鸡OBR基因第20外显子多态性与脂肪性状的相关研究

对鸡OBR基因的单链构象多态性进行检测,在第20 外显子发现了一个新的单核苷酸多态位点。克隆测序了2种纯合子片段,在第20外显子编码区的860位碱基确认了一个由T变为C的突变,编码的氨基酸由缬氨酸突变为丙氨酸。在一个地方鸡杂交群体中检验这一多态位点与脂肪性状的相关,建立固定效应模型进行最小二乘分析,对脂肪性状的不同基因型效应进行差异显著性检验。结果表明:试验群体中AA、AB、BB基因型频率分别为0.641、0.292和0.067。不同基因型对各组杂交肉鸡腹脂率、皮下脂肪厚、肌间脂宽和肌内脂肪含量的效应均不显著(P>0.05),说明这一外显子片段上的变异位点并不是导致脂肪性状产生差异的原因。此结果为进一步研究鸡OBR基因多态性及其功能提供参考,并为丰富基因图谱的标记提供理论依据。

鸡OBR基因第20外显子多态性与脂肪性状的相关研究

对鸡OBR基因的单链构象多态性进行检测，在第20外显子发现了1个新的单核苷酸多态位点。克隆测序了2种纯合子片段，在第20外显子编码区的860位碱基确认了1个由T变为C的突变，编码的氨基酸由缬氨酸突变为丙氨酸。在1个地方鸡杂交群体中检验这一多态位点与脂肪性状的相关，建立固定效应模型进行最小二乘分析，对脂肪性状的不同基因型效应进行差异显著性检验。结果表明：试验群体中AA、AB、BB基因型频率分别为0．641、0．292和0．067。

一个SNP问题的多项式时间算法

讨论关于单体型的无间隙的最小单核苷酸多态性位点的移去问题.通过分析其对应图模型的性质讨论问题等价形式;证明求解该问题等价于求对应图的最大独立集与独立数;给出求最大独立集与独立数的算法,从而得到此问题的有效的多项式时间算法.

Ex-FABP作为鸡腹脂性状主要候选基因的研究

细胞外脂肪酸结合蛋白(extracellular fatty acid-binding protein,Ex-FABP)基因是脂肪酸结合蛋白(fatty acid-binding protein,FABP)家族的另一成员,参与鸡的脂肪酸、肌纤维、骨骼等调控过程.利用PCR-SSCP(single strand conformation polymorphism)和DNA测序的方法,对不同品种的杂交鸡进行了Ex-FABP基因5'调控区部分序列的多态性分析,发现了3个单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms,SNPs)位点.其中,此片段中的碱基C(-1000)的插入和碱基T→C(-1011)的突变,导致此处比野生型基因少了1个cap,多了1个Nkx-2、1个AhR/Ar和2个CF1等转录因子结合位点的产生.利用SAS软件对Ex-FABP基因5'调控区的SNPs与屠体性状的最小二乘分析,发现基因型BB(突变型)与腹脂重存在极显著相关(P<0.01).研究结果表明,细胞外脂肪酸结合蛋白(Ex-FABP)基因是影响脂肪沉积、控制腹脂性状的主要候选基因.

人类基因组单体型图计划及其意义

人类基因组单体型图计划自提出以来一直是学术界讨论的热点问题之一,其目标是构建人 类DNA序列中多态位点的常见模式,即单体型图(haplotype map),简称HapMap。HapMap将成为人们 确定对人类健康和疾病,以及对药物和环境反应有影响的相关基因的关键信息。本文将从单核苷酸多 态性(single nucleotide polymorphism,SNP)入手,逐步解析构建人类基因组单体型图的基本概念、基本 理论及经典实验,并对其应用价值进行评价。