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基于最长控制链的基因调控网络可控性研究
1
作者
白雪一
郭炳晖
+1 位作者
李佳辉
郑志明
《计算机工程》
CAS
CSCD
北大核心
2018年第11期202-208,共7页
为分析基因调控网络的可控性,以人类细胞周期中的基因调控网络为研究对象,通过布尔逻辑函数描述基因间的关联关系,根据基因状态对基因网络的结构控制过程进行分类重构。在此基础上,利用最长控制链方法探索基因调控路径,并与极大匹配算...
为分析基因调控网络的可控性,以人类细胞周期中的基因调控网络为研究对象,通过布尔逻辑函数描述基因间的关联关系,根据基因状态对基因网络的结构控制过程进行分类重构。在此基础上,利用最长控制链方法探索基因调控路径,并与极大匹配算法得到的结果进行对比。实验结果表明:控制基因网络的能量,与控制由3个节点基因CyclinD1、Myc、RB组成的链式网络的能量为同一数量级;当基因E2F1处于激活状态时,基因Myc决定控制网络的能量。
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关键词
基因调控网络
最长控制链
网络可控性
布尔网络
极大匹配
能量
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职称材料
题名
基于最长控制链的基因调控网络可控性研究
1
作者
白雪一
郭炳晖
李佳辉
郑志明
机构
北京航空航天大学数学、信息与行为教育部重点实验室
北京航空航天大学
出处
《计算机工程》
CAS
CSCD
北大核心
2018年第11期202-208,共7页
基金
国家自然科学基金(11401017,11671025)
国家自然科学基金重大项目(11290141)。
文摘
为分析基因调控网络的可控性,以人类细胞周期中的基因调控网络为研究对象,通过布尔逻辑函数描述基因间的关联关系,根据基因状态对基因网络的结构控制过程进行分类重构。在此基础上,利用最长控制链方法探索基因调控路径,并与极大匹配算法得到的结果进行对比。实验结果表明:控制基因网络的能量,与控制由3个节点基因CyclinD1、Myc、RB组成的链式网络的能量为同一数量级;当基因E2F1处于激活状态时,基因Myc决定控制网络的能量。
关键词
基因调控网络
最长控制链
网络可控性
布尔网络
极大匹配
能量
Keywords
gene regulatory network
Longest Control Chain(LLC)
network controllability
Boolean network
maximum matching
energy
分类号
N9741.4 [自然科学总论]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于最长控制链的基因调控网络可控性研究
白雪一
郭炳晖
李佳辉
郑志明
《计算机工程》
CAS
CSCD
北大核心
2018
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