引物延伸预扩增用于胚胎种植前诊断的实验研究

目的 用引物延伸预扩增 (PEP)方法对种植前胚胎进行单基因病诊断的实验研究。方法 取IVF后剩余胚胎的一个卵裂球用PEP方法 ,扩增SRY、ZP3 、RhCE、RhD和FVIII 5个基因 ,而同一胚胎的另一个卵裂球双重套式PCR扩增SRY和ZP3 基因。结果 PEP分析分别由 6个胚胎获得的 6个卵裂球 ,1- 4号胚胎有 19个基因呈阳性 (19/ 2 0 ) ,1个基因阴性 ,5 ,6号胚胎除SRY均阴性 ,其余基因为阳性 ;而 6个胚胎的卵裂球双重套式PCR扩增SRY和ZP3 基因的结果与同一胚胎PEP的结果相同。结论 采用PEP方法进行种植前胚胎单基因病的诊断是可靠、准确的 ,且可用于无创性产前诊断。

应用引物延伸预扩增反应技术检测孕妇血浆中的胎儿DNA

目的 :建立一种检测孕妇血浆中胎儿DNA的新方法。方法 :对 6 5例 5～ 41孕周的孕妇血浆中胎儿DNA采用引物延伸预扩增 (PEP)后行特异性位点聚合酶链反应 (PCR)扩增 ,并用探针微孔板杂交法检测PCR产物。扩增的基因为Y染色体短臂SRY基因 ,扩增片段的大小分别为 35 1bp和 2 5 4bp。 结果 :46例妊娠男性胎儿的孕妇中 41例血浆中出现SRY基因扩增带 ,检出率 89.13 % ;19例妊娠女性胎儿的孕妇中 3例 (15 .79% )为假阳性。本研究孕早、中、晚期的性别符合率分别为 10 0 %、90 .91%、75 % ,总符合率 86 .15 %。结论 :利用PEP法能解决孕妇外周血中胎儿细胞数量太少达不到常规扩增条件所要求的最低模板量的问题 ,同时配合探针微孔板杂交法能使诊断结果更准确。

单细胞扩增前引物延伸多基因位点检测研究

目的 :考察单细胞扩增前引物延伸 (PEP)全基因组扩增 ,后续巢式 PCR同步检测β地中海贫血突变基因 CD17、nt- 2 8及连锁基因 (ATTTT)、18和 2 1号染色体短串联重复序列 D18S5 1、D2 1S11和 D2 1S14 11、囊性纤维病 CFΔ F5 0 8及连锁基因 (GATT)、杜氏肌营养不良症 DMD基因外显子 17和 4 8以及 Y染色体性别决定基因 SRY的可行性。方法 :显微操作获取单个淋巴细胞和胚胎细胞 ,PEP全基因组扩增 ,后续特异性巢式 PCR,检测上述 10个基因位点的单细胞扩增成功率、假阳性率、假阴性率。结果 :上述 10个位点的单个淋巴细胞扩增成功率、假阳性率和假阴性率分别为 89.5 %、0 .4 8%和 2 .5 0 % ,单个胚胎细胞扩增成功率和假阳性率分别为 85 .5 6 %和 3.0 %。结论 :单细胞 PEP后续巢式 PCR同步检测上述 10个基因位点有较高的扩增成功率和很低的假阳性率和假阴性率 ,具有应用于植入前遗传学诊断的实际可行性。

全基因组扩增在DMD植入前遗传学诊断中的可行性研究

目的:建立单细胞扩增前引物延伸法及巢式PCR技术,研究该技术在杜氏肌营养不良症植入前遗传学诊断中的可行性。方法:获取单个正常男女淋巴细胞和无杜氏肌营养不良(DMD)家族史的单个卵裂球,15碱基随机引物PEP扩增单细胞全基因组,再以巢式PCR技术检测PEP反应产物中DMD基因外显子8,17,19,44,45,48及Y染色体上的睾丸决定基因SRY。结果:单个淋巴细胞和单个卵裂球的6个DMD外显子扩增成功率分别为97.2％(175/180)和100％(60/60),单个男性淋巴细胞SRY的扩增成功率为100％(15/15),而单个女性淋巴细胞无SRY的扩增(0/15)。结论:检测单细胞DMD基因外显子8,17,19,44,45,48和SRY的PEP-巢式PCR技术具有较高扩增成功率和特异性,可望应用于 DMD的植入前遗传学诊断的单细胞基因诊断中。

两步温控法 DNA 体外扩增

DNA体外扩增,又称聚合酶链反应(Polymerase Chain Reaction,PCR),是近年来发展起来的一种体外扩增特异DNA顺序的新技术,已广泛应用于遗传性疾病、传染性疾病的早期诊断和癌基因、抗癌基因、法医学等研究领域。目前,国外不少学者使PCR技术不断改进且更加成熟,但操作方法匀采用的是三步温控法,即在95℃使DNA解链,在37℃或55℃持异性引物与模板DNA退火,在37℃或72℃引物延伸。

