一种最长扩展公共子序列新算法

在最长填充公共子序列问题中提出一种新问题:假设有一个完整序列C和一个不完整序列Q,长度分别为m和n,Q中丢失的元素为相邻的相同元素,要求寻找一个丢失前的序列Q,使得C和Q具有最长的公共子序列。针对此问题,首先将Q中每个元素复制m-1个并插入Q中原来的位置,生成长度为mn的扩展序列Q^(*),然后证明了C和Q的最长扩展公共子序列是两序列C和Q^(*)的最长公共子序列,最后提出一种时空复杂度为O(mn)的最长扩展公共子序列求解新算法,并用轨迹实验证明了该算法对强噪声干扰和轨迹点丢失的同时有效性。

伊犁马与哈萨克马背最长肌脂质代谢与转录组分析

本研究旨在通过比对伊犁马与哈萨克马背最长肌的差异表达基因,筛选与马脂质代谢相关的候选功能基因。以伊犁马和哈萨克马为研究对象,采集所选马匹背最长肌样本,对所采样本进行脂质代谢和转录组检测,筛选脂质代谢差异代谢物及差异表达基因,并对筛选出的差异表达基因进行富集分析。结果显示,与哈萨克马相比,伊犁马背最长肌中共筛选出21种显著下调的脂质差异代谢物;两组肌肉样本中共筛选出718个差异表达基因,与哈萨克马相比,伊犁马中有300个基因表达显著上调,418个基因表达显著下调;差异表达基因显著富集在78个GO条目中,其中与脂质代谢相关的主要有蛋白质转运、有机物运输、细胞质、钙离子结合和ATP酶活性等;KEGG显著富集在41条通路中,其中与脂质代谢相关的通路主要有脂质与动脉粥样硬化、糖尿病性心肌病、丙酸代谢和EGFR酪氨酸激酶抑制剂耐药性等。本研究初步确定了APOA1、MPC1、ACOX1、EGF、VLDLR、GAS6和ABCA1等7个基因参与了马脂质代谢,为马脂质代谢的分子机制研究提供了数据参考。

不同日龄桃源黑猪肝脏及背最长肌中硒含量和硒蛋白表达的变化研究

为研究不同日龄桃源黑猪肝脏及背最长肌中硒含量和硒蛋白表达的变化,本实验分别于1、21、80、185日龄采集桃源黑猪肝脏及背最长肌样品,测定其中硒含量、硒蛋白mRNA相对表达量以及谷胱甘肽过氧化物酶(GPX)、硫氧还蛋白还原酶(TrxR)和硒蛋白P(SELP)的蛋白浓度。结果表明:桃源黑猪肝脏和背最长肌中GPX1、GPX2、GPX3、GPX4、TXNRD1、TXNRD2、DIO1、DIO2、DIO3、SELF、SELH、SELM、SELN、SELP、SELR、SELS、SELW和SPS2的mRNA相对表达量随日龄发生了显著变化。桃源黑猪肝脏及背最长肌中GPX、TrxR和SELP蛋白浓度随日龄的增加呈现上升趋势,且在185日龄时的蛋白浓度均显著高于1日龄。在肝脏中,21日龄的硒含量显著低于1、80、185日龄,且185日龄的硒含量显著高于1、80日龄;在背最长肌中,21日龄的硒含量显著高于1日龄,80、185日龄的硒含量显著高于1、21日龄。在1、80、185日龄时,肝脏和背最长肌中的GPX、TrxR和SELP蛋白浓度与硒含量均呈现不同程度的正相关性;而在21日龄时,GPX、TrxR和SELP蛋白浓度与硒含量在肝脏中呈不同程度的负相关性,在背最长肌中呈正相关。本研究发现日龄是影响桃源黑猪肝脏和背最长肌中硒蛋白表达的重要因素,其影响具有组织特异性。同时,肝脏和背最长肌中的硒蛋白沉积量和抗氧化能力随日龄的增加而增加,背最长肌中的硒沉积量随日龄的增加而增多。

