烟草早花相关基因ELF的生物信息学分析

普通烟草早花相关基因在生物胁迫和非生物胁迫条件下对烟草开花调控发挥着重要作用,但关于烟草早花相关基因和蛋白质的研究尚少。本研究利用生物信息学的方法,对普通烟草与番茄、辣椒、拟南芥和水稻等植物中早花相关ELF蛋白质进行理化性质预测、多序列比对、系统进化树构建、蛋白二级和三级结构以及组织表达特征分析。结果表明:9条烟草早花相关的ELF蛋白质均无跨膜结构和信号肽序列,为亲水性非分泌蛋白,且属于膜外蛋白;普通烟草ELF蛋白二级结构中α-螺旋的比例为61.82%,结构域主要由β-转角连接2个α-螺旋组成。烟草ELF基因在进化过程中保守性相对较强,结构变化不大,与辣椒植物同源关系较近。NtELF42、NtELF43、NtELF44和NtELF46具有的磷酸化位点较多,推测在开花过程中可能具有信号转导的作用,调控花芽组织分化等功能。烟草ELF基因具有组织表达特异性,暗示了这些蛋白参与了不同组织的生长发育阶段。