30个插入/缺失多态性位点在中国广东汉族人群中的遗传多态性

【目的】调查Investigator DIPplex体系包含的30个插入/缺失多态性(Indel)位点在中国广东汉族人群中的群体遗传学数据,评估其法医学应用价值。【方法】采集300名广东汉族无关个体(150名男性,150名女性)外周血样,提取样本DNA,采用Investigator DIPplex体系对HLD77等30个Indel位点进行复合扩增,阵列毛细管电泳进行扩增产物分离,GeneMapper ID-X v1.2软件进行基因分型,使用相关统计软件计算常用法医学参数并进行Hardy-Weinberg平衡及位点间连锁不平衡的检验。【结果】30个Indel位点在广东汉族人群中均符合Hardy-Weinberg平衡(P>0.05),经Bonferroni法校正后不存在连锁不平衡现象。各位点平均杂合度(Ho)为0.406,平均个体识别力(DP)为0.549,平均多态信息含量(PIC)为0.320,累积个体识别率(TDP)为0.999 999 999 98。30个Indel位点的三联体累积非父排除率(CPEtri)为0.994 748,二联体累积非父排除率(CPEduo)为0.942 342。【结论】InvestigatorDIPplex试剂盒中包含的30个Indel位点在广东汉族人群中具有良好的遗传多态性,可独立用于法医实践中的个体识别,在STR存在突变等特殊亲子鉴定案件中也可作为有效的补充检测体系。

插入缺失位点和miniSTR在甲醛固定石蜡包埋组织中的应用检测

目的:研究插入缺失位点InDel与mini短串联重复序列(STR)遗传标记对甲醛固定石蜡包埋组织应用的价值。方法:19份甲醛固定石蜡包埋组织作为疑难检材,应用3种常染色体遗传标记多重扩增系统,即InDel系统(Investigatior■DIPplex Kit)、miniSTR系统(华夏白金扩增试剂盒)和STR系统(Goldeneye®20A),对STR分型不完整或失败的检材,再分别用InDel和miniSTR系统进行DNA分型检测,比较两者的分型质量和检出率。结果:19份甲醛固定石蜡包埋组织经Goldeneye 20A试剂盒检测,均分型不完整。应用miniSTR系统检测显示,7份样本的检出率100%,其中,D19S433基因座的检出率为100%,D5S818、D13S817和D1S1656基因座的检出率最小,为36.84%。应用InDel系统检测发现,1份样本InDel位点电泳分型完整,所有样本的位点丢失率均小于50%,其中7份样本的位点丢失率低至10%以下。结论:应用遗传标记对甲醛固定石蜡包埋组织这类疑难降解检材进行检测,插入缺失多态性位点InDel与miniSTR可以作为联合检测标记。

贵州仡佬族和苗族人群30个插入/缺失位点遗传多态性分析

目的调查贵州仡佬族和苗族人群30个插入/缺失(InDel)位点的遗传多态性,并评估其在法医学中的应用价值。方法用Investigator~? DIPplex试剂盒分别对贵州220例仡佬族和207例苗族无关个体外周血样进行30个InDel分型检测,统计分析各位点的频率数据、群体遗传学参数,并与其他地区人群已有数据进行比较。结果 30个InDel位点经Bonferroni校正,其基因型分布在贵州仡佬族和苗族群体均符合Hardy-Weinberg平衡,且不存在连锁不平衡现象;各位点在贵州仡佬族和苗族人群中的累积个体识别率分别为0.999 999 999 34和0.999 999 996 86,三联体累积非父排除率均≥0.995 6;30个InDel位点在贵州仡佬族和苗族中均有4个位点的期望杂合度<0.3。通过Genepop 4.2软件计算F_(st)值,除D111(0.137 5)和D118(0.091 1)外,其余位点均小于0.06。从Nei′s DA遗传距离矩阵分析发现,贵州仡佬族与成都汉族的遗传距离最小(0.001 0),贵州苗族与新疆哈萨克族的遗传距离最大(0.026 4)。结论 Investigator■ DIPplex试剂盒中包含的30个InDel位点在贵州仡佬族和苗族人群中具有较好的遗传多态性,可作为个体识别等特殊检案有效的补充体系。

