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类孟买血型基因分析及1种FUT1新无效等位基因的发现 被引量:6
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作者 池泉 张爱 +1 位作者 任本春 郭永建 《中国输血杂志》 CAS CSCD 北大核心 2012年第11期1152-1155,共4页
目的分析类孟买血型基因及H抗原缺乏血型的分子机制,了解FUT1与FUT2基因间的连锁遗传关系。方法用血清学方法鉴定H抗原缺乏的12名献血者及4名患者的类孟买血型,采用直接测序和克隆测序的方法分析类孟买血型个体的FUT1和FUT2基因。结果... 目的分析类孟买血型基因及H抗原缺乏血型的分子机制,了解FUT1与FUT2基因间的连锁遗传关系。方法用血清学方法鉴定H抗原缺乏的12名献血者及4名患者的类孟买血型,采用直接测序和克隆测序的方法分析类孟买血型个体的FUT1和FUT2基因。结果在16名类孟买血型个体者中检出3种已知的FUT1无效等位基因(h1,nt547-552△ag;h2,nt880-882△tt;h3,nt658c→t)和1种新的FUT1无效等位基因(h9,nt424c→t)。FUT1基因型分别为h1/h1 9例,h1/h2 4例,h3/h2、h2/h2及h1/h9各1例。在检出的FUT1无效等位基因中,h1和h2等位基因分别为68.75%(23/32)和21.87%(7/32)。所有FUT2等位基因均存在纯合的nt357c→t同义突变,在具有h2等位基因的个体中,都检出nt716g→a突变(Se357,716);未发现FUT2无效等位基因。结论发现1种引起H抗原缺乏血型的新FUT1无效等位基因;证实h1和h2为福建地区类孟买血型个体的主要流行基因,支持FUT1和FUT2基因存在连锁遗传的观点。 展开更多
关键词 H抗原 类孟买血型 FUT1基因 FUT2基因 无效等位基因 基因连锁
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STR分型中无效等位基因的分析研究 被引量:5
2
作者 任贺 刘芳 +2 位作者 陈冲 石妍 刘莹 《刑事技术》 2014年第6期50-52,共3页
PCR-STR自动分型技术是当前法医学个体识别和亲权鉴定的主要技术,具有高灵敏度、高鉴别能力和标准化自动分型等特征[1].在STR自动分型时,也会出现一些影响其准确分型的因素,本文结合1例三联体亲权鉴定中父亲与孩子Penta基因座上不符合... PCR-STR自动分型技术是当前法医学个体识别和亲权鉴定的主要技术,具有高灵敏度、高鉴别能力和标准化自动分型等特征[1].在STR自动分型时,也会出现一些影响其准确分型的因素,本文结合1例三联体亲权鉴定中父亲与孩子Penta基因座上不符合遗传规律现象,通过用3种不同试剂盒、改变退火温度、重新设计引物以及测序等方法,对STR分型中无效等位基因现象进行分析和探讨. 展开更多
关键词 法医物证学 PCR-STR自动分型技术 基因突变 无效等位基因
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发现RhD阴性无效等位基因1例 被引量:1
3
作者 李敏 吕蓉 +4 位作者 吴学忠 李素萍 王伦善 於娟 刘忠 《临床输血与检验》 CAS 2012年第2期128-131,共4页
目的鉴定1例疑似新的RHD无效等位基因引起的RhD阴性个体的分子背景。方法采用血清学吸收放散试验以及序列特异性引物PCR(PCR-SSP)法检测RhD阴性样本,对1例真实D阴性且存在RHD基因全长编码序列的个体,通过基因测序法进行分析鉴定。结果... 目的鉴定1例疑似新的RHD无效等位基因引起的RhD阴性个体的分子背景。方法采用血清学吸收放散试验以及序列特异性引物PCR(PCR-SSP)法检测RhD阴性样本,对1例真实D阴性且存在RHD基因全长编码序列的个体,通过基因测序法进行分析鉴定。结果该例样本血清学表型为RhCcdee,其RHD基因第615-616位存在CA两个碱基缺失(RHD615-616delCA),由于框移突变造成第316位氨基酸时形成终止密码子。该基因序列已提交至Genbank,登录号为GQ289585。结论使用基因序列分析法鉴定出1例新的RHD无效等位基因。 展开更多
关键词 RHD阴性 RHD基因 序列分析 无效等位基因
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面包小麦‘蜡质’位点上无效等位基因的8种基因型的培育
