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题名犬细小病毒临床分离株VP2基因进化分析
被引量:1
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作者
温峰琴
项海涛
郝宝成
邢小勇
包世俊
胡永浩
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机构
甘肃农业大学动物医学院
中国农业科学院兰州畜牧与兽药研究所
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出处
《中国兽医杂志》
CAS
北大核心
2019年第12期41-45,共5页
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基金
盛彤笙科技创新基金(GSAU-STS-1521)
甘肃农业大学动物医学院教研产学支持计划(JYCX-KX014)。
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文摘
为了对犬细小病毒临床分离株的VP2基因进行遗传变异分析,了解本地区犬细小病毒流行的优势型别及病毒变异情况。采集2例患犬细小病毒病的动物粪便,提取病毒基因组,设计特异性引物,PCR扩增VP2基因,对扩增产物测序,对序列结果与同属其他毒株VP2基因序列用MEGA 7和MegAlign进行同源性分析和遗传进化分析。同时比较其氨基酸变异情况。结果显示,PCR扩增出VP2基因,测序结果显示大小为1755 bp,2株病毒VP2基因NCBI序列登录号分别为MH155192和MH155193,MH155192与MF467233.1和JQ743891.1的核苷酸同源性为99.9%,MH155193与KY937651.1、KP260509.1、KY937641.1核苷酸同源性为99.8%。MH155192主要位点氨基酸分别为为267Y,324I,370Q,426D,440A。MH155193主要位点氨基酸分别为267Y,324I,370R,426E,440T。且2株病毒297位均为A。表明分离到的2株病毒分别为新CPV-2b和CPV-2c型。
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关键词
犬细小病毒
VP2基因
新cpv-2b
cpv-2c
序列分析
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Keywords
Canine parvovirus
VP2 gene
cpv-2b
cpv-2c
Sequence analysis
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分类号
S855.3
[农业科学—临床兽医学]
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