华西牛与雪龙黑牛背最长肌重量的全基因组关联分析

为了筛选华西牛和雪龙黑牛背最长肌重量相关的遗传标记和候选基因,试验以1478头华西牛和452头雪龙黑牛为研究对象,对其背最长肌重量性状进行全基因组关联分析(genome-wide association study,GWAS),即测定其屠宰后背最长肌重量表型数据,利用Illumina Bovine-HD(770K)芯片对其基因组进行基因分型,采用FarmCPU模型和GEMMA模型对质控后的芯片数据进行GWAS,挖掘与华西牛和雪龙黑牛背最长肌重量显著相关的单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)位点和候选基因。结果表明:华西牛与雪龙黑牛群体背最长肌重量表型性状均符合正态分布,且二者芯片数据经过质控后分别得到607198,511320个SNP位点,这些SNP位点在二者各个染色体上的分布比较均匀;利用FarmCPU模型在华西牛与雪龙黑牛群体分别检测到12个和9个与其背最长肌重量显著相关的SNP位点,且华西牛群体的显著SNP位点分别位于1,5,7,11,12,13,15,16,22,23号染色体上,鉴定到KCNAB1、PFN2、RNF13、TTLL1、MCAT、CREB3L3、ZBTB7A、MAP2K2、CAMKMT、ZC3H13、OPTN、MCM10、UCMA、OVOL2、PET117、KAT14、MAML2、HHAT、FHIT和LY86共20个候选基因;雪龙黑牛群体的SNP位点分别位于4,16,27号染色体上,鉴定到PCLO、DCTD、WWC2共3个候选基因;利用GEMMA模型在华西牛与雪龙黑牛群体中分别检测到6个与其背最长肌重量显著相关的SNP位点,其中华西牛群体的SNP位点位于13号染色体上,鉴定到GATA3、TAF3、ODAD2、SNX5、MGME1、OVOL2、KAT14、PET117共8个候选基因;雪龙黑牛群体的SNP位点位于1,4,5,25号染色体上,但未鉴定到有效的候选基因。说明在华西牛和雪龙黑牛群体中分别检测到的18个和15个SNP位点与注释到的25个和3个候选基因可作为改良牛背最长肌重量的新的分子标记和候选基因。

不同地区牛背最长肌营养成分对比分析

探索不同地区牛背最长肌的氨基酸、脂肪酸、微量元素等营养成分含量的差异。试验选取贵州、内蒙、新疆地区各6头36月龄左右公牛的牛背最长肌进行营养成分测定。结果表明:(1)内蒙地区牛背最长肌中甘氨酸、脯氨酸、丙氨酸等含量均显著高于贵州和新疆地区(P<0.05);(2)内蒙地区牛背最长肌中硬脂酸、油酸等含量极显著高于贵州和新疆地区(P<0.01);(3)贵州地区牛背最长肌中牛磺酸含量显著高于内蒙和新疆地区(P<0.05);(4)新疆地区牛背最长肌中总胆固醇含量极显著低于贵州和内蒙地区(P<0.01)。综上所述,内蒙地区氨基酸、脂肪酸含量高;贵州地区牛磺酸含量高;新疆地区胆固醇含量低。

最长捕获时间约束下的有利提前角

考虑复杂射击条件下的声自导鱼雷攻潜过程,提出了最长捕获时间约束下的鱼雷有利提前角计算方法。建立了鱼雷射击提前角的坐标法求解模型,给出鱼雷捕获目标的约束条件,给出了最长捕获时间约束下的有利提前角求解步骤,最后分别针对目标定速直航运动和匀加速直线运动进行仿真验证。