4
作者 Zhao,X.C 《国外作物育种》 1999年第3期26-28,共3页
关键词 面包小麦 蜡质位点 无效等位基因 基因 培育
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3个Wx位点上无效等位基因对小麦淀粉糊化特性的不同效应
5
作者 Araki,E Miura,H 等 《国外作物育种》 2001年第3期46-47,共2页
关键词 小麦 淀粉糊化特性 Wx位点 无效等位基因 遗传效应
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携带不同的Wx无效等位基因的小麦近等基因系的培育及其淀粉特性
6
作者 H.Miura M.H.A.Wickramasinghe 邱敦莲 《国外作物育种》 2003年第1期31-32,共2页
关键词 Wx无效等位基因 小麦 近等基因 淀粉特性
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微卫星标记中的无效等位基因 被引量:44
7
作者 文亚峰 Kentaro Uchiyama +4 位作者 韩文军 Saneyoshi Ueno 谢伟东 徐刚标 Yoshihiko Tsumura 《生物多样性》 CAS CSCD 北大核心 2013年第1期117-126,共10页
微卫星标记以其独有的优点广泛应用于遗传学研究,但无效等位基因(nullalleles)的存在与潜在影响是其最大缺陷之一,在研究工作中并未得到足够重视。本文在综述国内外相关文献的基础上,明确了微卫星无效等位基因的概念与特点,对其可能的... 微卫星标记以其独有的优点广泛应用于遗传学研究,但无效等位基因(nullalleles)的存在与潜在影响是其最大缺陷之一,在研究工作中并未得到足够重视。本文在综述国内外相关文献的基础上,明确了微卫星无效等位基因的概念与特点,对其可能的产生原因、频率估算方法、相关分析软件及其对群体遗传学、亲本分析等研究结果的影响进行述评,以期对无效等位基因有较为全面、深入的了解。微卫星无效等位基因的产生与SSR侧翼序列的变异(点突变、插入或缺失)及引物结合位点有关,其与同工酶标记中的无效等位基因有本质区别,并非基因本身的自然属性。虽然微卫星无效等位基因具有普遍性、复杂性和隐匿性等特点,但完全可以通过Hardy-Weinberg平衡检验、亲子代基因型分析和重新设计引物等方法认识、检测并估算其频率。无效等位基因会对遗传学相关研究结果造成显著影响,如降低群体遗传多样性,加大群体间遗传分化;降低亲本分析排除率,甚至可能造成亲本分析结果的错误与混乱。今后研究工作中,我们应对无效等位基因予以足够重视并谨慎对待,从标记位点选择、无效等位基因数据调整及重新设计引物分析等多个方面尽可能减少和避免其影响,以获得最真实的分析结果。 展开更多
关键词 无效等位基因 微卫星标记 等位基因频率 Hardy-Weinberg平衡
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发现1个新的无效RHD等位基因 被引量:1
8
作者 庄乃保 吴凡 +1 位作者 徐华 邵超鹏 《中国输血杂志》 CAS CSCD 北大核心 2010年第7期511-513,共3页
目的鉴定1个疑似新的无效RHD等位基因。方法采用常规血清学方法检测1名孕妇的Rh血型抗原,间接抗球蛋白试验确认RhD抗原阴性,并用吸收放散试验排除D放散型(Del);先后分别采用商品化试剂盒、序列特异性引物PCR(SSP-PCR)技术以及DNA序列分... 目的鉴定1个疑似新的无效RHD等位基因。方法采用常规血清学方法检测1名孕妇的Rh血型抗原,间接抗球蛋白试验确认RhD抗原阴性,并用吸收放散试验排除D放散型(Del);先后分别采用商品化试剂盒、序列特异性引物PCR(SSP-PCR)技术以及DNA序列分析技术,分析该名个体的RHD基因。结果血清学试验为Rh-dCcEe,吸收放散试验阴性;基因型检测为杂合型RHD+/RHD-;商品化试剂盒和SSP-PCR结果都显示该个体携带的RHD阳性基因与正常Rh阳性表型的基因一致。对该标本编码区全长序列分析结果显示:第1外显子的第78位核苷酸缺失1个碱基"C",至第112位氨基酸时形成终止密码子。结论经GenBank检索发现该例为1个新的无效RHD等位基因,并完成注册RHD78delC(GenBank GQ477180)。 展开更多
关键词 RhD抗原阴性 RHD基因 碱基突变 无效等位基因 血清学试验 基因型检测
