蛋白质组学中新蛋白质鉴定的研究方法和策略

当前,基于生物质谱进行蛋白质鉴定的技术已经成为蛋白质组学研究的支撑技术之一.产生的数据主要使用数据库搜索的方法进行处理,这种方法的一大缺陷是不能鉴定数据库中未包含的蛋白质,因此如何充分利用质谱数据对蛋白质组研究的意义很大,而新蛋白质鉴定更是其中一个重要的内容.新蛋白质鉴定是蛋白质鉴定的一个方面,新蛋白质的定义按照序列和功能的已知程度分为3个层次;以蛋白质鉴定的方法为基础,目前新蛋白质鉴定的方法可分为denovo测序和相似序列搜索结合的方法以及搜索EST、基因组等核酸数据库的方法2大类;两者各有利弊.存在各自的问题和相应处理的策略.不同的研究者可以根据具体目的应用和发展不同的鉴定方法,同时新蛋白质的鉴定也将随着蛋白质组学研究的发展而更加完善.

磺基异硫氰酸苯酯化学辅助方法对新蛋白质进行从头测序

利用基质辅助激光解吸电离-串联飞行时间(MALDI-TOF-TOF)质谱结合磺基异硫氰酸苯酯化学辅助的方法对一种从拟青霉(Paecilomyces bainier)分离纯化到的新人参皂苷Rb1水解酶的部分肽段进行了从头测序.共获得了这个新蛋白质8条肽段的序列,一些磺化后信噪比非常低的肽段也获得了比较完整的序列.同时通过从头测序分析确定了一对甲硫氨酸非氧化和氧化肽段的序列.结果表明,磺化后的肽段离子化效率大大增强,在PSD(源后裂解)过程中只有肽键断裂产生的C端的碎片离子系列(y离子系列)出现在质谱图中,图谱背景清晰,信噪比高,单纯的y离子系列使得图谱解析变得非常容易.将这8条序列在NCBI(美国国立生物技术信息中心)数据库中进行BLAST(蛋白质序列比对工具)检索印证这种β-葡萄糖甘酶是一个新蛋白质,发现的两条相对保守的序列为进一步研究奠定了基础.

阻止组胺分泌的新蛋白质

美国得克蕯斯大学医学部研究人员发现了一种限制组胺分泌的新蛋白。组胺是变态反应(如枯草热,哮喘和荨麻疹)的主因。此蛋白称为组胺释放抑制因子(HRIF),阻止促细胞释放组胺的反应。研究人员说,注射HRIF有助于逆转变态反应或缓解患者。

新大豆蛋白质食品开发(一)

前言 根据联合国粮食与农业组织(FAO)推荐,每人每天蛋白质的平均需要量为70—75g。如果按这个数字推算,全世界食用蛋白质年需要量为9—12千万吨。但目前实际供给量仅为7—8千万吨。这就是说,世界食用蛋白质年短缺量为2—3千万吨。

蛋白质新功能定向进化研究策略

利用定向进化策略改造蛋白质功能已经在农业、工业和医药等领域得到了广泛的应用。蛋白质工程的最新进展是利用定向进化策略对自然界蛋白质引入新功能,但由于其决定因素比较复杂,是研究者面临的一个重大挑战。详细介绍了国外近年发展的蛋白质新功能定向进化研究策略:对传统突变体库构建策略进行改进以及非同源重组改造技术的开发,是早期引入蛋白质新功能的常用手段,利用计算/理性设计与定向进化相结合引入蛋白质新功能是近年定向进化研究的一个重大突破,而噬菌体展示技术是蛋白质新功能筛选的主要策略。蛋白质新功能的分子进化模型已逐渐成为蛋白质工程改造的新思路。

热激过程中细胞正常蛋白质合成的调控

1.引言近十几年来,分子生物学取得了突飞猛进的发展,这在很大程度上取决于优良的实验系统的应用(包括动物、植物和微生物)。生物有机体与能够显著改变其发育方式的环境之间存在着重要的相互作用,尤其是植物。当环境发生极端变化时,相应地植物细胞生理学方面也要进行快速极端的变化。植物不象动物那样可以从胁迫环境中运动离开,它必须以其它方式调节其生理状态以补偿对植物细胞功能可能有害的胁迫。近七年来,热激反应(heat shock)引起了各国科学家的关注。迄今为止,所有试验过的植物。

新蛋白食品的开发与利用

传统的蛋白食品以动物性蛋白质为主,但这些蛋白食品增长的速度远远不能达到人口增长的需要,解决人类食品危机的关键就是开发和利用新蛋白食品。所谓新蛋白食品就是用传统上不大使用的新原料或新的加工方法,制作出蛋白质含量高的新食品。新蛋白食品的开发,有效地利用了资源,提高了经济效益,而且使蛋白食品的营养价值得到提高,因此具有划时代的意义。另外,新蛋白质添加到食品中,还可以改变食品的功能,组合蛋白质更可以改变某一蛋白质的不足。如果用新蛋白质做为野战食品的原料,

一种也许可用来制造呼吸道合胞病毒病疫苗的嵌合蛋白

美国Upjohn公司的研究人员发明了一种新蛋白质,动物试验结果证明它有希望用作疫苗以对付呼吸道合胞病毒(RSV)病。这种病毒病每年使美国5.5万婴儿得病住院,并夺走2000名婴儿的生命。 Upjohn公司的研究人员分离了形成病毒外壳的两种糖蛋白的致免疫部分。G糖蛋白与呼吸道中易感细胞结合,而F糖蛋白则使细胞融合成称作合胞体的巨型细胞复合体,

淋巴因子和干扰素

911238 与γ-干扰素特异结合的新蛋白质[专,英]/Yeda-Res.Develop/EP-369～413:14.11.88-IL-000378(23.05.90)14.11.89 as 121094.90-157566/21(32页)[译自DBA,1990,9(17),90-09945]本专利为含有一个特异的342个碱基序列(Ⅰ)或一个特异的1619碱基序列(Ⅱ)的重组DNA或cDNA.还有:(1)

美Collagen公司发现促进骨生长的关键性因子

美 Collagen 公司(加州帕洛阿尔托)宣布发现了引起骨生长的物质。这是一个新的细胞生长因子,与转化生长因子β(TGFb)结合后就能促进骨生长。公司声称,已申请专利的这个新蛋白质——骨诱导因子(OIF)是一个突破,能由此开发一些可治疗骨损伤、缺损和有关疾病的新产品。

食品工业联产饲料应大力推广

全国新蛋白质资源开发利用会议对如何实现食品工业联产饲料消除污染提出了建议。经过近几年各企业生产实践证明,其可行的方案有: 1、以玉米为原料生产酒精,其废糟液经浓缩干燥,可制取含蛋白质27-28％的蛋白饲料,技术成熟,经济可行。吉林新中国糖厂借鉴国外经验,自行设计和加工,实现了年产5000吨玉米酒精糟液制取干燥酒糟饲料的设备国产化。 2、地瓜干酒精废糟液采用固液分离,分出部分湿糟作饲料。