最长公共子序列算法在程序代码相似度度量中的应用

阐述了最长公共子序列算法在程序代码结构相似度度量中的应用,列举了两种计算最优值和一种获取最长公共标识符子序列的算法.根据最优值得到结构相似度值,进而可以查找出结构相似程序对.最后探讨了程序代码相似度的实际应用.

结合Hausdorff距离和最长公共子序列的轨迹分类

为了提高运动目标轨迹分类的准确性,该文综合考虑了轨迹的位置信息和方向信息,提出了一种结合Hausdorff距离和最长公共子序列(Longest Common SubSequence,LCSS)的轨迹分类算法。该算法首先采用改进的Hausdorff距离对轨迹的位置信息进行相似性测量,然后采用改进的LCSS算法对轨迹的方向信息进行相似性测量。与其他轨迹聚类算法不同,该算法融合了Hausdorff距离和LCSS两种算法的优点,提高了轨迹分类的准确性。此外,为了进一步降低计算复杂度,该文还实现了一种基于插值的保距变换算法和一种LCSS快速算法。实验结果表明,该轨迹分类算法可以明显提高轨迹的聚类准确率,聚类准确率可达到96%;基于插值的保距变换算法和LCSS快速算法可以很大程度上降低算法的计算复杂度,下降幅度最大可达到80%。该方法可以同时满足轨迹分类对精确度、实时性和鲁棒性的要求。

带约束最长公共子序列快速算法

带约束最长公共子序列(CLCS)问题有很深的生物学应用背景,常被用来表示同源基因序列相似性的度量,但计算CLCS时间代价很高,最早的CLCS算法的时间复杂度为O(rn4),目前,最快的CLCS算法的时间复杂性为O(rn2).运用对偶原理将带约束最长公共子序列问题转换为带约束最小覆盖集问题,并建立带权的ref树结构,构造包含约束序列的约束覆盖子集,约简带约束覆盖子集并从中搜索关键路径,再通过关键路径构造CLCS,该算法将算法时间复杂度提升到O(nlogn+(q+r)L),r是约束序列的长度,q是两序列序偶的个数,L是两序列的最长公共子序列(LCS)长度.

基于最长公共子序列的非同步相似轨迹判断

针对非同步相似轨迹判断问题,提出了一种基于最长公共子序列理论的相似轨迹判断新算法。首先,求出查询轨迹线段与候选轨迹线段之间的距离;其次,利用最长公共子序列算法,计算两轨迹的最长公共子轨迹长度;最后,根据相似度门限,判断轨迹是否相似。数值实例验证了所提算法能够提高非同步轨迹的相似度。

一种带匹配路径约束的最长公共子序列长度算法

在带约束的最长公共子序列问题中提出一种特殊的新问题:假设有两序列Q和C,Q中指定的匹配位置序列I,计算两序列Q和C的最长公共子序列,且这个最长公共子序列的匹配路径必须经过位置序列I。针对此问题,该文提出一种带匹配路径约束的最长公共子序列算法。首先定义带匹配路径约束的最长公共子序列模型,其次推出该序列的性质,最后求出带匹配路径约束的最长公共子序列长度的基础算法和快速算法。基础算法和快速算法时间复杂度分别为O(mnt)和O(mn),m,n,t分别为序列Q,C,I的长度。

基于格代数的最长公共子序列近似求解

多条序列的最长公共子序列可以代表多条序列的公共信息,其在诸多领域里有着重要的应用,如信息检索、基因序列匹配等。求解多条序列的最长公共子序列是著名的NP难问题,本质为多解问题。一些近似算法虽然时间复杂度较低,但只能求出单解,对于有多解的序列集合,求得的结果信息量损失较大。因此提出一个新的近似算法来解决最长公共子序列问题。算法引入了代数结构"格",通过动态规划求解出两条序列的公共格,并递归求解当前格与当前序列的公共格。公共格中的路径保存了多条公共子序列使得最终求解出的最长公共子序列为多个。对算法的相关定理给出了理论证明,并通过实验验证了算法的正确性。