陕西汉族35个插入/缺失位点的多态性与遗传结构分析

目的分型并评估35个插入/缺失多态性(DIP)位点在陕西汉族中的多态性及法医学应用效能,并探索陕西汉族的群体遗传结构。方法收集来自陕西地区汉族305名无关健康个体血样,基于课题组前期甄选并构建的包含35个DIP位点的复合扩增体系进行检测和分型,并计算35个DIP位点的等位基因频率和法医学参数。通过分子方差分析、系统发育树的构建、多维尺度分析、主成分分析和遗传结构分析,进一步探索陕西汉族与29个参考群体之间的群体遗传关系。结果35个DIP位点在陕西汉族中累积的个体识别率和非父排除率值分别为0.999999999999991119和0.9991。群体遗传学分析结果显示陕西汉族与我国不同地区的汉族群体遗传关系更近。结论35个DIP位点在陕西汉族的多态性较高,可应用于法医学个体识别,也为陕西汉族的群体遗传学研究提供了基础数据。

云南傣族、汉族HLA-G基因14bp插入/缺失多态性研究

14bp插入/缺失多态性是指存在于HLA-G基因第8外显子3′非翻译区(3′UTR)的一个插入/缺失多态,因其能影响HLA-GmRNA的稳定性,并进一步影响HLA-G蛋白的翻译而受到广泛关注。文章采用PCR和电泳技术对云南傣族和汉族两个人群进行了HLA-G基因14bp插入/缺失多态性的检测分析,结果显示傣族和汉族人群+14bp等位基因频率分别为31.97%和40.87%,+14bp/+14bp基因型频率分别为8.20%和17.31%,+14bp/-14bp基因型频率分别为47.54%和47.11%。与国内外已报道的其他人群的数据比较表明:云南汉族群体中HLA-G基因14bp插入/缺失的分布与其他群体相似;傣族则有自己独特的基因型和等位基因分布特点,推测其可能受到了遗传漂变的作用,但不排除自然选择作用的影响。

血管紧张素转换酶基因插入/缺失多态性与盐敏感性高血压病发生的关系

目的：研究血管紧张素转换酶（ＡＣＥ）基因插入／缺失多态性与盐敏感性高血压病发生的关系。方法：用ＡＣＥ基因第１６内含子多态性两侧的序列设计引物，用多聚酶链反应来检测８０例高血压病患者（其中盐敏感性高血压病患者５０例，盐不敏感性高血压病患者３０例）和９０例正常人ＡＣＥ基因插入／缺失多态性。结果：Ｄ及Ｉ型等位基因频率在高血压病患者与正常对照组之间无差异，Ｄ及Ｉ型等位基因频率在盐敏感性高血压病患者与盐不敏感性高血压病患者之间也无差异。结论：ＡＣＥ基因插入／缺失多态性与中国人高血压病以及与盐敏感性之间无相关关系。

ACE基因插入/缺失多态性与妊娠期高血压疾病发病关系的Meta分析

目的:探讨不同人群中血管紧张素I转换酶(ACE)基因插入(I)/缺失(D)多态性与妊娠期高血压疾病发病的关系。方法:检索Pub Med、Cochrane、清华同方、重庆维普,时间从该数据库建立至2016年10月1日。全面收集有关妊娠期高血压疾病发病与ACE I/D基因多态性相关的研究文献,制定文献纳入及排除标准。应用Revman 5.1软件进行Meta分析,计数资料采用优势比(OR)及其95%CI表示。结果:纳入63篇符合条件的研究文献,其中42篇是对亚洲人群的研究,20篇是对欧洲人群的研究,1篇是非洲人群的研究,共纳入妊娠期高血压疾病患者12030例(病例组),健康正常人群14090例(对照组)。Meta分析结果显示,在总体人群、亚洲人群和欧洲人群中,D等位基因、DD基因型以及II基因型在病例组和对照组分布的差异性,D等位基因OR分别为1.42、1.47、1.34,P<0.00001、P=0.0004、P<0.0001;DD基因型OR分别为1.62、1.67、1.56,P<0.00001、P=0.0007、P<0.00001;II基因型OR分别为0.72、0.68、0.81,P=0.0003、P=0.002、P=0.10。结论:ACE D等位基因和DD基因型同妊娠期高血压疾病发病关系密切。在总体人群和亚洲人群中,II基因型是妊娠期高血压疾病发病的一种保护性因素;而欧洲人群未发现有关系。

