小型节肢动物无形态损伤提取基因组DNA的研究进展

DNA提取是获取DNA条形码的关键步骤及进行后续相关研究的基础。小型节肢动物因个体微小,常用的基因组DNA提取方法破坏了重要的外部形态特征,致使无法进行后续的形态学验证,而无形态损伤提取DNA的方法有效弥补前者的不足。本文对小型节肢动物的无形态损伤提取基因组DNA进行综述,对比了小型节肢动物不同基因组DNA提取方法的优缺点,为进一步优化改进,探索更简单、高效的无形态损伤性DNA提取方法奠定基础。

三种无形态损伤提取粉螨DNA方法的改进与评估

【目的】改进和评估无形态损伤提取粉螨DNA并保留完整凭证标本的方法。【方法】用改良Chelex-100法,STE法和碱裂解法提取单只椭圆食粉螨Aleurolyphus ovatus基因组DNA,并进行凭证标本回收和形态观察。超微量分光光度计测定DNA的纯度。通过对COⅠ基因的扩增,验证所提取的DNA是否满足PCR扩增。【结果】3种方法处理后的凭证标本整体保持完整,但碱裂解法处理后,躯体刚毛易脱落,凭证标本透明过度,影响标本的形态鉴定。改良Chelex-100法的A_(260)/A_(280)比值为1.95,其余两种方法A_(260)/A_(280)均低于1.8。3种方法所提单只螨DNA均满足PCR扩增,但STE法的扩增效果较差。【结论】改良Chelex-100法保存凭证标本完整,不影响标本的形态鉴定;提取的DNA纯度高,可以满足PCR扩增和后续相关分子生物学研究,且简单高效,适于单只粉螨DNA的无形态损伤提取。