基于最长公共子序列的随机路径选择算法设计

针对传统算法只能求出一个最长公共子序列而无法求出多个最长公共子序列,设计了一种可求多个最长公共子序列的算法。简述了最长公共子序列的算法原理,描述了求最长公共子序列长度的动态规划算法,在此基础上求出一个最长公共子序列,通过对算法改进得到可求多个最长公共子序列的随机路径选择算法。该算法具有计算速度快、占用内存小、计算机易于实现等优点。其核心是寻优路径的选择,提出了寻找最优解的路径选择问题,讨论并给出了搜索多个可行解的快速算法,该算法充分利用了动态规划算法计算过程中提供的寻优方向信息得到最优路径的随机选择算法,与传统算法相比可求多个最长公共子序列。

最长公共子序列算法的分析与实现

本文首先分析最长公共子序列的特点,利用动态规划法求出最长公共子序列的长度数组和状态数组并通过矩阵搜索求出所有有效的跳跃点,构造了求解所有最长公共子序列的算法并通过程序给予实现。算法能有效避免重复搜索,时间效率大大提高,特别适用于基因工程中的基因片段分析。

基于状态压缩的最长公共上升子序列快速算法

探讨了最长公共上升子序列(LCIS)问题,在前人算法的基础上提出一种高效求解LCIS的动态规划算法。对于LCIS问题,分别使用最长公共子序列(LCS)和最长上升子序列(LIS)相结合的算法、动态规划算法、经过状态压缩的改进动态规划算法进行设计,并对后两种算法进行了实现。设计的状态压缩的动态规划算法,实现了LCIS的快速求解。通过分析这三种算法的时间和空间复杂度,最终提出了时间复杂度为O(mn)、空间复杂度为O(m)或O(n)的基于状态压缩的快速LCIS算法。

最长公共子序列算法在文字录入测试中的应用

测试Word中的文字录入内容,是开发Office等考试软件过程中的一个关键技术问题。常用的处理方法是关键字检测法。通过检测Word文件中的关键字,可以测试出考生操作的大概结果,但是很不准确。利用最长公共子序列算法进行文字录入测试,可以很好地解决这一问题。

基于分层匹配和最长公共子序列的SCD文件比较算法

IEC61850通信已经在电力系统中广泛使用,其中变电站通信系统使用SCD文件进行描述.SCD文件是XML格式的层次化结构,不适合直接用文本按行对比来分析差异.同时由于SCD文件层次结构多,使用纯结构化的比较方法,会导致比较结果冗长,执行效率低.本文基于SCD文件的特征,提出了分层匹配的半结构化半文本比较思路.先按照智能电子设备、连接接入点、逻辑设备等层次结构,提取关键属性名,进行对齐匹配.之后在逻辑设备范围内,针对逻辑节点的内容,采用最长公共子序列的匹配算法对比局部文本内容,该算法可去除仅调整顺序不影响实体内容的无效差异,比较速度快,比较结果准确直观.

算法分析与设计课程中最长公共子序列问题的教学探讨

介绍算法分析与设计课程中最长公共子序列问题的动态规划算法,利用该算法解决最长递减子序列问题和回文词的构造问题,通过这两个问题的求解,有助于学生举一反三,启发学生思维,以学致用,提高问题求解能力。

基于滑动窗口最长公共子序列Wi-Fi指纹定位算法

针对基于Wi-Fi瞬时指纹定位算法中由于RSS信号的时变特性引起的Wi-Fi定位精度差问题,提出了一种基于滑动窗口最长公共子序列指纹定位算法.该算法将时间序列的RSS信号指纹转化为基于滑动窗口的数据模型,增加了指纹特征信息,提高比对准确性.通过计算请求定位数据与样本的最长公共子序列来获得样本点的相似性,解决由于窗口伸缩或滑动窗口中个别采样点无信号引起的比对不准确问题,从而提高了定位的精确性和鲁棒性.实验结果表明,所提定位算法的结果明显优于瞬时指纹定位算法.

