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星斑蛾蚋全线粒体基因组序列测定及分析
被引量:
1
1
作者
闫俊
陈汕
+1 位作者
贾俊清
尤平
《应用昆虫学报》
CAS
CSCD
北大核心
2017年第1期35-44,共10页
[目的]蝇蛆病分布广泛,是一类主要由双翅目昆虫的幼虫引发的寄生虫病。蛾蚋幼虫是毛蠓科昆虫中可引发人体蝇蛆病的最常见物种之一。星斑蛾蚋Psychoda alternata线粒体基因组全序列对研究这类致病昆虫的系统地位具有重要的意义,也为预防...
[目的]蝇蛆病分布广泛,是一类主要由双翅目昆虫的幼虫引发的寄生虫病。蛾蚋幼虫是毛蠓科昆虫中可引发人体蝇蛆病的最常见物种之一。星斑蛾蚋Psychoda alternata线粒体基因组全序列对研究这类致病昆虫的系统地位具有重要的意义,也为预防和治疗蝇蛆病提供理论基础。[方法]本文利用DNA测序和克隆技术,对星斑蛾蚋的线粒体基因组进行了初步研究。[结果]研究表明:星斑蛾蚋线粒体基因组全长15 908bp,由蛋白质编码基因、tRNA基因、rRNA基因和非编码A+T富含区构成。两条链(J链和N链)共编码了37个基因。全序列碱基百分含量为39.6%A,40.3%T,11.8%C,8.3%G,全基因组序列的A+T含量为79.9%。[结论]星斑蛾蚋线粒体基因组组成和排序与典型的昆虫mtDNA一致。分布于J链的蛋白质基因有9种,而N链上有4种,其碱基含量在两条链上呈不对称现象不明显。基于线粒体13种蛋白质编码基因的26种双翅目昆虫系统发育分析表明毛蠓科与伪蚊科为姐妹群。
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关键词
双翅目
毛蠓科
星斑蛾蚋
线粒体基因组
系统发育分析
原文传递
基于coi基因的海南星斑蛾蚋分子鉴定及系统发育分析
被引量:
2
2
作者
卢西西
陈子杰
+2 位作者
解芸芸
夏琪
芦亚君
《医学动物防制》
2022年第5期467-471,共5页
目的采用DNA条形码coi基因对海南省文昌市采集的双翅目毛蠓科未知昆虫进行分子鉴定,建立标准化分子鉴定流程,并为相关疾病的流行风险提供防控依据。方法诱蚊灯法采集海南省文昌市双翅目毛蠓科昆虫,碱裂解法提取基因组DNA,PCR扩增coi基...
目的采用DNA条形码coi基因对海南省文昌市采集的双翅目毛蠓科未知昆虫进行分子鉴定,建立标准化分子鉴定流程,并为相关疾病的流行风险提供防控依据。方法诱蚊灯法采集海南省文昌市双翅目毛蠓科昆虫,碱裂解法提取基因组DNA,PCR扩增coi基因出现特异性条带的产物进行Sanger测序,序列在NCBI中进行BLAST同源比对,结合形态学特征初步确定物种。使用MEGA X软件通过计算遗传距离、构建系统发育树进行分子进化分析。结果出现特异性条带的5个PCR产物经测序、同源比对后,与星斑蛾蚋序列相似性最高,确定该物种为星斑蛾蚋(Psychoda alternata)。海南省文昌市星斑蛾蚋coi序列的核苷酸中A+T平均含量为69.42%,G+C平均含量为30.58%,具有A+T偏好性。系统发育树呈现海南省文昌市星斑蛾蚋分别与巴基斯坦、日本的星斑蛾蚋系统发育关系最接近。结论基于coi基因的DNA条形码技术可用于星斑蛾蚋的分子鉴定。星斑蛾蚋在环境中的存在,提示有发生蝇蛆病的风险。
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关键词
双翅目
星斑蛾蚋
COI基因
DNA条形码
分子鉴定
系统发育分析
原文传递
题名
星斑蛾蚋全线粒体基因组序列测定及分析
被引量:
1
1
作者
闫俊
陈汕
贾俊清
尤平
机构
陕西师范大学生命科学学院
出处
《应用昆虫学报》
CAS
CSCD
北大核心