水利行业最长斜井TBM下洞运输选择论证

随着TBM在隧道掘进中的广泛应用,TBM运输尤为重要。滇中引水香炉山隧道3-1#施工支洞长1432m,最大纵坡14.3°(综合坡比25.5%),坡度极大,是国内水利行业最长斜井TBM下洞运输。为探索长斜井陡坡运输,文章从车辆刹车,避免打滑溜车,TBM超大、超重件、普货运输车辆选择(牵引头、运输车、其他辅助措施),运输安全论证(主驱动、刀盘中心块、主梁)等方面进行计算论证。通过实践,证明该论证是合理的,可为类似工程提供借鉴。

海南黑山羊及其F1代杂交羊背最长肌转录组测序比较分析

为了鉴定和分析海南黑山羊与其F1代杂交羊(努比亚山羊公羊与海南黑山羊母羊杂交)背最长肌中差异表达的mRNA和lncRNA,试验以6月龄海南黑山羊及其F1代杂交羊公羊为试验动物,逐头采集背最长肌样品,采用RNA-Seq技术和生物信息学方法对两种山羊背最长肌进行转录组测序分析,运用DESeq软件鉴定两种山羊背最长肌组织间差异表达的mRNA和lncRNA,对差异表达基因进行GO功能注释、KEGG信号通路富集分析,同时对差异表达的lncRNA进行靶基因预测分析。结果表明:海南黑山羊及其F1代杂交羊背最长肌间存在276个差异表达的mRNA,其中1个mRNA只在海南黑山羊背最长肌中表达,2个mRNA只在F1代杂交羊背最长肌中表达;在273个共同表达的mRNA中,根据差异倍数大小,排名前10位的分别是NDUFB5、TMEM237、LOC102170968、TXLNB、GPR63、OSBPL1A、KERA、LOC108638040、BMF、HSP70.1。存在145个差异表达的lncRNA,其中16个只在海南黑山羊背最长肌中表达,7个只在F1代杂交羊背最长肌中表达。276个差异表达基因共富集在50个GO功能条目上,主要包括生物学过程、细胞组分和分子功能,富集的KEGG信号通路主要包括PI3K-AKI、细胞因子与细胞因子受体相互作用、趋化因子、MAPK和黏着斑信号通路。获得197个差异表达lncRNA顺式作用靶基因和142个差异表达lncRNA反式作用靶基因。说明海南黑山羊及其F1代杂交羊背最长肌具有不同表达水平的mRNA和lncRNA,两种山羊肌肉组织中均存在特异性表达的mRNA和lncRNA。

雷琼牛与陆丰牛背最长肌lncRNA表达特点及其相关ceRNA网络分析

旨在筛选雷琼牛与陆丰牛背最长肌差异表达lncRNAs、miRNAs以及mRNAs,通过构建lncRNA-miRNA-mRNA的竞争调控网络、搜寻lncRNA顺式靶向调控基因并进行功能预测,挖掘可供提升华南地区地方品种黄牛肉用价值的关键候选基因。本研究随机选取4月龄雌性雷琼牛与陆丰牛各4头,取背最长肌组织用于RNA测序,测序结果使用RT-qPCR验证。筛选两品种黄牛背最长肌差异表达lncRNAs、miRNAs和mRNAs,用于构建差异表达转录本的竞争调控网络以及搜寻lncRNA顺式靶向调控基因。候选基因使用GO和KEGG富集分析进行功能预测。结果表明,以雷琼牛为对照组,两个品种中存在119个差异表达的lncRNAs,其中73个上调表达,46个下调表达;差异表达的miRNAs共有13个,其中7个上调表达,6个下调表达;差异表达的mRNAs共有599个,其中155个上调表达,444个下调表达。竞争性调控网络中mRNAs的GO富集结果显示,与肌生成相关的条目主要为磷酸化以及膜结构等,KEGG富集结果中与肌生成相关的通路主要为Rap1、MAPK、PI3K-Akt等信号通路。顺式靶向调控基因的GO富集分析显示,与肌生成相关的GO条目主要为肌肉结构的发展、肌肉器官的发育等,KEGG富集结果中与肌生成相关的通路主要为MAPK信号传导途径以及局部粘附等。本研究筛选了雷琼牛与陆丰牛背最长肌差异表达lncRNAs、miRNAs以及mRNAs,构建了竞争调控网络并搜寻了lncRNA的顺式靶向调控基因,为进一步对华南地区地方品种黄牛肉用价值进行合理的开发与利用提供理论支持。

