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PCR指纹图谱技术在酸奶质量监测中的应用 被引量:7
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作者 李武 赵勇 +2 位作者 王凌华 张晓君 赵立平 《中国乳业》 2006年第4期47-49,共3页
用PCR指纹图谱技术对市售某品牌酸奶进行了短期动态监测,对于收集的3个生产批次的9个酸奶样品,用ERIC(EnterobacterialRepetitiveIntergenicConsensus,肠杆菌基因间保守重复序列)-PCR和PCR-DGGE(DenaturingGradientGelElectrophoresis,... 用PCR指纹图谱技术对市售某品牌酸奶进行了短期动态监测,对于收集的3个生产批次的9个酸奶样品,用ERIC(EnterobacterialRepetitiveIntergenicConsensus,肠杆菌基因间保守重复序列)-PCR和PCR-DGGE(DenaturingGradientGelElectrophoresis,变性梯度凝胶电泳)指纹图谱技术对其菌种组成及其稳定性进行评价。ER-IC-PCR指纹图谱聚类分析结果显示,同一生产批次内3个不同包装的样品ERIC-PCR指纹图谱相似性为90%左右,而不同生产批次样品之间ERIC-PCR指纹图谱相似性有所下降,为82%。该结果进一步用DGGE指纹图谱进行证实。DGGE分析结果表明,G2样品明显缺少一条主带,经割胶回收测序发现,这条主带代表的微生物是Lacto-bacillusdelbrueckiisubsp.Bulgaricus,说明该产品不同生产批次间的稳定性不是很好。DGGE图谱和测序结果还显示,除G2样品外,该酸奶样品的菌种组成与产品标签说明是一致的。 展开更多
关键词 酸奶 ERIC(Enterobacterial REPETITIVE INTERGENIC Consensus 肠杆菌基因间保守重复序列)-PCR DGGE(Denaturing Gradient Gel Electrophoresis 变性梯度凝胶电泳)指纹图谱
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基于海量存储云调度机制的云网络数据存储算法 被引量:7
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作者 钱伟强 《国外电子测量技术》 2017年第3期27-30,共4页
针对当前云网络超宽带存储难以实现流量的分流,且存储过程中存在严重的存储效率低下及存储时延过高等问题,提出了一种基于海量存储云调度机制的云网络数据超带宽存储算法。采用周期调度及梯度优化方式,且综合考虑数据存储中使用强度,最... 针对当前云网络超宽带存储难以实现流量的分流,且存储过程中存在严重的存储效率低下及存储时延过高等问题,提出了一种基于海量存储云调度机制的云网络数据超带宽存储算法。采用周期调度及梯度优化方式,且综合考虑数据存储中使用强度,最小传输粒度等数字特征,对数据存储过程中的指纹梯度进行优化,且将该梯度引入到数据传输过程中,成功地实现了数据的流量分离,提高了数据存储效率。仿真实验表明,与当前广泛使用的超线性存储调度算法(super linear memory scheduling algorithm,SLMS)相比,本文算法的存储效率更高,能够在流量分离的前提下显著降低存储时延。 展开更多
关键词 云网络 超带宽存储 周期调度 指纹梯度 数据粒度 流量分离
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一种快速的酸奶质量跟踪监测检验新方法 被引量:1
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作者 李武 王凌华 +3 位作者 张晓君 庞小燕 赵立平 赵勇 《中国乳业》 2005年第9期44-47,共4页
分析酸奶中的菌种组成是酸奶质量控制的重要指标。本文用PCR-DGGE(denaturinggra-dientgelelectrophoresis,变性梯度凝胶电泳)指纹图谱技术对市售某品牌酸奶在1个月内进行了动态监测,共收集了6个生产批次的18个酸奶样品,通过建立16SrDN... 分析酸奶中的菌种组成是酸奶质量控制的重要指标。本文用PCR-DGGE(denaturinggra-dientgelelectrophoresis,变性梯度凝胶电泳)指纹图谱技术对市售某品牌酸奶在1个月内进行了动态监测,共收集了6个生产批次的18个酸奶样品,通过建立16SrDNAV3区PCR-DGGE分析、DGGE图谱条带割胶回收测序等一套完整的检测评价方法,结合常规分离培养方法,对样品微生物组成及其稳定性进行跟踪监测。结果显示,所有供试样品在整个动态监测期内DGGE指纹图谱都出现2条带,显示其微生物组成比较稳定,割胶回收测序结果表明其微生物组成与厂家标注完全一致,分别为Lacto-bacillusdelbrueckiisubsp.bulgaricus(保加利亚乳杆菌)和Streptococcusthermophilus(嗜热链球菌)。分离计数结果表明前者比后者低3个数量级,二者的DGGE条带亮度也有显著差别。本研究用菌种组成及其稳定性两个指标对酸奶样品质量进行评价,建立了DGGE评价方法,结果表明,该技术可以作为酸奶质量控制和动态监测的快速简便的新方法。 展开更多
关键词 酸奶 DGGE(denaturing gradient gel electrophoresis 变性梯度凝胶电泳)指纹图谱 分离培养 质量控制 跟踪监测 LACTOBACILLUS 指纹图谱技术
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Spatial heterogeneity in a deep artificial lake plankton community revealed by PCR-DGGE fingerprinting 被引量:8
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作者 李强 赵越 +4 位作者 张旭 魏雨泉 邱琳琳 魏自民 李富恒 《Chinese Journal of Oceanology and Limnology》 SCIE CAS CSCD 2015年第3期624-635,共12页
To explore the spatial heterogeneity of plankton communities in a deep artificial lake (Songhua Lake, China), samples were collected at seven sites. Samples were investigated by denaturing gradient gel electrophores... To explore the spatial heterogeneity of plankton communities in a deep artificial lake (Songhua Lake, China), samples were collected at seven sites. Samples were investigated by denaturing gradient gel electrophoresis (DGGE) analysis of the PCR-amplified 16S and 18S rRNA genes and specific bands were sequenced. Cluster analysis of the DGGE profiles revealed that all of the samples grouped into two distinct clusters, in accordance with sampling site; while in each cluster, the divergence of sub-clusters correlated with sampling depth. Sequence analysis of selected dominant DGGE bands revealed that most sequenced phylotypes (84%) exhibited 〉97% similarity to the closest sequences in GenBank, and were affiliated with ten common freshwater plankton phyla (Proteobacteria, Actinobacteria, Bacteroidetes, Cyanobacteria, Bacillariophyta, Pyrrophyta, Cryptophyta, Ciliophora, Stramenopiles, and Rotifera). Several of these groups are also found worldwide, indicating the cosmopolitan distribution of the phylotypes. The relationships between DGGE patterns and environmental factors were analyzed by redundancy analysis (RDA). The results suggested that, total nitrogen, nitrate, nitrite, temperature were strongly correlated with the variation ammonia, and CODMn concentrations, and water in plankton composition. 展开更多
关键词 Songhua Lake plankton community composition denaturing gradient gel electrophorcsis (DGGE) artificial lake redundancy analysis
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