血管紧张素转换酶基因插入/缺失多态性与维吾尔族人群高血压病的关系

目的探讨血管紧张素转换酶基因的插入/缺失多态性与新疆维吾尔族人群高血压病之间的关系。方法应用聚合酶链反应对361例维吾尔族高血压病患者和400例正常血压者的血管紧张素转换酶基因16内含子插入/缺失多态性进行检测,测定血清总胆固醇、甘油三酯、血糖和总胆红素等生物化学指标,Logistic回归分析各基因型和等位基因频率与新疆维吾尔族原发性高血压的关系。结果将维吾尔族人群用Logistic回归模型校正年龄、性别、肥胖指数、腰围、臀围、盐摄入量、血糖、甘油三酯及总胆固醇之后,血管紧张素转换酶基因插入/缺失多态性与高血压病的发生相关,偏回归系数β值为0.246(P=0.0302),携带突变型纯合子DD个体患高血压的风险为II基因型的1.51倍(P=0.038)。结论血管紧张素转换酶基因插入/缺失多态性与新疆维吾尔族人群高血压发病相关,DD基因型可能是维吾尔族人群高血压发病的风险因子。

国人ACE基因插入/缺失多态性与冠心病关联性Meta分析

目的:对国人血管紧张素1转换酶(ACE)基因内含子16插入(I)/缺失(D)多态性与冠心病的关联性进行Meta分析。方法:以冠心病组和健康对照组基因型分布的OR值为统计量,全面检索到相关文献并剔除不符合要求的文献,排除发表偏倚的影响。应用REVMAN3.1软件对各研究结果进行一致性检验和采用相应的数学模型进行数据合并。结果:冠心病组631例,健康对照组505例,数据合并结果DD/(ID+II)OR(95％可信区间)为2.72(2.08,3.55),P<0.01。结论:国人ACE/ID多态性的DD基因型与冠心病危险性增加有关联。

血管紧张素转移酶基因插入/缺失多态性与胃癌的相关性

目的探讨血管紧张素转移酶(ACE)基因插入(I)/缺失(D)多态性与胃癌的相关性。方法采用聚合酶链反应(PCR)法检测181例胃癌组和198例健康对照组ACE基因I/D多态性。结果胃癌组与对照组ACE I/D基因型和等位基因分布差异不显著(P>0.05)。根据临床特征进行亚组分析,发现低分化胃癌患者中DD基因型频率明显高于高中分化(P=0.002);有转移的胃癌患者中DD基因型频率明显高于未转移(P=0.012)。结论 ACE基因I/D多态性与胃癌的分化程度和转移状态等影响胃癌预后的临床病理特征密切相关。

用熔解曲线法分析插入/缺失多态性和Y染色体SNPs多态性

随着单核苷酸多态性SNPs (SingleNucleotidePolymorphisms)及插入 /缺失多态性Indels (Insertion/Dele tion)的分型技术研究的深入 ,SNPs和Indels在法医学上的应用将受到深刻的影响。本文研究和探讨Indels的分型方法 ,通过测定扩增DNA片段在溶液中的溶解曲线图确定每个样品的基因型 ,称为溶解曲线Indels基因分型方法(McI/D)。溶解曲线图由被测样品DNA片段的特殊溶解温度组成 ,扩增结果直接由仪器分析不需要繁杂的PCR后期操作。

血管紧张素转换酶基因插入/缺失多态性在人群中的分布

目的 :了解血管紧张素转换酶基因插入 /缺失 (I/D)多态性在人群中的分布特征。 方法 :应用聚合酶链反应方法对 163 6名开滦矿务局职工进行血管紧张素转换酶基因型检测 ,并分析比较。 结果 :被检人群血管紧张素转换酶基因I/D基因型频率分布II 3 8 9%、ID 40 1%、DD 2 1 0 % ,老年人群中为43 7%、 3 8 8%、 17 5 %。DD基因型频率及D等位基因频率在高龄人群中有下降的趋势 (P <0 0 0 1) ,在不同性别间无差异 (P >0 0 5 )。 结论 :老年人群DD基因型频率降低 ,提示DD基因型可能是人群中早期死亡危险增加的一个预测因素。

