炎症性肠病肠道微生物整合代谢网络的构建与分析

目的构建炎症性肠病(IBD)肠道微生物整合代谢网络,比较分析IBD整合代谢网络的拓扑变化。方法参考KEGG数据库,根据肠道微生物参与的代谢反应构建整合代谢网络,用KO丰度差异abs(log2OR)评估KO与机体状态的关联,丰度差异>1的KO即为IBD相关KO,分析IBD相关KO与网络节点的介数中心度、聚类系数和度的关联,并比较IBD和健康整合代谢网络的模块化程度、稳定性和密度。结果构建了含1300个节点(KO)的整合代谢网络;发现366个KO与IBD相关(254个高表达,112个低表达);IBD相关的KO介数中心度和度显著小于IBD无关的KO,聚类系数显著大于IBD无关KO;IBD减少网络的模块化程度、稳定性和密度。结论IBD引起整合代谢网络拓扑属性的变化,IBD相关的KO倾向于在网络的边缘,整合代谢网络方法可从整体上解释肠道微生物变化与IBD的本质关联。