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月月竹竹秆变色后全长转录组分析
1
作者
邵欣瑜
熊星
+3 位作者
杨峰
赵云飞
刘昌来
刘国华
《江苏农业学报》
CSCD
北大核心
2024年第3期538-551,共14页
为探究月月竹竹秆受到光照由绿色变为紫色的分子机制,本研究采集月月竹同一竹节紫色部分(Z)、渐变部分(M)和绿色部分(L)的竹青,提取RNA,利用PacBio Sequel三代全长转录组测序技术,结合生物信息学方法对不同颜色的竹青进行全长转录组分...
为探究月月竹竹秆受到光照由绿色变为紫色的分子机制,本研究采集月月竹同一竹节紫色部分(Z)、渐变部分(M)和绿色部分(L)的竹青,提取RNA,利用PacBio Sequel三代全长转录组测序技术,结合生物信息学方法对不同颜色的竹青进行全长转录组分析。结果表明,经过三代测序和数据质量控制,共获得非冗余转录本66961条,长度为500~3000 bp,平均长度1389.22 bp,序列总长度为93.02 Mbp,N50为1830 bp,G+C碱基含量为49.56%。利用NR、Swiss-Prot、COG、GO、KEGG和Pfam数据库对所有转录本进行功能注释,共有56938条转录本被成功注释,占全部转录本的85.03%;49115条转录本被GO注释,其中催化活性、细胞器、代谢过程分别是GO数据库分子功能、细胞组分和生物过程中含转录本最多的项目;28231个转录本被KEGG数据库注释,其中与碳水化合物代谢和基因翻译相关的转录本最多。结合GO注释和KEGG注释,66961条转录本中有381条转录本与光信号的感受、传递以及光调控相关,包括红光和远红光的受体蛋白PHYA、PHYB及信号通路蛋白PIF3、ELF3,蓝光的受体蛋白CRY、ZTL及信号通路蛋白COP1、SPA1、ELF3、GI、HY5等。类黄酮(包括花青素)代谢、叶绿素合成、类胡萝卜素合成等与植物色素合成相关通路分别含有转录本187条、44条和72条。全长转录本共获得2079个转录因子,其中包括18个由35个转录本编码的与花青素合成相关的R2R3MYB转录因子。CNCI、CPC、Pfam、PLEK等数据库同时注释到的长链非编码RNA(LncRNA)6359个,数量高于孝顺竹等其他竹种。本研究获得了高质量的月月竹竹青全长转录组数据,与竹秆变色相关的红光和蓝光受体及光信号传递蛋白,与花青素、叶绿素和类胡萝卜素合成相关的转录因子及长链非编码RNA(LncRNA),为进一步深入分析月月竹竹秆变色机制提供基础。
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关键词
月月竹
变色
竹
秆
全长转录组测序
光信号
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职称材料
中国竹类—新属——月月竹属
被引量:
2
2
作者
易同培
《竹子研究汇刊》
北大核心
1992年第1期38-41,共4页
灌木状竹类,地下茎复轴型。秆直立,节间圆筒形,但分枝一侧下部扁平,中空,无毛,一长达38厘米;箨环隆起,初时具黄棕色向下的刺毛;秆环微隆起。秆芽3枚,但具1枚共同的先出叶;每节起初分枝3枚,后期因次生枝发生可为5—11枚,斜展。秆箨宿存性...
灌木状竹类,地下茎复轴型。秆直立,节间圆筒形,但分枝一侧下部扁平,中空,无毛,一长达38厘米;箨环隆起,初时具黄棕色向下的刺毛;秆环微隆起。秆芽3枚,但具1枚共同的先出叶;每节起初分枝3枚,后期因次生枝发生可为5—11枚,斜展。秆箨宿存性,三角状窄长椭圆形,薄革质,
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关键词
月月竹
属
月月竹
竹
子
新属
箭
竹
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职称材料
月月竹大、小孢子发生和雌、雄配子体发育研究
被引量:
23
3
作者
林树燕
郝娟娟
+1 位作者
辛华
丁雨龙
《南京林业大学学报(自然科学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2009年第3期9-12,共4页
月月竹(Menstruocalamus sichuanensis)作为优良的园林绿化竹种,近几年在南京林业大学竹种园中出现开花现象。以月月竹为研究对象,运用石蜡切片技术对其大、小孢子的发生和雌、雄配子体的发育过程进行了研究。结果表明:月月竹花药具4个...