2017年第1期35-44,共10页
基金
自然科学基金(31372158)
文摘
[目的]蝇蛆病分布广泛,是一类主要由双翅目昆虫的幼虫引发的寄生虫病。蛾蚋幼虫是毛蠓科昆虫中可引发人体蝇蛆病的最常见物种之一。星斑蛾蚋Psychoda alternata线粒体基因组全序列对研究这类致病昆虫的系统地位具有重要的意义,也为预防和治疗蝇蛆病提供理论基础。[方法]本文利用DNA测序和克隆技术,对星斑蛾蚋的线粒体基因组进行了初步研究。[结果]研究表明:星斑蛾蚋线粒体基因组全长15 908bp,由蛋白质编码基因、tRNA基因、rRNA基因和非编码A+T富含区构成。两条链(J链和N链)共编码了37个基因。全序列碱基百分含量为39.6%A,40.3%T,11.8%C,8.3%G,全基因组序列的A+T含量为79.9%。[结论]星斑蛾蚋线粒体基因组组成和排序与典型的昆虫mtDNA一致。分布于J链的蛋白质基因有9种,而N链上有4种,其碱基含量在两条链上呈不对称现象不明显。基于线粒体13种蛋白质编码基因的26种双翅目昆虫系统发育分析表明毛蠓科与伪蚊科为姐妹群。
关键词
双翅目
毛蠓科
星斑蛾蚋
线粒体基因组
系统发育分析
Keywords
Diptera, Psychodidae, Psychoda alternata, mitochondrial genome, phylogenetic analyses
分类号
R384 [医药卫生—医学寄生虫学]
原文传递
题名
基于coi基因的海南星斑蛾蚋分子鉴定及系统发育分析
被引量:
2
2
作者
卢西西
陈子杰
解芸芸
夏琪
芦亚君
机构
海南医学院热带医学院
西安交通大学基础医学院病原生物学与免疫学系
出处
《医学动物防制》
2022年第5期467-471,共5页
基金
海南省自然科学基金(2019RC223)。
文摘
目的采用DNA条形码coi基因对海南省文昌市采集的双翅目毛蠓科未知昆虫进行分子鉴定,建立标准化分子鉴定流程,并为相关疾病的流行风险提供防控依据。方法诱蚊灯法采集海南省文昌市双翅目毛蠓科昆虫,碱裂解法提取基因组DNA,PCR扩增coi基因出现特异性条带的产物进行Sanger测序,序列在NCBI中进行BLAST同源比对,结合形态学特征初步确定物种。使用MEGA X软件通过计算遗传距离、构建系统发育树进行分子进化分析。结果出现特异性条带的5个PCR产物经测序、同源比对后,与星斑蛾蚋序列相似性最高,确定该物种为星斑蛾蚋(Psychoda alternata)。海南省文昌市星斑蛾蚋coi序列的核苷酸中A+T平均含量为69.42%,G+C平均含量为30.58%,具有A+T偏好性。系统发育树呈现海南省文昌市星斑蛾蚋分别与巴基斯坦、日本的星斑蛾蚋系统发育关系最接近。结论基于coi基因的DNA条形码技术可用于星斑蛾蚋的分子鉴定。星斑蛾蚋在环境中的存在,提示有发生蝇蛆病的风险。
关键词
双翅目
星斑蛾蚋
COI基因
DNA条形码
分子鉴定
系统发育分析
Keywords
Diptera
Psychoda alternate
coi gene
DNA barcode
Molecular identification
Phylogenetic analysis
分类号
Q969.441.7 [生物学—昆虫学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
星斑蛾蚋全线粒体基因组序列测定及分析
闫俊
陈汕
贾俊清
尤平
《应用昆虫学报》
CAS
CSCD
北大核心
2017
1
原文传递
2
基于coi基因的海南星斑蛾蚋分子鉴定及系统发育分析
卢西西
陈子杰
解芸芸
夏琪
芦亚君
《医学动物防制》
2022
2
原文传递
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