5种miRNA在牛背最长肌中表达及其与肉质性状相关性研究

为研究miRNA表达水平与牛肉质性状的相关性,本研究以新疆褐牛和哈萨克牛背最长肌组织为研究对象,采用荧光定量PCR技术检测了背最长肌组织中的miR-320a、miR-152、miR-143、miR-451、miR-125a表达情况。结果显示:新疆褐牛背最长肌组织中miR-320a、miR-152、miR-143、miR-451表达水平显著高于哈萨克牛,miR-125a表达水平显著低于哈萨克牛。相关性分析显示:miR-320a、miR-152、miR-143、miR-451、miR-125a与脂肪含量呈极显著正相关;miR-320a、miR-152与肉豆蔻酸含量呈显著正相关,miR-143与肉豆蔻酸含量呈极显著正相关,miR-152、miR-125a与棕榈烯酸呈显著负相关,miR-143与亚油酸呈显著负相关;miR-320a、miR-152、miR-143与失水率呈显著负相关;miR-320a、miR-143与黄度值、pH呈显著正相关;miR-320a与红度值呈显著正相关。结果表明:miR-320a、miR-152、miR-143、miR-125a表达量增加促进肌肉组织脂肪沉积,其中miR-152、miR-143、miR-125a通过改变脂肪酸组成从而增加脂肪含量;miR-320a、miR-152、miR-143表达量增加会显著降低背最长肌失水率,有助于提高肉出品率;miR-320a、miR-143表达量增加可使肉色变深,是影响肉色泽的重要遗传因素。

不同肉牛品种(杂交组合)背最长肌肉质特征

为评价平凉红牛肉品质特征,选择年龄、体重、体质相近及饲养管理水平相同的平凉红牛、杂交和牛及西门塔尔牛各6头,屠宰后取其背最长肌样品,对肉品质、营养成分、氨基酸和脂肪酸组成等测定和分析。结果表明:平凉红牛和杂交和牛背最长肌中的粗脂肪含量显著高于西门塔尔牛(P<0.05);杂交和牛背最长肌的失水率、熟肉率显著高于西门塔尔牛(P<0.05);杂交和牛背最长肌的剪切力显著低于西门塔尔牛(P<0.05);平凉红牛背最长肌中的必需氨基酸占总氨基酸的比例(40.15%)和必需氨基酸占非必需氨基酸的比例(67.04%)最高,特别是丙氨酸、脯氨酸、赖氨酸以及异亮氨基酸等风味氨基酸含量均显著高于杂交和牛和西门塔尔牛(P<0.05)。平凉红牛单不饱和脂肪酸含量和多不饱和脂肪酸/饱和脂肪酸值(0.15)低于杂交和牛,但n6多不饱和脂肪酸/n3多不饱和脂肪酸(n6/n3)值(4.71)较杂交和牛和西门塔尔牛更接近推荐值。从背最长肌的大理石纹、脂肪含量、脂肪酸和氨基酸组成等特征来看,平凉红牛的肉质,尤其是氨基酸组成的突出优势使其表现出良好的口感与风味,具有生产高端牛肉的潜力。

