固有无序蛋白质无序区和有序区氨基酸组成偏好性分析

以固有无序蛋白质为研究对象,通过CD-HIT对数据进行去冗余处理,然后利用编程软件对数据进行统计而得到新的数据。对所有无序区及有序区的氨基酸含量进行对比,认为氨基酸Val、Ile、Leu、Phe、Trp、Asn、Tyr、His具有形成有序结构的偏好性;氨基酸Pro、Ser、Gln、Asp、Lys具有形成无序结构的偏好性。研究结论有助于进一步挖掘固有无序蛋白质的序列特征,并为固有无序蛋白质的预测提供一些借鉴。

中子辐照损伤区对硅少数载流子寿命的影响

中子辐照在半导体硅晶体中形成无序区,使其电学性能受到严重影响.本文根据无序区基本特征,系统分析中子辐照对少数载流子寿命影响的过程,给出了一个完整自洽的计算表达式;理论计算了材料掺杂浓度、无序区辐照缺陷分布态,以及载流子注入量等参量对少数载流子寿命的影响.最后,将计算结果与点缺陷模型、及实验测量数量进行比较和讨论.

固有无序蛋白与蛋白质相互作用位点残基特征分析

本文对固有无序蛋白(IDPs)与其他蛋白质相互作用位点残基特征进行了研究.首先在数据库中选出满足条件的109条IDPs蛋白质链及与其他配体蛋白形成的299个IDPs-蛋白质复合物,然后提取复合物中作为相互作用位点的IDPs-蛋白质残基.这109条IDPs链中共含有50 031个氨基酸残基,其中处于作用位点的残基有4 822个.通过分析发现,20种氨基酸在形成IDPs-蛋白质相互作用位点残基时具有不同的倾向性,根据形成作用位点残基的倾向性,20种氨基酸可分成三大类:倾向型氨基酸(ILE、LEU、ARG、PHE、TYR、MET、TRP)、中间型氨基酸(GLN、GLU、THR、LYS、VAL、ASP、HIS)、非倾向型氨基酸(PRO、SER、GLY、ALA、ASN、CYS).研究结果还进一步表明,不同氨基酸在有序区域与无序区域形成IDPs-蛋白质作用位点残基的倾向性不同.其中,氨基酸TRP、LEU、ILE、CYS在有序和无序区域形成作用位点残基的差异性尤为明显,而氨基酸GLU、PHE、HIS、ALA则基本没有多大差别.对IDPs-蛋白质相互作用位点残基理化特征进行分析发现:疏水性强、侧链净电荷量较少、极性较小、溶剂可及性表面积较大、侧链体积较大、极化率较大的氨基酸比较倾向于形成作用位点残基.主成分分析结果显示,残基的极化率、侧链体积和溶剂可及表面积对作用位点残基影响最大.

固有无序蛋白有序和无序结合区域的序列特征分析

基于DisProt数据库,其将固有无序蛋白按照分子功能分为6大类,选取每一类功能下每条有序与无序区结合位点左右两侧5个氨基酸残基作为研究对象;利用方差分析分别统计6类分子功能中有序与无序区结合位点处20种氨基酸以及6类亲疏水性氨基酸分布的差异。结果表明:不同分子功能的固有无序蛋白在有序与无序结合点处的氨基酸含量及亲疏水特性都存在着较显著差异。在固有无序蛋白6类分子功能中,氨基酸(D、G、H、I、P、S、T、Y)在有序区的分布存在差异;而氨基酸(D、G、V)在无序区的分布存在差异。而在6类亲疏水性氨基酸中,强疏水性氨基酸(L、I、V、A、M、F)和弱疏水性或弱亲水性氨基酸(S、T、Y、W)以及脯氨酸P和甘氨酸G在有序区的分布存在差异;而甘氨酸G在无序区的分布存在差异。本文的研究旨在挖掘固有无序蛋白不同分子功能中有序与无序区结合位点处的序列特征,以便于下一步对固有无序蛋白预测软件的开发和改进。

CONSTRUCTION OF FREQUENCY HOPPING SEQUENCES WITH NO HIT ZONE

In this paper,a property of Frequency Hopping (FH) sequence set with No Hit Zone (NHZ) is analyzed. Based on matrix transform and mapping methods,respectively,two classes of NHZ FH sequences are presented. These NHZ FH sequences have good Hamming auto-correlation and Hamming cross-correlation properties. FH Code-Division Multiple Access (FH-CDMA) communication systems employing such NHZ FH sequences will eliminate multiple-access interference if the maximum time delay is shorter than the length of the NHZ.