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植物微卫星分子标记中无效等位基因检测方法的比较与应用 被引量:1
9
作者 侯盟 杜芳 《植物分类与资源学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第6期723-729,共7页
微卫星分子标记因其开发便捷、突变率高、成本较低等优势一直被广泛应用于群体遗传学、保护生物学和分子生态学研究中。近年来二代测序技术、多重PCR方法以及毛细管电泳等新技术的发展和完善,极大地提高了微卫星分子标记的开发和使用效... 微卫星分子标记因其开发便捷、突变率高、成本较低等优势一直被广泛应用于群体遗传学、保护生物学和分子生态学研究中。近年来二代测序技术、多重PCR方法以及毛细管电泳等新技术的发展和完善,极大地提高了微卫星分子标记的开发和使用效率并降低了使用成本。但是在开展微卫星实验过程中普遍存在的无效等位基因(或称为哑等位基因,null alleles)会对研究结果造成偏差,是微卫星分子标记应用中的最大缺陷之一。然而,长期以来无效等位基因的检测问题并未受到研究者的足够重视。本文通过对国内外相关文献查阅,在对无效等位基因有一个较为深入和全面认识的基础上,对目前无效等位基因的主要检测方法进行全面的介绍和深入的比较。最后,结合研究实例总结出植物微卫星分子标记研究中无效等位基因检测的有效办法。 展开更多
关键词 无效等位基因 微卫星 哈温平衡法 亲子代基因型法
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男性不育人群17个Y染色体短串联重复基因座无效等位基因分析 被引量:8
10
作者 叶峻杰 李宗芳 +6 位作者 陈燕祥 马丽 李貌 郭海 王跃力 杨丽娟 程宝文 《中华医学遗传学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2013年第3期330-334,共5页
目的探讨17个Y染色体短串联重复(Y—shorttandemrepeat,Y—STR)在遗传缺陷相关的男性不育群体中基因座分型时无效等位基因现象。方法应用改良多重PCR体系进行序列标签位点(sequencetaggedsites,STS)检测,对236例非梗阻性无精、... 目的探讨17个Y染色体短串联重复(Y—shorttandemrepeat,Y—STR)在遗传缺陷相关的男性不育群体中基因座分型时无效等位基因现象。方法应用改良多重PCR体系进行序列标签位点(sequencetaggedsites,STS)检测,对236例非梗阻性无精、严重少精男性个体进行Y染色体无精子症因子(azoospermiafactor,AZF)微缺失检测及分型;应用AmpFISTR0YfilerTM体系在上述人群中进行17Y—STR(DYS19、DYS389I、DYS389II、DYS390、DYS391、DYS392、DYS393、DYS437、DY$438、DYS439、DYS385a/b、DYS448、DYS456、DYS458、DYS635、Y—GATA-H4)基因分型。结果上述人群中AZF的总缺失率为16.95%(40/236):非梗阻性无精症患者存在13例AZFc缺失,6例AZFb+C缺失,2例AZFa缺失,1例AZFb缺失。严重少精子症患者存在17例AZFc缺失,1例AZFb缺失。未发现AZFa+b+e缺失。40例不育个体通过17Y—STR检测在DYS438、DYS439、DYS437、DYS389I、DYS389II、DYS392、DYS385a/b、DYS448基因座发现了无效等位基因。2例AZFa缺失个体具有DYS438、DYS439、DYS437、DYS389I、DYS389II等位基因缺失;2例AZFb缺失个体具有DYS392、DYS385a/b等位基因缺失;30例AZFc缺失个体具有DYS448等位基因缺失;6例AZFb+C缺失个体具有DYS392、DYS385a/b、DYS448等位基因缺失。在其他男性不育个体中未见Y—STR缺失。结论Y染色体AZF微缺失是无精症、严重少精子症的主要遗传因素,这种缺失造成法医学相关的Y染色体短串联重复基因座缺失,在性侵犯案件中可导致错误的解释。阐明Y-STR在男性不育人群中的异质性在法医DNA鉴定中可以更好地完善Y—STR数据库和提高STR数据的解释能力。 展开更多
关键词 短串联重复 无效等位基因 法医鉴定 Y染色体微缺失
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西安地区Rh阴性个体D基因多态性的研究 被引量:13