利用配对RNA-seq数据筛选显著差异背膘厚度松辽黑猪背最长肌差异表达基因

本研究旨在利用转录组测序技术鉴定松辽黑猪背最长肌组织中的差异表达基因(DEGs),找出与猪脂肪沉积相关的潜在候选基因。通过对松辽黑猪进行活体背膘厚测定,选择具有极端背膘厚的3对个体(高、低各3头)为研究对象。取背最长肌组织提取RNA,并对其进行双末端转录组测序,然后,基于edgeR包的配对方法筛选差异基因,并进行生物学功能富集分析。结果鉴定出590个差异表达基因,其中,188个基因在高背膘厚组猪背最长肌组织中高表达,402个基因在低背膘厚组猪背最长肌组织中高表达。通过生物学功能分析发现,有42条显著富集通路,鉴定出的与脂肪沉积相关的通路有脂肪酸代谢、不饱和脂肪酸的生物合成以及PPAR信号通路等,筛选出FABP3、FADS1、FADS2、OLR1、ACSL1、LIPA和PLIN2为脂肪沉积性状的候选基因。该研究结果为进一步探究松辽黑猪肌内脂肪分子调控机制提供了参考。

基于转录组分析挖掘平凉红牛背最长肌肉质性状候选基因

旨在挖掘与平凉红牛背最长肌营养成分含量相关的候选基因,以提高肉品质。本研究选用相同饲养条件下30月龄及750 kg的40头阉牛,测定蛋白质、脂肪和水分3种常规营养成分的含量,分别挑选表型数据具有极端差异的高、低组,每组3个重复。通过主成分分析和比较转录组分析筛选具有显著因子载荷基因(significant factor loading genes,SFLGs)和差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs),并进行富集分析。利用所有样本的转录组数据和表型数据进行加权基因共表达网络分析(weighted gene co-expression network analysis,WGCNA),筛选与表型相关的目标基因模块(r>0.35且P<0.05)与Hub基因(hub genes,HGs)。针对蛋白质、脂肪和水分含量3个性状分别鉴定到91、81和80个SFLGs(第一主成分PC1和第二主成分PC2)和18、85和338个DEGs,其中PC1和PC2共有的SFLGs分别有8、4和3个,具有显著因子载荷的DEGs分别有1、3和2个,富集分析结果与相应的表型相关。通过WGCNA分别筛选出2个目标基因模块及10、14和26个HGs,均鉴定到MYADML 2和ZBTB 14等关键候选基因,其可能在影响三者比例方面发挥重要作用。本研究通过鉴定影响3种常规营养成分含量的候选基因,挖掘到与肉质性状相关的关键基因。研究结果将为平凉红牛的育种工作提供理论基础,同时也为其他肉牛的品质育种提供参考。

一种带匹配路径约束的最长公共子序列长度算法

在带约束的最长公共子序列问题中提出一种特殊的新问题:假设有两序列Q和C,Q中指定的匹配位置序列I,计算两序列Q和C的最长公共子序列,且这个最长公共子序列的匹配路径必须经过位置序列I。针对此问题,该文提出一种带匹配路径约束的最长公共子序列算法。首先定义带匹配路径约束的最长公共子序列模型,其次推出该序列的性质,最后求出带匹配路径约束的最长公共子序列长度的基础算法和快速算法。基础算法和快速算法时间复杂度分别为O(mnt)和O(mn),m,n,t分别为序列Q,C,I的长度。

