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HPV阳性口咽癌患者预后与T细胞浸润和新抗原负荷相关性分析
被引量:
4
1
作者
卢涣滋
王迪侃
王智
《遗传》
CAS
CSCD
北大核心
2019年第8期725-735,共11页
口咽癌是头颈鳞癌中重要的癌种之一,与人类乳头瘤状病毒(human papillomavirus, HPV)感染有关,其发病率逐年上升。但在临床治疗过程发现,HPV 阳性口咽癌患者整体预后好于 HPV 阴性患者。目前,导致这一现象发生的分子机制尚不明确。本研...
口咽癌是头颈鳞癌中重要的癌种之一,与人类乳头瘤状病毒(human papillomavirus, HPV)感染有关,其发病率逐年上升。但在临床治疗过程发现,HPV 阳性口咽癌患者整体预后好于 HPV 阴性患者。目前,导致这一现象发生的分子机制尚不明确。本研究利用 TCGA 数据库,对 HPV 阳性和阴性患者的免疫细胞浸润和效应功能以及新抗原负荷进行了生物信息学分析。结果发现,HPV 阳性患者的总体生存率比 HPV 阴性患者显著提高。对肿瘤组织中的免疫细胞相对丰度进行分析显示,HPV 阳性患者的 CD8+ T 细胞较 HPV 阴性患者显著提高,其效应分子 IFN-γ和 Granzyme B 表达量显著升高。同时对新抗原数目进行分析发现,HPV 阳性患者肿瘤组织中新抗原较 HPV 阴性患者低。本研究结果为 HPV 相关口咽癌的治疗提供了一定的基础理论支撑。
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关键词
口咽癌
人类乳头瘤状病毒
生物信息学分析
T细胞浸润
新抗原负荷
下载PDF
职称材料
老年胃癌的免疫相关多组学分子特征
被引量:
5
2
作者
陆懿
王德强
+3 位作者
应乐倩
熊芬
胡章敏
李小琴
《临床肿瘤学杂志》
CAS
2022年第6期514-521,共8页
目的分析老年胃癌的免疫相关多组学分子特征。方法采用≥65岁和≥75岁两种老年的定义。利用江苏大学附属医院(AHJU)和癌症基因组图谱计划(TCGA)的胃癌多组学数据,分析老年胃癌与微卫星不稳定性(MSI)、肿瘤突变负荷(TMB)、肿瘤新抗原负荷...
目的分析老年胃癌的免疫相关多组学分子特征。方法采用≥65岁和≥75岁两种老年的定义。利用江苏大学附属医院(AHJU)和癌症基因组图谱计划(TCGA)的胃癌多组学数据,分析老年胃癌与微卫星不稳定性(MSI)、肿瘤突变负荷(TMB)、肿瘤新抗原负荷(TNB)及免疫相关基因表达的关系。结果在AHJU和TCGA中,与<65岁组比较,≥65岁组的MSI发生率(28.6%vs.0.0%,P=0.034和25.3%vs.10.8%,P=0.017)、平均TMB(434.1 vs.39.2,P=0.016和453.5 vs.259.8,P=0.007)及平均TNB(262.8 vs.51.8,P=0.006和439.9 vs.116.6,P=0.021)均显著升高,但在≥75岁和<75岁两组间未发现类似差异(P>0.05)。基于mRNA表达的基因集富集分析显示,抗肿瘤免疫相关的基因在≥65岁组显著富集。结论≥65岁老年胃癌的分子特征与活跃的抗肿瘤免疫反应有关,提示这些患者可能对免疫治疗敏感。
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关键词
胃癌
老年
微卫星不稳定性
肿瘤突变
负荷
肿瘤
新抗原负荷
免疫治疗
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职称材料
题名
HPV阳性口咽癌患者预后与T细胞浸润和新抗原负荷相关性分析
被引量:
4
1
作者
卢涣滋
王迪侃
王智
机构
中山大学光华口腔医学院.附属口腔医院广东省口腔医学重点实验室
出处
《遗传》
CAS
CSCD
北大核心
2019年第8期725-735,共11页
基金
国家自然科学基金项目(编号:81772896,81630025,81602383)