月月竹(Menstruocalamus sichuanensis)作为优良的园林绿化竹种,近几年在南京林业大学竹种园中出现开花现象。以月月竹为研究对象,运用石蜡切片技术对其大、小孢子的发生和雌、雄配子体的发育过程进行了研究。结果表明:月月竹花药具4个药室,花药壁由表皮、药室内壁、中层、绒毡层4层结构组成,花药壁发育为单子叶型,绒毡层为腺质型,小孢子母细胞减数分裂中的胞质分裂为连续型,产生左右对称型小孢子。成熟花粉大多二细胞型,具1个萌发孔。月月竹子房为2心皮1室,侧膜胎座,1个倒生胚珠,双珠被,薄珠心。大孢子母细胞由一个雌性孢原细胞直接发育而成,大孢子四分体呈线型,合点端一个大孢子分化为功能大孢子,由功能大孢子发育为蓼型成熟胚囊。
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关键词
月月竹
大孢子发生
小孢子发生
雄配子体
雌配子体
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职称材料
月月竹的花粉萌发力及贮藏力研究
被引量:
10
4
作者
林树燕
骆仁祥
+1 位作者
丁雨龙
王福升
《林业科技开发》
2008年第5期22-25,共4页
对南京林业大学竹种园的开花竹种月月竹进行了花粉萌发力及贮藏力等方面的研究,结果表明:月月竹花粉在不同浓度的蔗糖硼酸培养基中培养萌发率不同,以20%的蔗糖浓度+0.001%硼酸培养基培养3h花粉萌发最好;一天之中以上午9时的萌发率最高;...
对南京林业大学竹种园的开花竹种月月竹进行了花粉萌发力及贮藏力等方面的研究,结果表明:月月竹花粉在不同浓度的蔗糖硼酸培养基中培养萌发率不同,以20%的蔗糖浓度+0.001%硼酸培养基培养3h花粉萌发最好;一天之中以上午9时的萌发率最高;不同贮藏方法对花粉的萌发力有较大影响,月月竹花粉保存过程中不干燥好于干燥,-5℃保存萌发力相对较好,总之,月月竹花粉不耐贮藏,一般48 h内失去生活力。
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关键词
月月竹
花粉
生活力
贮藏方法
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职称材料
探讨竹根雕艺术的特色表现
5
作者
叶新聪
《现代装饰(理论)》
2015年第9期176-177,共2页
竹文化源远流长,在中国传统文化中具有重要的地位。竹根雕是中华民族文化艺术领域中的一个重要艺术门类,有着独特的艺术特色,对于一件精美的竹根雕作品来说,基本都包含了用料考究,追求自然;精于设计,讲究创意;内涵丰富,意蕴深厚等三个...