11
作者 徐华 叶世辉 +4 位作者 邢荷香 贺晨 张建耕 吴大洲 章迪 《中国输血杂志》 CAS CSCD 北大核心 2010年第2期124-125,共2页
目的研究西安地区RhD阴性个体的RHD基因多态性分布状况,以及Del血型与其它Rh血型表形之间的关系。方法应用PCR方法检测RhD阴性表型的个体,分析Del血型的Rh表型分布,对特殊样本进行测序分析。结果在607例样本中,检出d/d基因型428例,占70.... 目的研究西安地区RhD阴性个体的RHD基因多态性分布状况,以及Del血型与其它Rh血型表形之间的关系。方法应用PCR方法检测RhD阴性表型的个体,分析Del血型的Rh表型分布,对特殊样本进行测序分析。结果在607例样本中,检出d/d基因型428例,占70.5%;Del型125例,占20.6%;弱D15型21例,占3.2%;RHD-CE(2—9)-D/d融合基因型31例,占5.0%;DⅥⅢ型2例,占0.4%;Del血型个体中具有C抗原者比例较高,但亦有其它表型存在;鉴定出1例新的RHD无效等位基因。结论对西安地区Rh阴性无偿献血者D基因多态性进行研究,揭示了Rh阴性个体D基因多态性,既有临床意义,也有遗传学意义。 展开更多
关键词 RHD基因 多态性 新的RHD无效等位基因
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一个无效新等位基因C*01∶37N的鉴定及其序列分析 被引量:1
12
作者 喻琼 王大明 +2 位作者 邹红岩 徐筠娉 邓志辉 《国际输血及血液学杂志》 CAS 2011年第1期17-19,共3页
目的 鉴定中国汉族人群中新发现的一个HLA-C无效等位基因,并对国际上业已公布的HLA-C无效等位基因的突变情况进行分析.方法 采用分子克隆和单倍体测序的方法,鉴定1例HLA-C基因测序分型结果异常样本的分子生物学基础.结果 检出了一个C*0... 目的 鉴定中国汉族人群中新发现的一个HLA-C无效等位基因,并对国际上业已公布的HLA-C无效等位基因的突变情况进行分析.方法 采用分子克隆和单倍体测序的方法,鉴定1例HLA-C基因测序分型结果异常样本的分子生物学基础.结果 检出了一个C*01新变异等位基因,其序列与C*01∶02∶01最相近,但存在编码区nt 363 G>A点突变,位于第三外显子的第97密码子由TGG直接变成终止密码子TGA,导致一个无效等位基因,其序列提交国际GenBank(序列号:GU592508)和IMGT/HLADatabase(HWS10010188).结论 该无效等位基因已被世界卫生组织(WHO)HLA因子命名委员会正式命名为C*01∶37N. 展开更多
关键词 人类白细胞抗原(HLA) HLA-C位点 无效等位基因 分子克隆和单倍体测序
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两种进口试剂盒在福建汉族人群STR基因分型中的一致性验证及应用
13
作者 冉鹏 宋秀宇 +3 位作者 周娟娟 谢金镇 洪素云 裴斌 《中国输血杂志》 CAS 2018年第2期154-156,共3页
目的确认PowerPlexFusion与GlobalFiler试剂盒基因分型结果的一致性。方法收集2 410名福建地区无关汉族个体血样并提取基因组DNA。采用PowerPlexFusion与GlobalFiler试剂盒检测个体的STR座位,观察20个重叠常染色体STR基因座及1... 目的确认PowerPlexFusion与GlobalFiler试剂盒基因分型结果的一致性。方法收集2 410名福建地区无关汉族个体血样并提取基因组DNA。采用PowerPlexFusion与GlobalFiler试剂盒检测个体的STR座位,观察20个重叠常染色体STR基因座及1个Y(DYS391)基因座分型结果的一致性。并比较分析这2个试剂盒在日本、韩国人群应用评价的结果。结果所有20个重叠常染色体STR基因座除D21S11、D22S1045和D5S818基因座观察到4例标本基因分型结果不一致外(占标本总数的0.17%),其他17个常染色体STR和DYS391基因分型结果均一致。2个试剂盒20个相同STR常染色体基因座基因型一致率为99.992%。2个试剂盒的杂合基因座峰高比例差异无统计学意义(P〉0.05)。结论 PowerPlexFusion与GlobalFiler试剂盒基因分型一致性较好,在需要确认是否为无效等位基因时可互为补充。 展开更多
关键词 法医遗传学 短串联重复序 无效等位基因 一致性验证 福建汉族人群