广州市科技计划项目(编号:2017004020102)资助~~
文摘
口咽癌是头颈鳞癌中重要的癌种之一,与人类乳头瘤状病毒(human papillomavirus, HPV)感染有关,其发病率逐年上升。但在临床治疗过程发现,HPV 阳性口咽癌患者整体预后好于 HPV 阴性患者。目前,导致这一现象发生的分子机制尚不明确。本研究利用 TCGA 数据库,对 HPV 阳性和阴性患者的免疫细胞浸润和效应功能以及新抗原负荷进行了生物信息学分析。结果发现,HPV 阳性患者的总体生存率比 HPV 阴性患者显著提高。对肿瘤组织中的免疫细胞相对丰度进行分析显示,HPV 阳性患者的 CD8+ T 细胞较 HPV 阴性患者显著提高,其效应分子 IFN-γ和 Granzyme B 表达量显著升高。同时对新抗原数目进行分析发现,HPV 阳性患者肿瘤组织中新抗原较 HPV 阴性患者低。本研究结果为 HPV 相关口咽癌的治疗提供了一定的基础理论支撑。
关键词
口咽癌
人类乳头瘤状病毒
生物信息学分析
T细胞浸润
新抗原负荷
Keywords
oropharyngeal cancer
human papillomavirus
bioinformatic analysis
T cell infiltration
tumor neoantigen load
分类号
R739.63 [医药卫生—肿瘤]
下载PDF
职称材料
题名
老年胃癌的免疫相关多组学分子特征
被引量:
5
2
作者
陆懿
王德强
应乐倩
熊芬
胡章敏
李小琴
机构
江苏大学附属医院肿瘤科
出处
《临床肿瘤学杂志》
CAS
2022年第6期514-521,共8页
基金
中国博士后科研基金资助项目(2021M693272)
希思科-朝阳肿瘤研究基金资助项目(Y-Young2021-0107)
镇江市社会发展资助项目(SH2021068)。
文摘
目的分析老年胃癌的免疫相关多组学分子特征。方法采用≥65岁和≥75岁两种老年的定义。利用江苏大学附属医院(AHJU)和癌症基因组图谱计划(TCGA)的胃癌多组学数据,分析老年胃癌与微卫星不稳定性(MSI)、肿瘤突变负荷(TMB)、肿瘤新抗原负荷(TNB)及免疫相关基因表达的关系。结果在AHJU和TCGA中,与<65岁组比较,≥65岁组的MSI发生率(28.6%vs.0.0%,P=0.034和25.3%vs.10.8%,P=0.017)、平均TMB(434.1 vs.39.2,P=0.016和453.5 vs.259.8,P=0.007)及平均TNB(262.8 vs.51.8,P=0.006和439.9 vs.116.6,P=0.021)均显著升高,但在≥75岁和<75岁两组间未发现类似差异(P>0.05)。基于mRNA表达的基因集富集分析显示,抗肿瘤免疫相关的基因在≥65岁组显著富集。结论≥65岁老年胃癌的分子特征与活跃的抗肿瘤免疫反应有关,提示这些患者可能对免疫治疗敏感。
关键词
胃癌
老年
微卫星不稳定性
肿瘤突变
负荷
肿瘤
新抗原负荷
免疫治疗
Keywords
Gastric cancer
Elderly
Microsatellite instability
Tumor mutation burden
Tumor neoantigen burden
Immunotherapy
分类号
R735.2 [医药卫生—肿瘤]
下载PDF
职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
HPV阳性口咽癌患者预后与T细胞浸润和新抗原负荷相关性分析
卢涣滋
王迪侃
王智
《遗传》
CAS
CSCD
北大核心
2019
4
下载PDF
职称材料
2
老年胃癌的免疫相关多组学分子特征
陆懿
王德强
应乐倩
熊芬
胡章敏
李小琴
《临床肿瘤学杂志》
CAS
2022
5
下载PDF
职称材料
已选择
0
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引证文献
统计分析
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