2020-2022年海南省诺如病毒胃肠炎暴发疫情分子流行特征分析

目的 了解海南省2020—2022年诺如病毒暴疫情分子流行特征及诺如病毒流行株基因组进化情况。方法 收集2020年1月至2022年12月诺如病毒暴发信息及标本,应用实时荧光反转录聚合酶链式反应对样本进行诺如病毒检测,阳性样本通过RT-PCR扩增、测序和序列分析;对其中8株诺如病毒毒株进行基因组扩增和序列分析。结果 2020年1月至2022年12月,共报告胃肠炎暴发39起,通过检测确定诺如病毒引起的暴发共25起,主要发生在托幼机构和学校(20/25,80%)。诺如病毒暴发主要集中在海口周围县(东北部),包括定安(5起)、文昌(4起)、澄迈(4起)和临高(3起);其次集中在中西部,包括白沙(2起)、乐东(2起)和东方(3起);东南部万宁1起。2~17岁诺如病毒阳性构成比男性高于女性,大于55岁年龄组诺如病毒阳性构成比女性高于男性,18~40岁阳性检出性别与职业相关。根据RT-PCR分型及测序,13起诺如病毒暴发获得分型结果,均为GⅡ组诺如病毒,检出4种基因型,GⅡ.2[P16]为主要流行株,占60%(9/13),其他3种基因型为GII.4 Sydney[P31](15.4%,2/13)和GⅡ.4 Sydney[P16](7.7%,1/13)和GII.3[P12](7.7%,1/13)。进一步对8株诺如病毒基因组分析,仍与先前毒株处于同一份分支,且均出现一定数量氨基酸变异。结论 诺如病毒是引起海南地区胃肠炎暴发的主要病原,GⅡ.2[P16]为主要流行株。持续开展及加强该项监测为海南地区诺如病毒暴发疫情的防控提供科学依据。

2019—2021年深圳地区诺如病毒暴发分子流行特征

目的了解深圳地区2019—2021年诺如病毒暴发分子流行特征。方法收集2019年1月至2021年12月诺如病毒暴发信息及标本,应用实时荧光反转录聚合酶链式反应样本进行诺如病毒检测,阳性样本通过RT-PCR扩增、测序和序列分析;对其中3株GII.2[P16]进行基因组扩增和序列分析。结果2019年1月至2021年12月,共报告诺如病毒暴发246起,主要发生在幼儿园(132,53.66%)和小学(52,21.14%)。每起暴发发病数范围为3~130,中位数为8。每年11月至次年3月为诺如病毒暴发的流行高峰。211起暴发分型成功,GI和GII分别检出7种和11种基因型,78起(36.97%)诺如病毒暴发由GII.2[P16]引起。对GII.2[P16]基因组分析表明,深圳2020年暴发株仍属于GII.2[P16](2016-2017)亚群,在非结构蛋白P22(L777S)和3C蛋白酶(A1047V和P1074T)上出现氨基酸变异。结论GII.2[P16]是2019年1月至2021年12月引起深圳市诺如病毒暴发的流行株,主要发生在学校和幼儿园,持续监测和基因组分析有助于发现流行株的变异和新毒株的出现。

白银市2005-2015年流行性感冒监测分析

目的了解白银市2005-2015年流感流行特征,评价监测工作进展,为流感防控提供科学依据。方法收集流感常规疫情报告、哨点医院监测、暴发疫情监测资料以及病原学检测结果,使用Excel 2010和SPSS 19.0软件进行统计分析。结果白银市2005-2015年共报告流感病例6161例,年均报告发病率为31.91/10万,局部暴发疫情、流感大流行与全市发病率增高密切相关。哨点医院报告流感样病例（ILI）16888例,年均ILI就诊百分比（ILI%）为1.52%,各年度ILI%、两家医院ILI%的差异均有统计学意义（χ^2=3144.424,P〈0.01;χ^2=489.758,P〈0.01）;ILI流行高峰与流感暴发疫情高峰期基本相同;ILI核酸检测阳性率为15.96%,病毒分离率为17.33%,各年度核酸检测阳性率、毒株型别构成比的差异均有统计学意义（χ^2=488.533,P〈0.01;χ^2=537.383,P〈0.01）。全市报告42起ILI暴发疫情,主要发生在中小学校,病毒型别为甲型H1N1型、B型、季节性H3N2型。结论白银市流感监测工作取得一定成绩,还需加强哨点医院监测、学校暴发疫情的监测与防控工作。