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人工诱导牙鲆异质雌核发育群体的微卫星标记分析 被引量:27
14
作者 王伟 尤锋 +1 位作者 高天翔 张培军 《高技术通讯》 CAS CSCD 北大核心 2005年第7期107-110,共4页
采集牙鲆成熟精、卵,通过紫外线照射精子和冷休克处理受精卵,经形态学和染色体计数检测获得了异质雌核发育牙鲆群体,采用筛选获得的10对高多态性的微卫星引物对该群体进行了遗传变异分析.结果为:10对引物中,Po91可能因为出现了无效等位... 采集牙鲆成熟精、卵,通过紫外线照射精子和冷休克处理受精卵,经形态学和染色体计数检测获得了异质雌核发育牙鲆群体,采用筛选获得的10对高多态性的微卫星引物对该群体进行了遗传变异分析.结果为:10对引物中,Po91可能因为出现了无效等位基因而没有扩增产物,其余9对引物全都扩增出目的片段,其中7对表现出多态性,其多态座位比例为77.8%,平均杂合度为0.3856,明显低于自然和养殖群体;在具多态性的7个基因座位上均发生了基因-着丝点之间的重组,重组率在42.6%~100%之间.通过抑制第二极体排出获得的牙鲆雌核发育群体在个体和群体水平尚具有一定的基因杂合. 展开更多
关键词 雌核发育 微卫星标记分析 牙鲆 人工诱导 异质 遗传变异分析 无效等位基因 紫外线照射 染色体计数 微卫星引物 平均杂合度 多态性 扩增产物 多态座位 养殖群体 基因座位 群体水平 第二极体 受精卵 冷休克 形态学 着丝点
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海湾扇贝微卫星标记开发及其分离方式分析 被引量:11
15
作者 李宏俊 刘晓 +4 位作者 杜雪地 宋蕊 张国范 胡景杰 包振民 《海洋科学》 CAS CSCD 北大核心 2009年第12期4-8,共5页
利用尼龙膜吸附杂交法构建了海湾扇贝的(AC)15、(AG)15微卫星富集文库,随机挑取3 000个克隆,经菌落原位杂交二次筛选共获得阳性克隆1 268个(42.3%)。经序列测定和生物信息学分析后得到521个独立的阳性克隆,其中微卫星506个,小卫星15个... 利用尼龙膜吸附杂交法构建了海湾扇贝的(AC)15、(AG)15微卫星富集文库,随机挑取3 000个克隆,经菌落原位杂交二次筛选共获得阳性克隆1 268个(42.3%)。经序列测定和生物信息学分析后得到521个独立的阳性克隆,其中微卫星506个,小卫星15个。微卫星中,完美型248个,占总数的49.0%;非完美型216个,占42.7%;复合型42个,占8.3%;其中AG/TC重复占70.4%(356个),AC/TG重复29.6%(150个)。选择其中的55条序列设计引物,筛选出其中的20对引物检测它们在海湾扇贝CC10家系的双亲和94个子代个体中的分离情况,结果表明:(1)其中6个位点在母本和子代中发生分离,10个位点在父本和子代中发生分离,4个为双亲共享位点;(2)2个位点存在无效等位基因;(3)16个位点符合孟德尔遗传定律,4个位点的子代个体基因型频率偏离孟德尔遗传定律。上述结果表明,这些微卫星引物可以用于构建海湾扇贝的遗传连锁图谱,并且所构建的富集文库适用于微卫星标记的大规模开发。 展开更多
关键词 海湾扇贝(Argopecten irradians) 微卫星 富集文库 无效等位基因 分离方式
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凡纳滨对虾微卫星位点在两个选育家系中遗传的初步研究 被引量:19
16
作者 张留所 相建海 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2005年第6期919-924,共6页
利用两个选育凡纳滨对虾全同胞家系研究了10个微卫星位点的遗传特征。通过ABI310或3100测序仪检测,在所观察到的20个基因型比例(genotypic ratios)(10个微卫星位点×2个家系)中,有17个基因型比例符合孟德尔遗传。微卫星位点TUMXLv8.... 利用两个选育凡纳滨对虾全同胞家系研究了10个微卫星位点的遗传特征。通过ABI310或3100测序仪检测,在所观察到的20个基因型比例(genotypic ratios)(10个微卫星位点×2个家系)中,有17个基因型比例符合孟德尔遗传。微卫星位点TUMXLv8.220在两个家系中均存在无效等位基因,从而3个不符合孟德尔遗传基因型中2个可由无效等位基因来解释。TUMXLv3.1在06家系偏离了1∶1∶1∶1的孟德尔预期比。3个微卫星位点(TUMXLv5.66,TUMXLv7.74,TUMXLv8.224)在两个家系中均表现单态。3个微卫星位点(TUMXLv5.45,TUMX-Lv7.56,TUMXLv8.256)在两个家系均既表现多态又遵循孟德尔共显性遗传,是亲子鉴定和种群遗传分析的较好选择。结果显示在应用微卫星标记进行遗传分析之前利用全同胞家系进行遗传模式研究是非常必要的。 展开更多