蓝塘猪与长白猪背最长肌全基因组DNA甲基化分析

【目的】分析蓝塘猪与长白猪背最长肌组织全基因组DNA甲基化水平,筛选2个猪品种的差异甲基化基因(DMG),为优质肉猪选育提供理论依据。【方法】利用全基因组亚硫酸氢盐测序(WGBS)技术,分析1日龄雄性蓝塘猪与长白猪背最长肌组织全基因组DNA的甲基化水平、差异甲基化区域(DMR)和DMG,并对DMG进行GO注释,揭示蓝塘猪与长白猪差异甲基化基因的功能。【结果】蓝塘猪和长白猪样本测序获得的原始序列数量分别为300005805和300012190条,有效序列数量分别为210334070和210758564条,有效序列与猪参考基因组的比对成功率分别为70.11%和70.25%,Bisulfite转化率分别为98.54%和98.36%。蓝塘猪全基因组范围内胞嘧啶(C)的甲基化率为4.07%,其中CG、CHG和CHH中胞嘧啶的甲基化率分别为74.50%,1.74%和1.51%;长白猪全基因组范围内胞嘧啶的甲基化率为4.44%,其中CG、CHG和CHH中胞嘧啶的甲基化率分别为76.92%,2.13%和1.87%。共检测出13126个差异性甲基化区域,总长度为3357954 bp,含有78234个胞嘧啶。68.50%的差异性甲基化区域分布在基因间区,25.74%分布在内含子,1.89%分布在外显子,1.85%分布在上游2 kb区域,1.78%分布在下游2 kb区域,0.24%分布在CpG岛。甲基化差异基因显著富集于凋亡过程的负调控、细胞迁移的正调控等24个GO条目,其中FAM135B、NR1H2、ID4、ZFPM2、FOXO1等5个基因与蓝塘猪和长白猪的脂肪代谢相关,长白猪FAM135B、NR1H2、ZFPM2和FOXO1的表达水平高于蓝塘猪,而ID4略低于蓝塘猪。【结论】明确了蓝塘猪和长白猪背最长肌组织全基因组DNA的甲基化情况,为深入研究2个猪种肉质差异的分子机制提供了基础数据。

晋汾白猪背最长肌肌纤维类型和能量代谢特性分析

为了探究晋汾白猪背最长肌肌纤维类型和能量代谢的特点,试验采集6月龄晋汾白猪和大白猪背最长肌,采用HE染色检测肌纤维的直径和密度;通过qRT-PCR分别检测生肌调节因子、肌纤维类型标记基因、氧化磷酸化、糖酵解活性以及线粒体活性相关基因的表达模式;PCR扩增晋汾白猪UCP3基因的CDS序列,并进行信号肽预测分析,采用qRT-PCR和Western blot检测晋汾白猪和大白猪中UCP3基因的表达特性。结果表明,相较于大白猪,晋汾白猪背最长肌肌纤维直径较小,密度较大;晋汾白猪背最长肌中生肌调节因子MyoD和MyoG的表达量较低;Ⅰ型肌纤维标记基因Myh7的表达量较高,Ⅱ型肌纤维标记基因Myh2、Myh4和Myh1的表达量均较低;糖酵解活性相关基因LDHA和LDHB、氧化磷酸化相关基因UQCRC2和NDUFA9以及线粒体活性相关基因ATP5A1和PGC1α的表达量均较低;晋汾白猪UCP3基因的CDS序列共有927个碱基,且不存在信号肽;晋汾白猪背最长肌中UCP3基因表达量和蛋白含量均显著低于大白猪;UCP3在晋汾白猪背最长肌和皮下脂肪组织中的表达量较高,且90 d晋汾白猪背最长肌中的表达量明显高于0、180 d。综上,晋汾白猪背最长肌肌纤维直径较小,I型肌纤维含量较高,Ⅱa型和Ⅱb型肌纤维含量较低,糖酵解和氧化磷酸化的活性较低,且UCP3的表达量低于大白猪。

基于双重检索修正域名系统的最长匹配规则

域名服务在Internet中具有重要作用,ENUM技术与域名解析结合在三网融合中被广泛应用,在域名服务领域BIND系统占比很高。对比RFC对最长匹配规则定义与BIND系统实现存在的差异,通过2类域名服务软件解析结果确认,提出双重检索的策略修正BIND系统,使得NAPTR记录的解析结果更符合标准RFC描述,为更多的标准服务定制化过程提供了思路,并在实网中部署了应用。

