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空间飞行MG63细胞重力敏感新miRNA HN22的鉴定与功能分析 被引量:2
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作者 李铠 吴峰 +7 位作者 杨超 徐子涵 张洪玉 王海龙 杨鸿慧 谭映军 李莹辉 戴钟铨 《航天医学与医学工程》 CAS CSCD 北大核心 2019年第1期7-13,共7页
目的筛选空间飞行引起的MG63成骨细胞差异表达新miRNA并进行功能分析。方法对空间飞行后的MG63成骨细胞small RNA(sRNA)进行测序及生物信息学分析,得到空间飞行导致显著变化的新miRNA。利用地面回转模拟微重力效应实验验证其表达变化情... 目的筛选空间飞行引起的MG63成骨细胞差异表达新miRNA并进行功能分析。方法对空间飞行后的MG63成骨细胞small RNA(sRNA)进行测序及生物信息学分析,得到空间飞行导致显著变化的新miRNA。利用地面回转模拟微重力效应实验验证其表达变化情况;采用miRNA转染分析其对成骨细胞分化的影响;采用多种miRNA靶基因预测软件综合预测其靶基因并检测其潜在靶基因的表达情况;通过GO注释和Panther pathway进行靶基因功能分析。结果新miRNA HN22在空间飞行和地面回转模拟微重力条件下均发生显著表达变化;HN22转染显著提高成骨分化相关基因表达。靶基因预测结果分析显示HN22可影响成骨细胞Wnt信号通路与钙黏蛋白信号通路。Wnt信号通路中的Wnt5a与HN22的表达趋势相反,是其潜在的靶基因。结论HN22可响应微重力变化,并靶向Wnt信号通路中的Wnt5a与钙黏蛋白信号通路影响成骨细胞分化。 展开更多
关键词 空间飞行 成骨细胞 新mirna 骨丢失
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新一代测序技术应用于microRNA检测 被引量:9
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作者 汤海明 陈红 +2 位作者 张静 任景怡 许宁 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2012年第6期784-792,共9页
MicroRNAs(miRNAs)是一类在进化上高度保守的非编码小分子单链RNA(~22nt),在基因转录后调控中发挥至关重要的作用。越来越多的证据表明,miRNAs参与很多重要的生理和病理过程,例如发育、器官形成、调亡、细胞增殖、肿瘤发生等。近年... MicroRNAs(miRNAs)是一类在进化上高度保守的非编码小分子单链RNA(~22nt),在基因转录后调控中发挥至关重要的作用。越来越多的证据表明,miRNAs参与很多重要的生理和病理过程,例如发育、器官形成、调亡、细胞增殖、肿瘤发生等。近年来飞速发展的新一代测序技术在miRNA检测方面具有重要的应用。文章简要介绍了新一代测序技术3大平台的基本步骤和原理,测序数据的生物信息学分析方法以及新一代测序技术在miRNA方向的主要应用。相比于传统的miRNA检测方法,新一代测序技术具有通量高、对遗传物质检测完全且准确度高,可重复性好等优点,在探索新miRNA、miRNA互补链、miRNA编辑、miRNA异构体检测以及miRNA靶基因检测等方面具有巨大优势。随着新一代测序技术的不断发展,测序成本不断降低,在未来几年,新一代测序技术的使用率或将大大增加。新一代测序技术的不断应用将进一步促进人类对于miRNA在各种生理病理过程中的功能和调控的认识。 展开更多
关键词 microRNAs(mirnas)检测 一代测序技术 新mirna检测 mirna靶基因检测
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MicroRNA发现的研究现状及重离子辐照相关应用前景
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作者 丁楠 周光明 《原子核物理评论》 CAS CSCD 北大核心 2009年第2期172-176,共5页
MicroRNA(miRNA)是一类大小为19—24个核苷酸的非编码RNA,它们通过与靶基因的信使RNA(mRNA)结合在转录后水平调节靶基因的表达,因而在广泛的生物学过程中发挥重要作用。首先从miRNA的获得和鉴定两方面对目前miRNA发现工作进行了概括,然... MicroRNA(miRNA)是一类大小为19—24个核苷酸的非编码RNA,它们通过与靶基因的信使RNA(mRNA)结合在转录后水平调节靶基因的表达,因而在广泛的生物学过程中发挥重要作用。首先从miRNA的获得和鉴定两方面对目前miRNA发现工作进行了概括,然后分析和总结了近年来人源miRNA发现工作的现状,最后提出有关新miRNA发现工作的新想法。 展开更多
关键词 microRNA(mirna) 新mirna发现 重离子辐照
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水稻干旱胁迫的small RNA转录组分析
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作者 刘源 张秀妍 +4 位作者 徐妙云 郑红艳 邹俊杰 张兰 王磊 《中国农业科技导报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第6期23-32,共10页
