基于全基因组甲基化探讨辐射损伤大鼠的旁效应机制

目的:从全基因组甲基化的角度探讨辐射损伤大鼠的旁效应发生机制。方法:采用12C6+束照射大鼠右侧肺部构建辐射损伤动物模型,同时设立正常组,取心、肝、脾、左肺、左肾组织以提取DNA。采用MethylRAD技术进行全基因组甲基化检测。结果:与正常组比较,模型组大鼠心、肝、脾、左肺、左肾组织中的甲基化位点(CCGG/CCWGG位点数,CCGG/CCWGG平均深度)显著降低(P<0.01),甲基化位点测序深度显著降低(P<0.01)。两组大鼠基因组不同功能元件上的甲基化位点水平高低不同,差异有统计学意义(P<0.01)。从染色体图谱来看,两组大鼠差异甲基化位点在染色体上的分布是不均匀的。结论:全基因组甲基化差异可能是辐射损伤大鼠旁效应的发生机制之一。

基于转录组学的归芪益元膏对^(12)C^(6+)束辐射损伤大鼠肺肾旁效应的作用机制

目的:探讨归芪益元膏对^(12)C^(6+)束辐射损伤大鼠旁效应的防护机制。方法:采用^(12)C^(6+)束照射大鼠右侧肺部构建辐射损伤动物模型,分层随机分为单纯辐射组、归芪益元膏组,同时设立正常对照组,取大鼠的左肺、左肾组织以提取总RNA,IlluminaHiSeq平台测序,检测各组大鼠所有基因转录本的差异表达,筛选出与旁效应保护相关的基因及代谢途径。结果:给予归芪益元膏能改善^(12)C^(6+)束辐射损伤大鼠旁效应,转录数据分析显示其作用机制主要涉及肿瘤坏死因子、细胞外基质、细胞-细胞黏附连接、钙离子、白细胞介素-1、4、8等蛋白基因表达上调/下调。结论:归芪益元膏对^(12)C^(6+)束辐射损伤大鼠旁效应具有一定的防护作用,其机制可能与抑制电离辐射响应及癌症信号转导通路有关。