淮河流域最长连续无雨日特征及其与环流指数的关系

基于淮河流域1961~2020年38个气象站点的逐日降水数据,筛选出最长连续无雨日(CDD),采用M-K趋势检验、主成分分析、时滞相关分析、交叉小波变换等方法分析了淮河流域CDD的变化特征及其对12个环流指数的响应。结果表明,淮河流域CDD空间分布有明显的季节特征。夏季表现为西高东低分布特征,春季、秋季和冬季表现为北高南低分布特征;60年来,不同季节的CDD变化亦不同,其中秋季大部分站点CDD增加,流域有变干趋势,而冬季全部站点CDD减小,流域干旱减缓;不同时滞的CDD与WP、SOI和Nino4具有较好的相关性,与Nino4的相关性最强,Nino4对滞后4、5个月的CDD有明显增强作用,对滞后10、11个月的CDD有明显减弱作用;Nino4对CDD的显著影响主要集中在10~15个月共振周期上,且主要呈Nino4超前于CDD的显著负相关关系。研究结果对今后干旱预测防御及水资源管理具有一定参考意义。

基于状态压缩的最长公共上升子序列快速算法

探讨了最长公共上升子序列(LCIS)问题,在前人算法的基础上提出一种高效求解LCIS的动态规划算法。对于LCIS问题,分别使用最长公共子序列(LCS)和最长上升子序列(LIS)相结合的算法、动态规划算法、经过状态压缩的改进动态规划算法进行设计,并对后两种算法进行了实现。设计的状态压缩的动态规划算法,实现了LCIS的快速求解。通过分析这三种算法的时间和空间复杂度,最终提出了时间复杂度为O(mn)、空间复杂度为O(m)或O(n)的基于状态压缩的快速LCIS算法。

基于转录组测序的摘除卵巢藏姜母猪背最长肌脂代谢相关基因筛选与分析

【目的】探究摘除卵巢后藏姜母猪背最长肌脂肪沉积的动态规律,为揭示脂肪沉积的调控机制提供理论依据。【方法】于45日龄手术摘除藏姜母猪卵巢(试验组),对照组藏姜母猪在腹部相同部位进行创伤处理但不摘除卵巢。分别记录45、154和300日龄藏姜母猪的血清雌激素、甘油三酯和总胆固醇含量变化,300日龄屠宰采集背最长肌组织样品制作石蜡切片,并通过Illumina NovaSeq 6000测序平台完成测序。以|log2 Fold Change|>1且P<0.05为标准,采用DESeq2筛选出背最长肌组织中的差异表达基因(DEGs),通过GO和KEGG数据库分别进行GO功能注释分析及KEGG信号通路富集分析,找出可能参与脂代谢的基因,并以实时荧光定量PCR进行转录组测序结果验证。【结果】试验组藏姜母猪的血清甘油三酯含量显著高于对照组藏姜母猪(P<0.05,下同),总胆固醇含量极显著高于对照组藏姜母猪(P<0.01,下同),雌激素含量极显著低于对照组藏姜母猪,背最长肌脂肪含量显著低于对照组藏姜母猪。试验组与对照组藏姜母猪间存在278个DEGs,其中有33个DEGs与脂代谢相关。DEGs主要注释在胆汁酸分泌、磷脂酰肌醇3-激酶信号传导、蛋白激酶B信号传导、G蛋白偶联受体结合、糖胺聚糖结合、趋化因子活性及趋化因子受体结合等GO功能条目上,且主要富集在糖酵解/糖异生、淀粉和蔗糖代谢、碳水化合物消化和吸收、MAP激酶丝氨酸/苏氨酸磷酸酶活性、雌激素2-羟化酶活性及cGMP-PKG信号等KEGG信号通路中。实时荧光定量PCR检测到的目的基因表达趋势与转录组测序结果基本一致,表明转录组测序数据可靠。【结论】摘除卵巢后藏姜母猪血清雌激素水平降低,甘油三酯和总胆固醇水平升高,背最长肌的肌间脂肪含量降低,与CALML5、PLCZ1、PIK3C2G、IL6等33个参与脂代谢调控DEGs的差异表达有关,且涉及胆汁酸分泌、磷脂酰肌醇3-激酶信号传导调控等功能条目及糖酵解/糖异生、淀粉和蔗糖代谢等信号通路。