small RNA在植物环境胁迫过程中起重要的调节作用。然而,参与干旱逆境响应复杂过程中的miRNAs及其调控机制仍有待于深入挖掘。对干旱胁迫处理不同时间的水稻根、茎和叶组织进行small RNA文库构建和转录组测序。所有样品共检测到403个miR... small RNA在植物环境胁迫过程中起重要的调节作用。然而,参与干旱逆境响应复杂过程中的miRNAs及其调控机制仍有待于深入挖掘。对干旱胁迫处理不同时间的水稻根、茎和叶组织进行small RNA文库构建和转录组测序。所有样品共检测到403个miRNAs,其中已知miRNAs 352个,新预测miRNAs 51个。干旱处理后24 h的根、茎和叶中分别有37、35和56个差异表达miRNAs,而96 h的根、茎和叶中分别有35、62和65个差异表达miRNAs。15个miRNAs在干旱处理后两个时间点的根、茎和叶中均差异表达,其中,Osa-miR159f、Osa-miR164f、Osa-miR5082和Osa-miR5493受干旱诱导上调表达,是干旱响应中关键调控因子。预测到miRNAs靶基因4537个,并进行了功能注释和富集分析。这些结果为鉴定干旱响应miRNAs并解析其参与抗旱的分子调控机理提供了理论和数据资源。 展开更多
关键词 水稻 干旱胁迫 small RNA 转录组 已知mirna 新mirna 靶基因
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Altered Expression in Patients with Heart Failure of Circulating MicroRNAs Related to Lipoprotein Metabolism
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作者 Priscila O. Carvalho Fatima R. Freitas +5 位作者 Ana Elisa M. Martinelli Bruna M. O. Silva Milena N. C. Curiati Roberto Kalil-Filho Antonio C. Pereira Barretto Raul C. Maranhao 《Journal of Pharmacy and Pharmacology》 2018年第5期466-474,共9页
Objective: This study aimed to investigate, for the first time, the expression of circulating miRNAs (microRNAs) related to lipoprotein metabolism in patients with HF (heart failure). Medlods: Twenty patients wi... Objective: This study aimed to investigate, for the first time, the expression of circulating miRNAs (microRNAs) related to lipoprotein metabolism in patients with HF (heart failure). Medlods: Twenty patients with HF and 10 controls without HF were included. BNP (brain natxiuretic peptide), a marker of HF severity, plasma lipid parameters and the expression of circulating miRNAs were determined. Key findings: Total, LDL-, non-HDL- and HDL-cholesterol, txiglycerides, and apo A-I did not differ between both groups, but apo B was lower in the HF group compared to controls (p = 0.007). In respect to miRNAs, miR-33a, miR-144, miR-125, miR-30c, miR-122, miR-26a, miR-185, miR-758 and miR-106b were higher, from ten- to 25-fold, and miR-10b was lower about 4-fold, in HF group compared to controls. In HF patients a negative correlation between miR-26a and BNP, the marker of disease severity, was found (r = -0.552; p = 0.041). Conclusions: Plasma levels of miRNAs involved in HDL and LDL metabolism regulation were strikingly changed in HF patients. The negative correlation between miR-26a and BNP values may suggest the possibility of the rise of a novel biomarker or therapeutic target in HF. 展开更多
关键词 Lipids and lipoprotein metabolism HDL (high-density lipoprotein) LDL (low-density lipoprotein) HF BNP mirnaS miR-26a.
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