家现代农业(梨)产业技术体系(CARS-28)
中国农业科学院创新工程(CAAS-ASTIP)
+1 种基金
中央级科研院所基本科研业务费专项(1610192017709)
河南省科技攻关项目(172102110244)资助
文摘
为了加强对梨种质资源和育成品种的管理,便于对相关材料进行区分鉴定、资源交换以及新品种特异性、一致性和稳定性(DUS)测试,利用筛选的25对SSR核心引物对分别属于沙梨、白梨、新疆梨、西洋梨和秋子梨的共124个梨品种进行扩增,构建梨品种SSR特征指纹数据表,再将各品种在数据表中各SSR位点的基因型数据进行排序和赋值,串联赋值字符生成124个梨品种的SSR分子身份证号码。结果表明,25对引物表现了较强的品种区分能力,仅用其中9对引物(Pb2L5N03978、Pb4L11N0673、Pb2L2N01186、Pb2L11N19979、Pb2LUN24633、Pb2L2N00685、Pb3L8N5448、Pb3L5N1095、Pb3LUN6569)即可区分115份梨品种;但25对引物未能将'张掖长把'和'兰州长把','巍山红雪梨1号'和'巍山红雪梨2号','火把梨''晚熟火把梨'和'祥云火把梨','弥渡小红梨'和'祥云小红梨'等4组共9个品种区分开。利用优选排序的上述9对引物位点及Pb2LUN23926引物位点的基因型数据构建了供试124个梨品种的SSR特征指纹数据表,生成了SSR分子身份证号码。本研究提供了一个在梨品种SSR特征指纹数据表的基础上,对基因型数据进行编号生成梨品种SSR分子身份证号码的新方法。
关键词
梨
SSR
指纹
图谱
分子身份证
特征
指纹数据表
分类号
S661.2 [农业科学—果树学]
下载PDF
职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
29个梨品种SSR特征指纹数据表的构建
薛华柏
杨健
王龙
王苏珂
张慧蓉
乔玉山
章镇
李秀根
《果树学报》
CAS
CSCD
北大核心
2015
19
下载PDF
职称材料
2
80个梨品种SSR特征指纹数据表的构建
王龙
薛华柏
杨健
王苏珂
苏艳丽
李秀根
《果树学报》
CAS
CSCD
北大核心
2016
6
下载PDF
职称材料
3
梨品种SSR特征指纹图谱与分子身份证构建
薛华柏
赵瑞娟
王磊
杨健
王龙
王苏珂
苏艳丽
李秀根
《中国南方果树》
北大核心
2018
12
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职称材料
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