血管紧张素Ⅰ转换酶基因插入/缺失多态性与2型糖尿病肾病关系的系统评价

目的探讨血管紧张素Ⅰ转换酶（ACE）基因插入/缺失（I/D）多态性与2型糖尿病肾病（T2DN）的关系。方法检索Pub Med、Google Scholar数据库以及外文医学信息资源检索平台（FMRS）_2016年3月20日前相关文献,用Review Manager5.0以及Stata12.0软件对所纳入研究数据进行统计分析,以合并OR值及相应95%置信区间（95%CI）评估ACE基因I/D多态性与T2DN的关系。结果共39篇文献纳入本研究,包含研究对象18 996例,其中T2DN患者8 131例,2型糖尿病（T2DM）无DN者10 865例。与ACE基因I/D多态性D等位基因相比,I等位基因可显著降低T2DM患者继发DN的风险,其整体合并效应的OR值及相应95%CI分别为0.72、0.64~0.80。在显性和隐性遗传模型下,总体相对发病风险的OR分别为1.22（95%CI为1.08~1.37）和1.15（95%CI为1.02~1.29）。ACE基因I/D多态性与亚洲人群T2DN发病风险显著相关,在显性和隐性遗传模型下相对发病风险的OR分别为1.31（95%CI为1.12~1.53）和1.22（95%CI为1.03~1.46）,而ACE基因I/D多态性与白种人T2DN发病风险无明显相关。结论 ACE基因I/D多态性与T2DN关系密切,存在I等位基因的T2DM患者继发DN的风险低。ACE基因I/D多态性与亚洲人群T2DN发病风险显著相关,与白种人T2DN发病风险无关。

血管紧张素转换酶基因插入/缺失多态性与中国汉族人脑梗死关系的Meta分析

目的 系统评价中国汉族人血管紧张素转换酶 (ACE)基因插入/缺失 (D/I)多态性与脑梗死的关联性。方法 联合运用3种有效文献检索途径 ,全面检索ACE基因插入/缺失多态性与脑梗死病例对照研究的相关文献 ,剔除不符合要求文献 ,9个相关研究被用于Meta分析。各研究间存在异质性 ,故采用随机效应模型进行数据合并 ,以脑梗死组和对照组基因型分布的比数比(OR)为统计量。结果 共2066例脑梗死和对照者被用于Meta分析 ,数据合并后ACEDD基因型与ID +II基因型的OR为1.58,95 %可信区间为1.04～2.41。 结论 中国汉族人ACE基因缺失型是脑梗死的危险因素。

CDH1基因Exon1非编码区插入/缺失多态性与膀胱移行细胞癌易感性的关系

目的:探讨上皮钙粘素(E-cadherin,CDH1)基因Exon1非编码区234bp位点插入/缺失多态性与膀胱移行细胞癌(TCCB)生物学行为之间的关系。方法:从TCCB组180例,对照组健康人110例的血液中提取人基因组DNA,PCR获取包含CDH1基因启动子近侧序列-160位点和Exon1的DNA片段,DNA测序方法测得上述DNA片断的基因序列。选择χ2检验进行统计学分析,Woolf法计算OR值(odd sratio,OR)和95%CI。结果:CDH1基因Exon1非编码区234bp位点插入片断碱基序列为5'-CCGTGCCCCAGCC-3',其插入/缺失多态性基因型分为插入\插入纯合子(I/I)、缺失\缺失纯合子(D/D)和插入\重复插入杂合子(I/2I)三种。TCCB组该位点I/2I基因型频率(0.54)高于对照组(0.35)(P<0.01),提示I/2I基因型患TCCB风险较高(OR=2.15,95%CI1.32～3.52)。结论:CDH1基因Exon1非编码区234bp位点2I等位基因频率与膀胱移行细胞癌的发生密切相关。-160A/A-234I/2I基因型与膀胱移行细胞癌的发生密切相关。

PPP1R3基因3′非翻译区5bp缺失/插入多态性与安徽汉族人2型糖尿病相关性研究

目的 研究 1型蛋白磷酸酶骨骼肌特异糖原靶向调节亚单位 (PPP1R3)基因 3′ UTR 5bpD/I多态性与 2型糖尿病 (T2DM )及其中间表型的相关性。方法 选取安徽省合肥地区汉族T2DM患者 16 0例 ,健康成人 10 6例 ,运用聚合酶链反应片段长度多态性技术进行基因型测定。结果 ①PPP1R3基因 3′ UTR 5bpD/I多态性的基因型及等位基因频率在T2DM与健康对照组间分布差异没有显著性 (P >0 0 5 ) ;②不同基因型组间空腹血糖、血压、空腹胰岛素、胰岛素敏感指数、体重指数、腰臀围比差异均无显著性 ,糖尿病组中基因型D/D的餐后 2h血糖显著低于基因型D/I、I/I(P=0 0 32 )。结论 PPP1R3基因 3′ UTR 5bpD/I多态性与安徽汉人

