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BioMGE——一个用于采集和分析生物医用材料和多组学数据的数据库
1
作者
龚海燕
张晓彤
+5 位作者
张司臣
李铭鸿
赵赫
王婧宇
王秀梅
陈阳
《工程科学学报》
EI
CSCD
北大核心
2024年第2期279-289,共11页
随着机器学习技术的发展,生物医用材料的科学研究也逐渐走向数据驱动,利用生物测序技术来测试生物医用材料的生物功能,需要对生物医用材料进行进一步优化.因此,一个开放、共享的基础设施来存储来自不同研究领域的异构科学数据是多学科...
随着机器学习技术的发展,生物医用材料的科学研究也逐渐走向数据驱动,利用生物测序技术来测试生物医用材料的生物功能,需要对生物医用材料进行进一步优化.因此,一个开放、共享的基础设施来存储来自不同研究领域的异构科学数据是多学科交叉联合分析的基石.本文介绍了BioMGE,一个基于灵活的自定义平台NMDMS(国家材料数据管理与服务平台)实现的数据库建设案例,用于收集生物医用材料和多组学测序数据.NMDMS的动态容器框架允许用户定义个性化的数据提交模式,存储来自生物医用材料和多组学研究领域的数据.自2019年以来,BioMGE已收集了1547100个生物医用材料和多组学数据集.BioMGE提供了数据导出接口,方便用户直接导出数据以进行数据分析.以组学数据可视化为例,提供BioMGE-viewer模块以实现对生物染色质结构数据从一维到三维的数据可视化.该数据库可为其他跨领域研究的数据共享提供了新的思路和平台.
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关键词
生物医用材料
多组学
动态
容器
数据库
异构
数据
存储
可视化
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职称材料
有效控制数据库数据一致性的表单设计
2
作者
金栋林
《湖州师范学院学报》
2000年第6期51-54,共4页
介绍数据库容器的数据一致性规则,提出通过捕捉因违背数据库一致性规则而引发的错误进行相应控制的方法,从而为达到有效保证数据库数据一致性目的的表单设计思路,并给出相应的实例.
关键词
数据
一致性
数据库容器
表单
设计
数据库
管理
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职称材料
VFP数据字典工具及其应用系统维护
被引量:
3
3
作者
李禹生
何健
彭飞
《武汉工业学院学报》
CAS
2003年第2期32-34,共3页
对于VFP数据库应用系统而言,利用其数据字典工具是一种实施应用系统维护的可行方案。文章在分析VFP数据字典及其操作工具的基础上,提出一种在应用系统运行过程中实施系统维护的实用方法。
关键词
VFP
数据库
数据
字典工具
系统维护
数据库容器
逻辑结构
可视化设计工具
命令行设计工具
DBC操作工具
ReStruc命令文件
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职称材料
通过系统架构的优化实现企业数据仓库的平稳迁移
4
作者
王小玲
《自动化博览》
2022年第9期41-45,共5页
本文通过对企业数据仓库体系架构的分析,开展了对模型设计和数据迁移路径的研究,发现可以通过系统架构的优化有效地支持企业数据仓库中数据模型和历史数据迁移的顺利完成。此架构优化的好处也体现在保证了数据分析服务的连续性,业务不...
本文通过对企业数据仓库体系架构的分析,开展了对模型设计和数据迁移路径的研究,发现可以通过系统架构的优化有效地支持企业数据仓库中数据模型和历史数据迁移的顺利完成。此架构优化的好处也体现在保证了数据分析服务的连续性,业务不会受到企业数据仓库升级期间模型传输和冻结期的影响。另一个关键点就是企业数据仓库底层的分布式大规模并行数据库所提供的多租户云架构。基于此共享架构所搭建的企业数据仓库可以灵活部署数据应用项目,在升级和迁移过程中,利用合理资源部署所需要的开发和测试环境,不仅满足了独立性的要求,也能减轻数据冗余。多租户的系统架构除了满足迁移和升级外,也可以在资源发生瓶颈时进行横向扩展。不仅在系统架构和部署方面应用多租户,通过探索简化数据冗余,更好地履行数据的单一来源的原则方面也可以探索和应用这种系统架构。从而提供用户更好的应用效果、更低的运营成本和最大化的资源投入。
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关键词
企业
数据
仓库
数据
拱顶
分层可伸缩架构
租户
多租户
数据库容器
大规模并行处理系统
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职称材料
电网EM平台可插拔式PDB数据库资源池优化设计
被引量:
1
5
作者
杨永娇
《自动化与仪器仪表》
2019年第7期47-49,53,共4页
为了不断探索企业级系统的优化完善措施,广东电网信息中心建立数据库资源池,通过共享4台服务资源提升资源利用率,搭建支撑204个中小型级信息系统的数据库,有效节约公司信息系统数据库服务器等资源建设成本。通过标准化、模板化的PDB实...
