旧院黑鸡TYR基因第四内含子中ALV的插入频率和类型研究

有研究表明TYR基因第四内含子中ALV的插入缺失与禽类的羽毛颜色有关,本研究旨在探讨旧院黑鸡TYR基因第四内含子中ALV的插入频率和类型,为进一步探讨其与旧院黑鸡羽毛颜色的相关性提供参考。采用双重PCR对ALV插入整合进行检测、测序,DNA测序序列通过相关分子生物学软件比对与分析,从而分析序列中的识别位点和突变位点。用引物Diag05-dw进行测序,可以看出在不含ALV插入整合频率的N片段中,只存在一个6 bp的识别位点5′-CAGTGT-3′;将不含ALV插入整合频率的N片段的测序结果与参考序列DQ118702.1进行比对,共发现有5个SNP,这5个SNP都位于第四内含子,重要的识别位点5′-CAGTGT-3′存在一个SNP位点5890 G/A。

EAV-HP在两个绿壳蛋鸡群体中的插入整合研究

本试验旨在利用特定DNA分子标记筛选绿壳蛋鸡,为后期组建原产地地方品种绿壳蛋鸡核心群奠定基础。选择两个绿壳蛋鸡群体(四川省地方品种旧院黑鸡群体和贵州长顺绿壳蛋鸡群体)采用双重PCR对EAV-HP的插入整合进行检测、测序,DNA测序序列通过相关分子生物学软件比对与分析,分析序列中的突变位点。研究表明,大量EAV-HP存在于两个群体中,其中四川省地方品种旧院黑鸡群体的LC基因频率有65%,长顺绿壳蛋鸡群体的LC基因频率达到了100%。含有LC/LC和LC/N基因型的蛋鸡都产绿壳蛋,因此贵州长顺绿壳蛋鸡群体产绿壳蛋的频率最高,达到100%,而四川省地方品种旧院黑鸡群体产绿壳蛋的频率相对较低,达到95%。所检测的四川省地方品种旧院黑鸡群体符合Hardy-Weinberg平衡状态(P>0.05),贵州长顺绿壳蛋鸡群体在此位点处于Hardy-Weinberg不平衡状态(P<0.01)。