关键词 凡纳滨对虾 微卫星 孟德尔遗传 无效等位基因
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梨小食心虫微卫星标记的扩增稳定性及多态性分析 被引量:3
17
作者 郑燕 王康 +2 位作者 李玉婷 乔宪凤 陈茂华 《昆虫学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第11期1335-1342,共8页
【目的】筛选适合我国梨小食心虫Grapholita molesta种群遗传学研究的微卫星位点,并依据所筛选的微卫星位点进行梨小食心虫地理种群的遗传多样性分析。【方法】利用欧洲梨小食心虫和苹果蠹蛾Cydia pomonella种群中已报道的11个微卫星位... 【目的】筛选适合我国梨小食心虫Grapholita molesta种群遗传学研究的微卫星位点,并依据所筛选的微卫星位点进行梨小食心虫地理种群的遗传多样性分析。【方法】利用欧洲梨小食心虫和苹果蠹蛾Cydia pomonella种群中已报道的11个微卫星位点,分析各位点在我国12个种群257头梨小食心虫样本中的扩增稳定性,再进行其多态性分析,筛选适合的位点,然后进行种群遗传多态性分析。【结果】在分析的11个微卫星位点中,位点Gm01,Gm03,Gm04和Cyd15无法稳定扩增;位点Gm05扩增成功率较低,位点Gm07遗传多态性较低;而位点Gm02,Gm06,Gm08,Gm09和Gm10等扩增效果稳定且遗传多态性丰富。这5个稳定扩增的微卫星位点平均等位基因数量(NA)为7.417~12.500,平均观察杂合度(Ho)为0.366~0.655,平均期望杂合度(He)为0.642~0.846,多态信息含量(PIC)为0.800~0.935。【结论】本研究成功筛选出位点Gm02,Gm06,Gm08,Gm09和Gm10等5个微卫星位点。基于这5个微卫星位点标记的结果显示,山东和陕西不同梨小食心虫地理种群均具有丰富的遗传多样性。这5个位点可以适用于我国梨小食心虫种群的进一步遗传分析研究。 展开更多
关键词 梨小食心虫 地理种群 微卫星位点 扩增稳定性 遗传多态性 无效等位基因
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细胞色素P450酶的研究进展 被引量:6
18
作者 周园 胡艳丽 +1 位作者 李丽燕 吴越 《农垦医学》 2002年第3期224-226,共3页
关键词 无效等位基因 遗传多态性 基因多态性 P450 细胞色素
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Inheritance Pattern of Microsatellite Loci and Their Use for Kinship Analysis in the Japanese Scallop Patinopecten yessoensis 被引量:3
19
作者 XU Kefeng LI Qi 《Journal of Ocean University of China》 SCIE CAS 2009年第2期184-190,共7页
The inheritance mode of seven microsatellite markers was investigated in Patinopecten yessoensis larvae from four con-trolled crosses,and the feasibility of using these markers for kinship estimation was also examined... The inheritance mode of seven microsatellite markers was investigated in Patinopecten yessoensis larvae from four con-trolled crosses,and the feasibility of using these