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新疆野生盘羊TLR9基因的克隆·序列分析及其编码氨基酸结构预测
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作者 马长宾 孙延鸣 +1 位作者 张银国 张辉 《安徽农业科学》 CAS 北大核心 2011年第33期20511-20513,20522,共4页
[目的]克隆鉴定新疆天山亚种野生盘羊Toll样受体9(TLR9)基因,预测其结构与功能,并对序列进行分析。[方法]以外周血液的总DNA为模板,运用PCR方法分3段克隆了新疆野生盘羊TLR9基因,PCR产物经凝胶回收纯化后测序,并运用分子生物学软件将测... [目的]克隆鉴定新疆天山亚种野生盘羊Toll样受体9(TLR9)基因,预测其结构与功能,并对序列进行分析。[方法]以外周血液的总DNA为模板,运用PCR方法分3段克隆了新疆野生盘羊TLR9基因,PCR产物经凝胶回收纯化后测序,并运用分子生物学软件将测序结果进行分析及结构预测。[结果]克隆得到的新疆野生盘羊TLR9基因大小是3 192 bp,含1个完整的开放阅读框(ORF),共编码1 064个氨基酸,其氨基酸组成中亮氨酸的含量高达18.51%,含有30个氨基酸的信号肽序列;在野生盘羊TLR9蛋白455~4757、40~760和780~800位氨基酸有3个跨膜区;新疆野生盘羊TLR9蛋白的3D结构是由胞外段富含亮氨酸的重复序列(LRR)和胞内段TIL(Toll/IL IR)结构域构成的。[结论]上述结构特征为TLR9发挥生物学功能奠定了基础,同时也为进一步研究新疆野生盘羊TLR9基因提供了理论依据。 展开更多
关键词 新疆野生盘羊(天山亚种) TLR9 基因克隆 序列分析
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新疆野生盘羊未知皮蝇三期幼虫形态学鉴定及初步分类研究 被引量:2
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作者 曹展硕 孙连童 +1 位作者 徐新峰 张银国 《中国草食动物科学》 CAS 2013年第4期56-58,共3页
在新疆石河子市动物园2只死亡的野生盘羊背部皮下发现了1种未知皮蝇的第三期幼虫。经查阅相关的文献资料,尚未发现野生盘羊感染皮蝇的报道。本研究通过形态学观察,主要对具有分类价值的第三期幼虫的伪头、体节、体节刺(主要是D—Ⅲ背腹... 在新疆石河子市动物园2只死亡的野生盘羊背部皮下发现了1种未知皮蝇的第三期幼虫。经查阅相关的文献资料,尚未发现野生盘羊感染皮蝇的报道。本研究通过形态学观察,主要对具有分类价值的第三期幼虫的伪头、体节、体节刺(主要是D—Ⅲ背腹部、D—ⅹ腹部)、气门板等进行了形态学鉴定,并与牛皮蝇、纹皮蝇的第三期幼虫进行了形态学比较。结果显示:与牛皮蝇第三期幼虫区别较大,与纹皮蝇第三期幼虫有许多相同或相似之处,初步确定为纹皮蝇的第三期幼虫。本研究发现了纹皮蝇新的寄生宿主,扩展了纹皮蝇的研究范围,充实了皮蝇感染动物种类的研究资料。 展开更多
关键词 新疆野生盘羊 皮蝇 第三期幼虫 形态学 鉴定
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新疆野生盘羊mtDNA D-loop序列的多态性 被引量:4
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作者 马长宾 孙延鸣 +2 位作者 朱晓光 张银国 张辉 《中国兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第12期1703-1706,共4页
根据GenBank中3条羊亚科动物线粒体DNA全序列设计并合成1对引物,成功扩增了新疆天山亚种野生盘羊线粒体(mtDNA)控制区(D-loop)全长序列片段,并进行序列分析。结果显示,1号和2号盘羊mtDNA D-loop序列全长分别为1 070,1 169 bp;在检测的2... 根据GenBank中3条羊亚科动物线粒体DNA全序列设计并合成1对引物,成功扩增了新疆天山亚种野生盘羊线粒体(mtDNA)控制区(D-loop)全长序列片段,并进行序列分析。结果显示,1号和2号盘羊mtDNA D-loop序列全长分别为1 070,1 169 bp;在检测的2个个体上共发现73个突变位点,其中有7个插入,50个转换,11个颠换,5个缺失,表明碱基的替换有明显偏倚;1号和2号新疆天山亚种野生盘羊mtDNA D-loop区核苷酸突变位点分别为35个和38个,核苷酸变异率分别为3.27%和3.25%。这一结果表明,新疆天山亚种野生盘羊群体线粒体D-loop区存在着丰富的多态性,同时进一步说明了我国新疆野生盘羊遗传资源比较丰富。 展开更多
关键词 新疆野生盘羊(天山亚种) MTDNA D-LOOP 多态性
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Cloning,Sequence Analysis and Amino Acid Structure Prediction of TLR9 Gene from Wild Ovis ammon in Xinjiang
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作者 马长宾 孙延鸣 +1 位作者 张银国 张辉 《Agricultural Science & Technology》 CAS 2011年第10期1531-1534,1546,共5页
[Objective] The study aimed at cloning and identifying the toll receptor gene 9(TLR9) of wild Ovis ammon in Xinjiang,and predicting its structure and function.[Method] The TLR9 complete sequence of wild Ovis ammon w... [Objective] The study aimed at cloning and identifying the toll receptor gene 9(TLR9) of wild Ovis ammon in Xinjiang,and predicting its structure and function.[Method] The TLR9 complete sequence of wild Ovis ammon was cloned from its peripheral blood by PCR technology.Then the PCR products were purified by agarose gel electrophoresis and then sequenced.Finally,the structure and function of TLR9 sequence were predicted by molecular biological software.[Result] The complete sequence of TLR9 gene was 3 192 bp in length,encoding 1 064 amino acids with a signal peptide composed of 30 amino acids;the leucine percentage reached as high as 18.5%.The TLR9 amino acid possibly contained three hydrophobic regions,at amino acids 455-475,740-760 and 780-800.The 3-D structure of TLR9 was constructed by the extracellular LRR domain and intracellular TIL domain(Toll/IL IR).[Conclusion] The characteristics of TLR9 provided theoretical basis for further study on the TLR9 gene of wild Ovis ammon in Xinjiang. 展开更多
关键词 Wild Ovis ammon TLR9 Gene cloning Sequence analysis
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