最长公共子序列问题的改进快速算法

现在几个最常用的解决最长公共子序列（ＬＣＳ）问题的算法的时间复杂度分别是O（ｐｎ），O（ｎ（ｍ－ｐ））．这里ｍ、ｎ两个待比较字符串的长度，ｐ是最长公共子串的长度．给出一种时间复杂度为Ｏ（ｐ（ｍ－ｐ））；空间复杂度为Ｏ（ｍ＋ｎ）的算法．与以前的算法相比；不管在ｐ＜＜ｍ的情况下，还是在ｐ接近ｍ时，这种算法都有更快的速度．

采用改进最长公共子序列的人名消歧

将名词、形容词、动名词和命名实体作为文本特征,考虑词序与词频,结合特征项的语义,提出一种基于改进最长公共子序列的文本聚类(LCSC)方法.实验结果表明:相对于传统的余弦值聚类方法,LCSC方法在人名消歧的P-IP指标上,F平均值由74.2%提高到了84.9%;相对于最长公共子序列方法,总体性能也提高了3.7%.

最长公共子序列的量子算法

本文给出了求给定两个序列最长公共子序列（Longest Common Subsequence，LCS）问题的量子算法，能在O（n）时间内求解两个长为n字符序列的最长公共子序列．算法在分析传统动态规划填表过程潜在并行性的基础上，对填表过程进行量子化，并通过带有量子存储器的量子Oracle，完成量子并行填表的计算．算法最后对前面计算获得的所有局部LCS的均匀叠加态应用Grover搜索，找出最终解，相对于经典动态规划实现了二次加速．

求解最长循环公共子序列问题的两个算法

最长循环公共子序列(LCCS)是两个字符串在所有可能的循环移位操作下能得到的最长公共子序列(LCS)。针对穷举移位量求解LCCS效率过低的问题,设法对候选移位量进行筛选。通过证明循环移位操作对两字符串间LCS长度增量影响的上下限,得到最优移位量的必要条件,从而减小了求解LCCS的枚举量;在此基础上,建立了求解LCCS的迭代方法,只经过少数几次迭代便可消除绝大部分无效候选移位量;此外,还提出一个可在O(mn)时间复杂度下快速估算LCCS长度的近似算法。大量随机模拟表明,当两字符串间的相似度明显高于随机字符串的相似度时,提出的两种算法表现良好。

求最长公共子序列长度的一个新方法

提出了一个求序列Ｘ最长单调子序列的方法，若Ｘ的长度为ｎ，则此方法所需时间为Ｏ（ｎｌｏｇｎ），空间占用为Ｏ（ｎ）．利用该方法可有效地求出Ｘ，Ｙ两序列最长公共子序列的长度．如果Ｘ的长度为ｍ，Ｙ的长度为ｎ，此时空间占用为Ｏ（ｍ＋ｎ）；若Ｙ中的各个元素在Ｘ中平均重复出现至多常数次，则所需时间为Ｏ（ｍ＋ｎｌｏｇｎ）．作为应用之一，该方法可以用于文本的比较、等级考试录入文本的评测等．

异构机群系统上并行计算双序列的最长公共子序列

针对处理机节点具有不同计算速度、不同通信能力的情况,考虑计算和通信启动开销,给定处理机分配顺序,基于可分负载理论,提出一种存储受限异构机群系统的序列串最优分配线性规划模型,给出相应的序列串最优分配方法。实验结果表明,基于最优序列串分配方法的双序列最长公共子序列并行算法优于平均分配序列串算法,获得了较好的加速,并具有良好的可扩展性。

基于最长公共子序列的DNA序列相似性分析

近半个世纪以来,大量有关DNA序列相似性分析的方法被不同领域的专家、学者挖掘出来,在生物信息学领域取得了不错的进展。针对DNA序列的相似性分析,本文提出了一种新方法,即最长公共子序列方法,以7种病毒DNA序列和10种伊球蛋白(globin)基因的第一个外显子DNA序列作为分析对象,来验证最长公共子序列方法对DNA相似性的分析是否有效,并分析其优缺点。实验结果表明,最长公共子序列方法对DNA序列的相似性分析是有效的。