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水稻株高QTL定位及精确性分析
被引量:
13
1
作者
张志勇
黄育民
+2 位作者
张凯
王侯聪
江良荣
《厦门大学学报(自然科学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2008年第1期116-121,共6页
分别应用具有127和131个标记位点的“广佳”(广陆矮4号×佳辐占)和“明佳”(明恢86×佳辐占)重组自交系群体,利用复合区间作图法(CIM)对水稻株高数量性状位点(QTL)进行检测和效应分析.为保证QTL定位精确性,采用排列试...
分别应用具有127和131个标记位点的“广佳”(广陆矮4号×佳辐占)和“明佳”(明恢86×佳辐占)重组自交系群体,利用复合区间作图法(CIM)对水稻株高数量性状位点(QTL)进行检测和效应分析.为保证QTL定位精确性,采用排列试验法确定每一群体的LOD阀值.结果显示:排列测验法是一个十分有效的阀值推断统计方法,两个群体LOD阀值分别为2.8和2.7.“广佳”群体共检测到5个加性QTL,位于第1、6、7、8和11染色体的5个区间,单位点贡献率在5.31%-48.35%之间;“明佳”群体共检测到4个加性QTL,位于第3、5、9和12染色体的4个区间,单位点贡献率在7.56%-11.50%之间.同时利用混合线性模型复合区间作图法(MCIM)在两群体各检测到1对上位性QTL.作者从实验设计和数据分析方面对QTL定位精确性进行了讨论,为今后数量性状遗传研究提供有益借鉴.
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关键词
水稻
株高
数量性状位点
排列试验法
定位精确性
下载PDF
职称材料
题名
水稻株高QTL定位及精确性分析
被引量:
13
1
作者
张志勇
黄育民
张凯
王侯聪
江良荣
机构
厦门大学生命科学学院
出处
《厦门大学学报(自然科学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2008年第1期116-121,共6页
基金
国家“863”项目(2002AA211091)
厦门大学科技创新项目(XDKJCX20063004)资助
文摘
分别应用具有127和131个标记位点的“广佳”(广陆矮4号×佳辐占)和“明佳”(明恢86×佳辐占)重组自交系群体,利用复合区间作图法(CIM)对水稻株高数量性状位点(QTL)进行检测和效应分析.为保证QTL定位精确性,采用排列试验法确定每一群体的LOD阀值.结果显示:排列测验法是一个十分有效的阀值推断统计方法,两个群体LOD阀值分别为2.8和2.7.“广佳”群体共检测到5个加性QTL,位于第1、6、7、8和11染色体的5个区间,单位点贡献率在5.31%-48.35%之间;“明佳”群体共检测到4个加性QTL,位于第3、5、9和12染色体的4个区间,单位点贡献率在7.56%-11.50%之间.同时利用混合线性模型复合区间作图法(MCIM)在两群体各检测到1对上位性QTL.作者从实验设计和数据分析方面对QTL定位精确性进行了讨论,为今后数量性状遗传研究提供有益借鉴.
关键词
水稻
株高
数量性状位点
排列试验法
定位精确性
Keywords
rice(Oryza sativa L.)
plant height(PH)
quantitative trait locus(QTL)
permutation test
QTL mapping
分类号
S511 [农业科学—作物学]
下载PDF
职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
水稻株高QTL定位及精确性分析
张志勇
黄育民
张凯
王侯聪
江良荣
《厦门大学学报(自然科学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2008
13
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