PCR方法对单细胞SRY基因扩增效率的对比研究

目的探讨单细胞基因扩增时,巢式PCR和引物预扩增(PEP)-巢式PCR两种扩增方法对SRY基因脱扣的影响程度;并应用PEP-巢式PCR方法对单个卵裂球细胞进行SRY基因诊断。方法获取单个正常男女淋巴细胞,随机分为巢式PCR组和PEP-巢式PCR组。同时扩增SRY基因和ZP3基因位点。选用IVF-ET后冻存的4个胚胎,处理后获取单个卵裂球11个,用PEP-巢式PCR扩增,鉴定其性别。结果单个淋巴细胞经巢式PCR和PEP-巢式PCR方法扩增后,其基因扩增成功率分别为92.39%,98.91%;性别诊断正确率分别为86.00%,98.00%;SRY基因的脱扣率分别为16.67%,2.38%。两者有统计学检验均有显著性差异(P<0.05。对单个卵裂球应用PEP-巢式PCR方法进行SRY基因和ZP3基因扩增后,有3个胚胎的8个卵裂球被诊断为男性,而另外1个胚胎的3个卵裂球被诊断为女性。结论1.行单细胞基因扩增时,PCR扩增方法会影响等位基因脱扣的发生率。2.对性连锁遗传病进行植入前遗传学诊断时,采用PEP-巢式PCR方法扩增SRY基因和ZP3基因对单个细胞对进行性别鉴定时,可以有效地降低SRY基因脱扣的发生率,提高性别诊断的特异性和敏感性,能够用于单细胞的性别诊断,可用于性连锁遗传病的植入前遗传学诊断。

重叠延伸PCR技术及其在基因工程上的应用

重叠延伸PCR技术(genesplicingbyoverlapextensionPCR,简称SOEPCR)由于采用具有互补末端的引物,使PCR产物形成了重叠链,从而在随后的扩增反应中通过重叠链的延伸,将不同来源的扩增片段重叠拼接起来。此技术利用PCR技术能够在体外进行有效的基因重组,而且不需要内切酶消化和连接酶处理,可利用这一技术很快获得其它依靠限制性内切酶消化的方法难以得到的产物。重叠延伸PCR技术成功的关键是重叠互补引物的设计。重叠延伸PCR在基因的定点突变、融合基因的构建、长片段基因的合成、基因敲除以及目的基因的扩增等方面有其广泛而独特的应用。本文综述了重叠延伸PCR的原理和目前的应用情况,并指出了此技术中的注意事项,展望了其应用前景。

单细胞引物延伸预扩增分析多个基因

目的 建立一种单细胞 (individual cell)水平引物延伸预扩增 (primer extensionpreamplification,PEP)方法 ,利用单个细胞同时分析多个基因。方法 采用 10 bp的随机引物先对单细胞的基因组预扩增 ,取其产物 5μl分别对 SRY、ZP3、Rh CE、Rh D、F 5个基因进行套式 PCR扩增。结果 单细胞 PEP后的产物能同时扩增 5个基因 ;对 4种已知基因型的白细胞进行诊断 ,正确率为 95 .6 %。结论PEP技术可以在单细胞水平分析 5个基因 。

烟草RAPD反应体系的建立与优化研究

以烤烟品种为材料,研究了烟草RAPD分析过程中的影响因素,包括模板浓度、Mg2+、dNTP、引物、Taq酶、循环次数、退火温度等,建立了适于烟草RAPD分析的PCR反应体系:即在25μl反应体系中,模板用量为40ng;引物浓度为0.4μM;Mg2+浓度为2.5mM;dNTP浓度为0.2mM;TaqDNA聚合酶用量为1U。扩增程序为94℃预变性5min;然后94℃变性1min,38℃复性1min,72℃延伸1.5min,39个循环;最后72℃延伸5min。

两种全基因组扩增技术对单根毛发DNA检验效能的研究

目的研究简并寡核苷酸引物PCR(degenerate oligonucleotide-primed PCR,DOP-PCR)和扩增前引物延伸PCR(primer extension pre-amplification PCR,PEP-PCR)对单根毛发检验的法医学价值。方法以三种方法对单根毛发样本进行STR分型,第一种方法直接对提取DNA用Profiler Plus试剂盒进行STR分型,第二种和第三种方法是先对提取的DNA样本分别进行DOP-PCR和PEP-PCR扩增处理,然后对其产物用Profiler Plus试剂盒进行STR分型,对两种方法的效能进行比较评价。结果 DOP-PCR和PEP-PCR技术增加了单根毛发STR分型的准确率和信息量。结论 DOP-PCR和PEP-PCR技术对单根自然脱落毛发的检验具有实用价值。

实验模型下两种全基因组扩增技术对指纹DNA检验的效能

目的对简并寡核苷酸引物PCR(Begenerate oligonucleotide-primed PCR,DOP-PCR)和扩增前引物延伸PCR(Primer extension pre-amplification PCR,PEP-PCR)用于指纹检材DNA检验的价值进行研究。方法建立2种指纹检材DNA模型,分别用普通PCR、DOP技术和PEP技术三种方法对指纹DNA样本进行STR分型,对三种方法的效能进行比较评价。结果实验模型1条件下,三种方法均不能获得满意分型结果;模型2条件下,DOP和PEP两种方法可以增加STR分型的成功率和信息量。结论 DOP和PEP技术必须结合高效的DNA提取技术才能最大程度发挥其检验效能。