目的克隆细粒棘球绦虫糖转运体早期响应脱水蛋白(Sugar transporter early responsive to dehydration 6 of Echinococcus granulosus,EgERD6)基因序列,并进行生物信息学分析。方法从细粒棘球绦虫中通过RT-PCR方法扩增EgERD6基因全长序...目的克隆细粒棘球绦虫糖转运体早期响应脱水蛋白(Sugar transporter early responsive to dehydration 6 of Echinococcus granulosus,EgERD6)基因序列,并进行生物信息学分析。方法从细粒棘球绦虫中通过RT-PCR方法扩增EgERD6基因全长序列,结合生物信息学方法预测EgERD6蛋白分子的生物学特性,并进行系统发育、同源序列比对以及多蛋白相互作用关系分析。结果克隆获得EgERD6基因全长序列,共1470 bp,编码488 aa蛋白,该蛋白具有主要协同转运蛋白超家族(Major facilitator superfamily,MFS)特征结构域。生物信息学分析该蛋白为疏水性蛋白,二级结构以α螺旋为主,约占50.92%。氨基酸序列比对显示该蛋白与多房棘球绦虫的同源性为97.48%,与其他物种同源性较低。系统进化分析显示,细粒棘球绦虫ERD6与人ERD6亲缘关系较远。该蛋白可与细粒棘球绦虫内啡肽-A3、网格蛋白、肝细胞生长因子调节的酪氨酸激酶底物等多种蛋白质共同参与内吞作用和囊泡介导转运等生物学过程。结论成功克隆了EgERD6基因,生物信息学分析其编码蛋白含有MFS保守的功能结构域,可能参与虫体多种重要物质及能量代谢过程,为囊型棘球蚴病的致病机制研究和新的临床治疗方案的探索奠定了基础。展开更多
文摘目的克隆细粒棘球绦虫糖转运体早期响应脱水蛋白(Sugar transporter early responsive to dehydration 6 of Echinococcus granulosus,EgERD6)基因序列,并进行生物信息学分析。方法从细粒棘球绦虫中通过RT-PCR方法扩增EgERD6基因全长序列,结合生物信息学方法预测EgERD6蛋白分子的生物学特性,并进行系统发育、同源序列比对以及多蛋白相互作用关系分析。结果克隆获得EgERD6基因全长序列,共1470 bp,编码488 aa蛋白,该蛋白具有主要协同转运蛋白超家族(Major facilitator superfamily,MFS)特征结构域。生物信息学分析该蛋白为疏水性蛋白,二级结构以α螺旋为主,约占50.92%。氨基酸序列比对显示该蛋白与多房棘球绦虫的同源性为97.48%,与其他物种同源性较低。系统进化分析显示,细粒棘球绦虫ERD6与人ERD6亲缘关系较远。该蛋白可与细粒棘球绦虫内啡肽-A3、网格蛋白、肝细胞生长因子调节的酪氨酸激酶底物等多种蛋白质共同参与内吞作用和囊泡介导转运等生物学过程。结论成功克隆了EgERD6基因,生物信息学分析其编码蛋白含有MFS保守的功能结构域,可能参与虫体多种重要物质及能量代谢过程,为囊型棘球蚴病的致病机制研究和新的临床治疗方案的探索奠定了基础。