为了不断探索企业级系统的优化完善措施,广东电网信息中心建立数据库资源池,通过共享4台服务资源提升资源利用率,搭建支撑204个中小型级信息系统的数据库,有效节约公司信息系统数据库服务器等资源建设成本。通过标准化、模板化的PDB实例模板实现资源快速交付,并通过统一可视化数据库企业管理平台EM提升资源管理效率,管理广东电网所有企业级系统和中小型级系统的数据库运行状况,实现健康状态快速检查,性能问题快速诊断定位,数据实时备份提升数据安全性等功能,优化系统访问性能以提升用户系统体验。
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关键词
Oracle
DATABASE
RAC
12c
容器
数据库
CDB
PDB
资源池
原文传递
Oracle Database 12c多租户环境研究与实现
被引量:
2
6
作者
赵茉秋
苏延庆
《电脑编程技巧与维护》
2016年第11期49-51,59,共4页
多租户环境是Oracle Database 12c的新特性,通过将不同计算机上的多个物理数据库整合到一台计算机上的一个容器数据库(CDB)--包含零个或零个以上供用户(租户)使用的插接式数据库(PDB),极大降低了硬件需求和管理成本。同时,不同PDB的数...
多租户环境是Oracle Database 12c的新特性,通过将不同计算机上的多个物理数据库整合到一台计算机上的一个容器数据库(CDB)--包含零个或零个以上供用户(租户)使用的插接式数据库(PDB),极大降低了硬件需求和管理成本。同时,不同PDB的数据和代码分隔设计,使数据库系统的管理和维护工作变得简单、灵活。
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关键词
多租户环境
容器
数据库
插接式
数据库
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职称材料
题名
BioMGE——一个用于采集和分析生物医用材料和多组学数据的数据库
1
作者
龚海燕
张晓彤
张司臣
李铭鸿
赵赫
王婧宇
王秀梅
陈阳
机构
北京科技大学计算机与通信工程学院
北京科技大学新材料技术研究院
北京科技大学顺德创新学院
北京中医药大学东直门医院骨科三科
北京中医药大学中医学院
清华大学材料科学与工程学院
中国医学科学院基础医学研究所
出处
《工程科学学报》
EI
CSCD
北大核心
2024年第2期279-289,共11页
基金
国家自然科学基金资助项目(61971031,31871343)
中国博士后科学基金资助项目(2023M740219)
+4 种基金
国家资助博士后研究人员计划资助项目(GZC20230239)
国家重点研发计划资助项目(2018YFB0704300)
佛山市高等教育高层次人才资助项目(BKBS202203)
北京科技大学顺德研究生院科技创新基金项目(BK20BF009)
中国科学院医学科学创新基金资助项目(2020-RC310-009)。
文摘
随着机器学习技术的发展,生物医用材料的科学研究也逐渐走向数据驱动,利用生物测序技术来测试生物医用材料的生物功能,需要对生物医用材料进行进一步优化.因此,一个开放、共享的基础设施来存储来自不同研究领域的异构科学数据是多学科交叉联合分析的基石.本文介绍了BioMGE,一个基于灵活的自定义平台NMDMS(国家材料数据管理与服务平台)实现的数据库建设案例,用于收集生物医用材料和多组学测序数据.NMDMS的动态容器框架允许用户定义个性化的数据提交模式,存储来自生物医用材料和多组学研究领域的数据.自2019年以来,BioMGE已收集了1547100个生物医用材料和多组学数据集.BioMGE提供了数据导出接口,方便用户直接导出数据以进行数据分析.以组学数据可视化为例,提供BioMGE-viewer模块以实现对生物染色质结构数据从一维到三维的数据可视化.该数据库可为其他跨领域研究的数据共享提供了新的思路和平台.
关键词
生物医用材料
多组学
动态
容器
数据库
异构
数据
存储
可视化
Keywords
biomedical material
multi-omics
dynamic container database
heterogeneous data storage
visualization
分类号
R318 [医药卫生—生物医学工程]
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职称材料
题名
有效控制数据库数据一致性的表单设计
2
作者
金栋林
机构
湖州职业技术学院
出处
《湖州师范学院学报》
2000年第6期51-54,共4页
文摘
介绍数据库容器的数据一致性规则,提出通过捕捉因违背数据库一致性规则而引发的错误进行相应控制的方法,从而为达到有效保证数据库数据一致性目的的表单设计思路,并给出相应的实例.
