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时空转录组研究进展
被引量:
1
1
作者
肖宇彬
张子旭
+2 位作者
王玉珠
刘欢
陈乐天
《植物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第2期214-232,共19页
时空异质性是造成不同组织功能差异的关键因素,在细胞命运调控过程中发挥重要作用。时空转录组(stRNA-seq)是一项将定量转录组与高分辨率组织成像相结合的新兴组学技术。它将表达数据锚定到目标器官或组织的物理图上,并以无偏见的生物...
时空异质性是造成不同组织功能差异的关键因素,在细胞命运调控过程中发挥重要作用。时空转录组(stRNA-seq)是一项将定量转录组与高分辨率组织成像相结合的新兴组学技术。它将表达数据锚定到目标器官或组织的物理图上,并以无偏见的生物信息学方式对组织切片和细胞层进行分子表征,反映特定细胞内基因的时空异质性表达丰度。受益于高通量测序技术的快速发展,时空转录组为探究各类细胞基因表达的时空异质性提供了新的实验思路和方法。该文介绍了时空转录组的原理和发展进程,以及不同时空转录组的技术特点和优劣,总结了时空转录组在动物、植物和微生物中的应用,可为今后系统开展时空转录组研究提供理论参考。
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关键词
时空转录组学
时空
异质性
单细胞
原文传递
题名
时空转录组研究进展
被引量:
1
1
作者
肖宇彬
张子旭
王玉珠
刘欢
陈乐天
机构
华南农业大学生命科学学院
深圳华大生命科学研究院
岭南现代农业科学与技术广东省实验室深圳分中心
出处
《植物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第2期214-232,共19页
基金
国家自然科学基金创新研究群体(No.31921004)
中国博士后基金(No.2022M711210)。
文摘
时空异质性是造成不同组织功能差异的关键因素,在细胞命运调控过程中发挥重要作用。时空转录组(stRNA-seq)是一项将定量转录组与高分辨率组织成像相结合的新兴组学技术。它将表达数据锚定到目标器官或组织的物理图上,并以无偏见的生物信息学方式对组织切片和细胞层进行分子表征,反映特定细胞内基因的时空异质性表达丰度。受益于高通量测序技术的快速发展,时空转录组为探究各类细胞基因表达的时空异质性提供了新的实验思路和方法。该文介绍了时空转录组的原理和发展进程,以及不同时空转录组的技术特点和优劣,总结了时空转录组在动物、植物和微生物中的应用,可为今后系统开展时空转录组研究提供理论参考。
关键词
时空转录组学
时空
异质性
单细胞
Keywords
spatiotemporal transcriptomics
spatial and temporal heterogeneity
single cell
分类号
Q811.4 [生物学—生物工程]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
时空转录组研究进展
肖宇彬
张子旭
王玉珠
刘欢
陈乐天
《植物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023
1
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