16SrRNA二级结构可变区图形分析在放线菌分类中的应用

采用16SrRNA可变区二级结构图形分析,比较了姜氏菌属及几个相关属种可变区二级结构的变化。结果表明,在9个可变区二级结构中茎的长度、环的数目和类型、茎的碱基对、以及环内部碱基均有不同。尤其在V5和V6两个区,这种差别尤为明显。这为姜氏菌属的建立提供了又一个证据,并认为16SrRNA可变区二级结构分析,可以应用于属以上原核生物的分类。

性状加权编码在放线菌数值分类上的应用

本文提出了一种新的微生物形态性状的加权编码方式。使用这种加权编码方式及平均链锁法对放线菌游动放线菌属(Actinoplanes)和小瓶菌属(Ampullariella)共116株进行了聚类分析。结果表明:通过性状加权处理可以使游动放线菌属和小瓶菌属得以区分。

土壤拮抗放线菌的筛选及YYHS-2菌株的分类

采用平板分离法从抚顺东部山区不同植被类型土壤中分离出627株放线菌,对其进行皿内琼脂平板、发酵液及拮抗菌的拮抗性筛选。结果表明,YYHS-2等菌株对金黄色葡萄球菌(Staphylococcus aureus)、枯草芽孢杆菌(Bacillius subtilis)、大肠杆菌(Escherichia coli)、变形链球菌(Streptococcus mutans)等4种供试病原真菌具有强烈的拮抗作用。根据YYHS-2菌株的形态特征、培养特征、生理生化特征及细胞壁化学成分分析,均符合阎逊初放线菌分类系统中关于链霉菌的定义,可确定YYHS-2菌株归属于链霉菌属(Streptomyces)。

青藏高原东部几种自然土壤放线菌的生态分布

采用常规方法研究了青藏高原东部几种自然土壤中放线菌区系及与土壤养分的关系 .结果表明 :①供试土壤有机质、全氮、速效氮、速效钾及速效磷含量变异很大 ,其变异系数分别为 71.9% ,6 0 .8% ,6 5 .8% ,5 3.5 %及 130 .6 % .pH差异很小 ,平均值为 8.16 ,变异系数为 6 .5 % .②供试土壤放线菌数量n(cfu) =(8.2～ 14 72 .7)× 10 4g-1.放线菌组成以链霉菌为主 ,其次为小单孢菌 ,二者分别占土壤放线菌总数的 4 1.7%～ 90 .9%及 0～ 5 3.6 % ,其平均值和变异系数分别为 82 .2 %和 18.0 %及 10 .3%和 15 4 .2 % .沼泽土中小单孢菌占放线菌总数的 5 3.6 % ,盐化土中无小单孢菌 .高山草甸土、森林棕褐土、黑钙土及灰钙土中分别出现链孢囊菌属与马杜拉菌属、间孢囊菌属、诺卡氏菌属及链孢囊菌属 .③在链霉菌属中 ,可划分 10个类群 ,其中白孢类群、灰褐类群、金色类群、粉红孢类群为优势类群 ,分别占链霉菌总数的 2 3.3%～ 5 7.0 % ,2 .7%～ 32 .8% ,5 .8%～ 6 3.7及 2 .3%～ 2 4 .6 % ,其次为淡紫灰类群和灰红紫类群 ,6个类群共占链霉菌总数的 70 .3%～ 10 0 % .盐化土和黑钙土分别为链霉菌数量与类群最少和最多的土壤生态体系 .④供试土壤按植被、土壤形成条件及土壤性质分为高山草甸土、森林棕褐土、黑钙土、?

西藏亚高山草原土放线菌研究

采用常规方法研究了分布于西藏海拔４０００～４６８０ｍ之间６个亚高山草原土的放线菌数量与组成，并从分离纯化所得３５５株放线菌中选出９８株代表菌株进行详细研究。结果表明：①供试放线菌分为９个属和２个未定属，链霉菌属和小单孢菌属分别占土壤放线菌总数的５２．７％和２７．３％，钦氏菌属、孢囊放线菌属及孢链囊菌属共占１４．１％；链霉菌属共分为１２个类群，白孢类群、粉红孢类群及黄色类群分别占土壤链霉菌总数的４９．４％、１９．９％及１３．１。②供试菌株牛奶凝固与胨化能力较弱，淀粉水解能力较强。③供试菌株中对革兰氏阳性菌、革兰氏阴性菌、假丝酵母及青霉有拮抗作用的菌株分别占总菌株数的７４．５％、６８．４％、４１．８％及２０．４％，对细菌的拮抗性较真菌强；对革兰氏阳性菌的拮抗性较革兰氏阴性菌强；对酵母菌的拮抗性较霉菌强。

西藏土壤放线性菌初步研究

采用常规方法研究了西藏８个主要土类１１个土样的土壤放线菌数量、主要属与类群、生理生化特性及拮抗特征。结果表明：①西藏不同土类及同一土类不同剖面表层土壤放线菌数量差异很大，随海拔升高，冻结期增长，土壤放线菌数量显著减少；②西藏土壤放线菌种类简单，供试菌株分为５属，链霉菌属占优势；③供试菌株大部分无明胶液化能力，约１／３无淀粉水解能力，淀粉水解能力较强者仅占１／３左右；④供试菌株约有１９％对革兰氏阳性菌有极强抗性，约９％对棉枯萎菌有较强抗性，仅有２％菌株对革兰氏阴性菌有抗性。

基因组时代的放线菌系统学及其研究进展

由于放线菌在生物技术、医药卫生和环境治理等领域中的实际重要性,已经成为人们研究得最为深入的微生物类群之一。现代放线菌分类学是建立在对16S rRNA基因保守分子序列的系统发育学分析基础上、综合利用多种微生物信息的多相分类学(polyphasic taxonomy)。随着大规模基因测序技术的飞速发展,已经完成了超过100株放线菌的全基因组序列。近年来发展起来的"基因组系统发育学"有助让人们更加系统地理解放线菌类群的发生、演化,以及不同生境类群之间的相互关系。随着越来越多的以系统发育学为指导的基因组测序研究项目,例如"细菌和古菌基因组百科全书(Genomic Encyclopedia of Bacteria andArchaea,GEBA)计划"的出现,标志着放线菌系统学进入了基因组学研究时代。本文对基因组时代的放线菌系统学方法,以及国内外的相关研究成果进行综述。