血管紧张素转换酶基因插入/缺失多态性与康巴藏族心功能的关系研究

目的研究血管紧张素转换酶（angiotensin converting enzyme，ACE）基因的插入／缺失（insertion／deletion，I／D）多态性与康巴藏族心功能的关系，以探讨康巴藏族是否具有优于其他地区藏族的遗传素质及体能。方法将昌都地区的类乌齐和芒康两个县小学随机抽取的119名11～12岁儿童作为实验组，日喀则地区的白朗县和山南地区的曲松县抽取112名同年龄儿童作为对照组。应用聚合酶链反应（PCR）对ACE基冈16内含子I／D（rsl799752）多态性进行检测；超声心动图测量左心室每搏输出量、射血分数、心排出量等心功能指标；采用SPSS16．0软件进行统计分析。结果男生组心排出量、每搏输出量等心功能指标实验组高于对照组、心牢对照组高于实验组；女生组心排出量、每搏输出量、射血分数实验组均高于对照组。以上差异P值均小于0．05，有统计学意义。对照组ACE基因I／D多态性位点DD、ID、11基冈型频率分布符合Hardy—Weinberg平衡；实验组与对照组的基因型频率和等位基因频率均没有统计学意义。II型个体每搏输出量、射血分数实验组均高于对照组；收缩压、心率对照组高于实验组；DD型个体每搏输出量实验组高于对照组；ID型个体其心排出量、每搏输出量、射血分数实验组均高于对照组，心率对照组高于实验组；以上差异均具有统计学意义。结论说明实验组康巴藏族的心功能在高原环境下强于对照组；但是该差异与ACE基因I／D多态性无关。

ACE插入/缺失多态性与神经胶质瘤关系研究

目的探讨血管紧张素转移酶基因(ACE)插入(I)或缺失(D)多态性与神经胶质瘤的相关性。方法采用聚合酶链(PCR)反应方法检测152例神经胶质瘤患者和199例健康对照组ACE I/D多态性。结果与缺失纯合型(DD)基因型相比,杂合子ID基因型显著增加了神经胶质瘤的发病风险(P=0.038);根据性别和病理分级进行亚组分析,未发现ACE I/D多态性在性别和不同病理分级中存在明显差异(P>0.05)。结论 ACE I/D多态性与神经胶质瘤的发病具有相关性。

新生儿重症监护病房早产儿血管紧张素转化酶水平变化及其与基因插入/缺失多态性的关系

目的检测新生儿重症监护病房早产儿血管紧张素转化酶(ACE)基因型、血清ACE水平在出生1周内的变化,探讨ACE基因插入/缺失多态性与血清ACE水平和病情变化的关系。方法早产儿85例,出生第3天取其末梢血提取DNA,确定ACE基因型,出生第1、3、7天分别采用紫外分光光度计法检测早产儿血清ACE水平,并进行危重病例评分。结果早产儿85例中,DD基因型19例,ID基因型34例,Ⅱ基因型32例。出生第1天DD基因型早产儿血清ACE水平[(33.42±7.93)U/L]显著高于Ⅱ基因型早产儿[(25.97±8.32)U/L](P<0.01),高于ID基因型早产儿[(31.53±7.56)U/L],但差异无统计学意义(P>0.05);ID基因型早产儿血清ACE水平显著高于Ⅱ基因型(P<0.01);在出生第3天和第7天,3种基因型早产儿血清ACE水平均逐渐下降,DD基因型早产儿高于ID基因型,二者显著高于Ⅱ基因型。出生第1天DD基因型的危重病评分[(87.37±8.30)分]低于ID基因型[(95.82±5.85)分]和Ⅱ基因型[(95.88±6.85)分],差异非常显著(Pa<0.01),ID和Ⅱ基因型间无差异;出生第3天,DD基因型的危重病评分[(92.95±7.10)分]显著低于ID基因型[(96.94±5.85)分],而与Ⅱ基因型[(96.44±6.87)分]无差异,ID和Ⅱ基因型间亦无差异;出生第7天,3种基因型间危重病评分均无差异。结论重症疾病时DD基因型携带者的病情相对重,血清ACE水平相对高,虽然疾病可能影响血清ACE水平,但是决定ACE水平的根本因素是个体间基因型的差异。