关键词
数据
一致性
数据库容器
表单
设计
数据库
管理
Keywords
data consistency, database container, the rules of data consistency, forms, error
分类号
TP311.138 [自动化与计算机技术—计算机软件与理论]
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职称材料
题名
VFP数据字典工具及其应用系统维护
被引量:
3
3
作者
李禹生
何健
彭飞
机构
武汉工业学院计算机与信息工程系
出处
《武汉工业学院学报》
CAS
2003年第2期32-34,共3页
文摘
对于VFP数据库应用系统而言,利用其数据字典工具是一种实施应用系统维护的可行方案。文章在分析VFP数据字典及其操作工具的基础上,提出一种在应用系统运行过程中实施系统维护的实用方法。
关键词
VFP
数据库
数据
字典工具
系统维护
数据库容器
逻辑结构
可视化设计工具
命令行设计工具
DBC操作工具
ReStruc命令文件
Keywords
VFP
data dictionary
data base appliction system
system maintaining
分类号
TP311.13 [自动化与计算机技术—计算机软件与理论]
下载PDF
职称材料
题名
通过系统架构的优化实现企业数据仓库的平稳迁移
4
作者
王小玲
机构
中国海洋石油集团有限公司信息技术中心
出处
《自动化博览》
2022年第9期41-45,共5页
文摘
本文通过对企业数据仓库体系架构的分析,开展了对模型设计和数据迁移路径的研究,发现可以通过系统架构的优化有效地支持企业数据仓库中数据模型和历史数据迁移的顺利完成。此架构优化的好处也体现在保证了数据分析服务的连续性,业务不会受到企业数据仓库升级期间模型传输和冻结期的影响。另一个关键点就是企业数据仓库底层的分布式大规模并行数据库所提供的多租户云架构。基于此共享架构所搭建的企业数据仓库可以灵活部署数据应用项目,在升级和迁移过程中,利用合理资源部署所需要的开发和测试环境,不仅满足了独立性的要求,也能减轻数据冗余。多租户的系统架构除了满足迁移和升级外,也可以在资源发生瓶颈时进行横向扩展。不仅在系统架构和部署方面应用多租户,通过探索简化数据冗余,更好地履行数据的单一来源的原则方面也可以探索和应用这种系统架构。从而提供用户更好的应用效果、更低的运营成本和最大化的资源投入。
关键词
企业
数据
仓库
数据
拱顶
分层可伸缩架构
租户
多租户
数据库容器
大规模并行处理系统
Keywords
EDW
Data vault
LSA
Tenant
MDC
MPP
分类号
TP311.52 [自动化与计算机技术—计算机软件与理论]
F272 [经济管理—企业管理]
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职称材料
题名
电网EM平台可插拔式PDB数据库资源池优化设计
被引量:
1
5
作者
杨永娇
机构
广东电网有限责任公司信息中心
出处
《自动化与仪器仪表》
2019年第7期47-49,53,共4页
基金
广东电网有限公司信息中心2018年信息专业工器具采购项目(No.037800HJ42180018)
文摘
为了不断探索企业级系统的优化完善措施,广东电网信息中心建立数据库资源池,通过共享4台服务资源提升资源利用率,搭建支撑204个中小型级信息系统的数据库,有效节约公司信息系统数据库服务器等资源建设成本。通过标准化、模板化的PDB实例模板实现资源快速交付,并通过统一可视化数据库企业管理平台EM提升资源管理效率,管理广东电网所有企业级系统和中小型级系统的数据库运行状况,实现健康状态快速检查,性能问题快速诊断定位,数据实时备份提升数据安全性等功能,优化系统访问性能以提升用户系统体验。
关键词
Oracle
DATABASE
RAC
12c
容器
数据库
CDB
PDB
资源池
Keywords
Oracle
Database
RAC
12C
container database
CDB
PDB
resource pool
分类号
TP29 [自动化与计算机技术—检测技术与自动化装置]
原文传递
题名
Oracle Database 12c多租户环境研究与实现
被引量:
2
6
作者
赵茉秋
苏延庆
机构
中国人民解放军
出处
《电脑编程技巧与维护》
2016年第11期49-51,59,共4页
文摘
多租户环境是Oracle Database 12c的新特性,通过将不同计算机上的多个物理数据库整合到一台计算机上的一个容器数据库(CDB)--包含零个或零个以上供用户(租户)使用的插接式数据库(PDB),极大降低了硬件需求和管理成本。同时,不同PDB的数据和代码分隔设计,使数据库系统的管理和维护工作变得简单、灵活。
关键词
多租户环境
容器
数据库
插接式
数据库
分类号
TP311.13 [自动化与计算机技术—计算机软件与理论]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
BioMGE——一个用于采集和分析生物医用材料和多组学数据的数据库
龚海燕
张晓彤
张司臣
李铭鸿
赵赫
王婧宇
王秀梅
陈阳
《工程科学学报》
EI
CSCD
北大核心
2024
0
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职称材料
2
有效控制数据库数据一致性的表单设计
金栋林
《湖州师范学院学报》
2000
0
下载PDF
职称材料
3
VFP数据字典工具及其应用系统维护
李禹生
何健
彭飞
《武汉工业学院学报》
CAS
2003
3
下载PDF
职称材料
4
通过系统架构的优化实现企业数据仓库的平稳迁移
王小玲
《自动化博览》
2022
0
下载PDF
职称材料
5
电网EM平台可插拔式PDB数据库资源池优化设计
杨永娇
《自动化与仪器仪表》
2019
1
原文传递
6
Oracle Database 12c多租户环境研究与实现
赵茉秋
苏延庆
《电脑编程技巧与维护》
2016
2
下载PDF
职称材料
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