markers for kinship estimation was also examined. All the seven microsatellite loci were compatible with Mendelian inheritance. Neither sex-linked barriers to transmission nor major barriers to fertilization between gametes from the parents were evident. Two of the seven loci showed the presence of null alleles in two families,suggesting the need to conduct comprehensive species-specific inheritance studies for microsatellite loci used in population genetic studies. However,even if the null allele heterozygotes were considered as homozygotes in the calculation of genetic distance,offspring from four families were all unambiguously discriminated in the neighbor-joining dendrogram. This result indicates that the microsatellite markers used may be capable of discriminating between related and unrelated scallop larvae in the absence of pedigree information,and of investigating the effective number of parents contributing to the hatchery population of the Japanese scallop. 展开更多
关键词 微卫星位点 虾夷扇贝 遗传模式 亲缘关系分析 日本 无效等位基因 微卫星标记 孟德尔遗传
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鲤科鱼蓝黑鲮微卫星位点的种间扩增(英文) 被引量:1
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作者 Rajeev Kumar SINGH Kuldeep Kumar LAL +2 位作者 Vindhya MOHINDRA Peyush PUNIA Wazir Singh LAKRA 《动物学报》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2008年第5期937-940,共4页
本研究使用105对微卫星引物对7种鲤科鱼类进行跨越种间PCR扩增,共得到14个多态性微卫星位点。其中9个扩增效果较好的位点用于分析来自帕吉勒提河(Bhagirathi,n=20)和戈达瓦里河(Godavari,n=25)的蓝黑鲮(Labeocalbasu)样品的遗传多样性... 本研究使用105对微卫星引物对7种鲤科鱼类进行跨越种间PCR扩增,共得到14个多态性微卫星位点。其中9个扩增效果较好的位点用于分析来自帕吉勒提河(Bhagirathi,n=20)和戈达瓦里河(Godavari,n=25)的蓝黑鲮(Labeocalbasu)样品的遗传多样性。结果显示,前者在每个位点的平均等位基因数为7.33,而后者为8.11,期望杂合度介于0.795(Bhagirathi)和0.801(Godavari)之间;4个位点MFW11*(Godavari)、R1*(Godavari)、R3*(Bhagirathi)和Lr38*(Bhagirathi和Godavari)都表现出明显的杂合子缺失和哈迪温伯格平衡偏离;而任意两位点间都未观测到连锁不平衡现象;位点R3*极可能存在无效等位基因。上述结果表明这些多态性微卫星位点作为共显性标记在蓝黑鲮群体遗传学研究中有着较好的应用前景。 展开更多
关键词 蓝黑鲮 跨越种间扩增 微卫星位点 多态性 遗传变异 无效等位基因
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