基于SSR标记的太湖稻区常规粳稻DNA指纹图谱构建及遗传相似性分析

【目的】构建太湖稻区粳稻（Oryza sativa L.Subsp.Japonica）DNA指纹图谱,分析粳稻品种间的遗传相似性,为其育种和种子纯度鉴定提供参考。【方法】以19份太湖地区优质常规粳稻品种为材料,利用分布于水稻12条染色体上的24对SSR引物构建其DNA指纹图谱,并分析其遗传相似性。【结果】24对引物在19份粳稻品种中共检测到99个等位基因,每对SSR引物检测到等位基因1~7个,平均为4.1个。筛选获得能完全区分19份粳稻材料的4对核心引物（RM190、RM18、RM297、RM5414）,其在19份粳稻中可扩增获得22个多态性片段;以RM190和RM18区分鉴别粳稻材料的能力最强,可以区别鉴定6个粳稻品种,RM297和RM5414仅能鉴别2个粳稻品种,RM297能鉴别常农粳5号和宁9103,RM5414能区分南粳47和常粳10-9。19份粳稻品种间的遗传相似系数变幅为0.408~0.857,平均为0.605,遗传相似系数在0.500~0.700的材料占81.87%。UPGMA聚类分析结果显示,在遗传相似系数0.550处,19份粳稻材料可聚为两大类群;在遗传相似系数0.620和0.570处,两大类群均可分为两个亚群。【结论】太湖地区常规粳稻品种遗传背景相似度高,遗传多样性不够丰富,有待进一步加强引进和利用新的基因资源,创新水稻育种材料。

太湖地区水稻育种亲本遗传多样性分析及指纹图谱构建

分析太湖地区粳稻亲本遗传多样性并构建DNA指纹图谱,为加快水稻育种提供理论支持.利用水稻12条染色体上的25对SSR引物对45份太湖地区粳稻亲本进行了遗传多样性分析和DNA指纹图谱构建.结果表明,每对SSR引物可检测到1~24个等位基因,25对引物共检测到198个等位基因.筛选出5对核心引物(RM6318、RM4835、RM5463、RM3155、RM5752)建立了45份粳稻亲本的DNA指纹图谱.45份粳稻亲本间的相似系数在0.5505~0.91414之间,平均为0.7307.UPGMA聚类结果显示,在遗传相似水平0.707处,45份粳稻亲本可分为3个类群.SSR检测结果显示,太湖地区的粳稻亲本亲缘关系较近,遗传基础相似度高,影响了水稻育种的成效.育种工作有待进一步加强优异资源的引进和利用,创新水稻育种材料.

太湖地区10份抗褐飞虱粳稻SSR指纹图谱的构建及遗传相似性分析

本研究利用分布于水稻12条染色体上的12个SSR标记构建了太湖稻区10份抗褐飞虱粳稻的DNA指纹图谱，并对粳稻品种之间的遗传相似性进行了分析，旨在为水稻抗性育种、种子纯度鉴定和新品种知识产权保护方面提供支持。研究结果显示：12对引物共检测到35个等位基因，每对SSR引物检测到等位基因为1~6个，平均为2.8个；筛选出3对核心引物（RM336, RM5414, RM190）并建立了10份抗褐飞虱粳稻的SSR指纹图谱；10份粳稻品种之间的相似系数变幅为0.20~0.91，平均为0.63，遗传相似系数在0.50以上的材料占全部的82.22%。UPGMA聚类结果显示：在遗传相似系数0.55处，10份粳稻材料可以分为2个类群。研究结果表明，太湖地区绝大多数抗褐飞虱粳稻品种遗传相似性高，遗传多样性不够丰富。