云南省2005年急性弛缓性麻痹病例中非脊髓灰质炎肠道病毒的分子分型

目的描述云南省2005年急性弛缓性麻痹（acute flaccid paralysis,AFP）病例中非脊髓灰质炎肠道病毒（non-polio enterovirus,NPEV）的带毒情况和新发现的新型肠道病毒90型（newer enterovirus 90,EV90）的基因特征。方法 2005年云南省共报告232例AFP病例,共采集到〈15岁AFP病例222例的双份便标本。对222例AFP标本进行病毒分离,对分离到的NPEV进行VP1基因序列测定。用MEGA5.0软件进行进化树分析和作图。进化树用临位相接法（neighbor joining method）作成,所用模式为Kimura二参数置换法（Kimura 2-parameter substitution model）。用1 000个pseudoreplicate datasets进行进化树bootstrap统计学分析。结果 222例患者中共检测脊髓灰质炎病毒（poliovirus,PV）10株（10/222,4.5%）,均为疫苗株,未发现脊髓灰质炎病毒野病毒（wild poliovirus,WPV）;检测到NPEV17株（17/222,7.7%）,其中4株为人类肠道病毒A组（4个血清型,其中1株为新型病毒EV90）,云南株EV90与山东3株之间的核苷酸（nt）同源性为95.7%～96.5%（差异率为3.5%～4.3%）,氨基酸（aa）同源性为98.5%～99.5%（差异率为0.5%～1.5%）,说明云南株更接近山东株03446-SD-CHN-2003（GQ253428）,两地毒株差异不大。12株为人类肠道病毒B组（9个血清型）,1株为人类肠道病毒C组（1个血清型,为新型病毒EV96）,未分离到人类肠道病毒D组病毒。结论 2005年云南省AFP病例中NPEV携带率与往年持平。新型病毒EV90基因进化分析结果表明EV90病毒存在基因多样性特点。