竹文化源远流长,在中国传统文化中具有重要的地位。竹根雕是中华民族文化艺术领域中的一个重要艺术门类,有着独特的艺术特色,对于一件精美的竹根雕作品来说,基本都包含了用料考究,追求自然;精于设计,讲究创意;内涵丰富,意蕴深厚等三个方面的艺术特色。
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关键词
竹
文化
艺术特色
文化艺术领域
意蕴深厚
中国传统文化
艺术构思
文人雅士
月月竹
设计造型
古朴典
原文传递
题名
月月竹竹秆变色后全长转录组分析
1
作者
邵欣瑜
熊星
杨峰
赵云飞
刘昌来
刘国华
机构
南京林业大学竹类研究所/南方现代林业协同创新中心
菏泽化工高级技工学校
临沂市公安局
出处
《江苏农业学报》
CSCD
北大核心
2024年第3期538-551,共14页
基金
国家重点研发计划项目(2023YFD2201901)。
文摘
为探究月月竹竹秆受到光照由绿色变为紫色的分子机制,本研究采集月月竹同一竹节紫色部分(Z)、渐变部分(M)和绿色部分(L)的竹青,提取RNA,利用PacBio Sequel三代全长转录组测序技术,结合生物信息学方法对不同颜色的竹青进行全长转录组分析。结果表明,经过三代测序和数据质量控制,共获得非冗余转录本66961条,长度为500~3000 bp,平均长度1389.22 bp,序列总长度为93.02 Mbp,N50为1830 bp,G+C碱基含量为49.56%。利用NR、Swiss-Prot、COG、GO、KEGG和Pfam数据库对所有转录本进行功能注释,共有56938条转录本被成功注释,占全部转录本的85.03%;49115条转录本被GO注释,其中催化活性、细胞器、代谢过程分别是GO数据库分子功能、细胞组分和生物过程中含转录本最多的项目;28231个转录本被KEGG数据库注释,其中与碳水化合物代谢和基因翻译相关的转录本最多。结合GO注释和KEGG注释,66961条转录本中有381条转录本与光信号的感受、传递以及光调控相关,包括红光和远红光的受体蛋白PHYA、PHYB及信号通路蛋白PIF3、ELF3,蓝光的受体蛋白CRY、ZTL及信号通路蛋白COP1、SPA1、ELF3、GI、HY5等。类黄酮(包括花青素)代谢、叶绿素合成、类胡萝卜素合成等与植物色素合成相关通路分别含有转录本187条、44条和72条。全长转录本共获得2079个转录因子,其中包括18个由35个转录本编码的与花青素合成相关的R2R3MYB转录因子。CNCI、CPC、Pfam、PLEK等数据库同时注释到的长链非编码RNA(LncRNA)6359个,数量高于孝顺竹等其他竹种。本研究获得了高质量的月月竹竹青全长转录组数据,与竹秆变色相关的红光和蓝光受体及光信号传递蛋白,与花青素、叶绿素和类胡萝卜素合成相关的转录因子及长链非编码RNA(LncRNA),为进一步深入分析月月竹竹秆变色机制提供基础。
关键词
月月竹
变色
竹
秆
全长转录组测序
光信号
Keywords
Chimonobambusa sichuanensis
color-changing bamboo culm
full-length transcriptome sequencing
light signal
分类号
S795.6 [农业科学—林木遗传育种]
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职称材料
题名
中国竹类—新属——月月竹属
被引量:
2
2
作者
易同培
机构
四川省林业学校
出处
《竹子研究汇刊》
北大核心
1992年第1期38-41,共4页
文摘
灌木状竹类,地下茎复轴型。秆直立,节间圆筒形,但分枝一侧下部扁平,中空,无毛,一长达38厘米;箨环隆起,初时具黄棕色向下的刺毛;秆环微隆起。秆芽3枚,但具1枚共同的先出叶;每节起初分枝3枚,后期因次生枝发生可为5—11枚,斜展。秆箨宿存性,三角状窄长椭圆形,薄革质,
关键词
月月竹
属
月月竹
竹
子
新属
箭
竹
Keywords
Menstruocalamus
Y. sichuanensis
分类号
S795.201 [农业科学—林木遗传育种]
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职称材料
题名
月月竹大、小孢子发生和雌、雄配子体发育研究
被引量:
23
3
作者
林树燕
郝娟娟
辛华
丁雨龙
机构
南京林业大学竹类研究所
青岛农业大学
出处
《南京林业大学学报(自然科学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2009年第3期9-12,共4页
基金
国家“十一五”科技支撑计划(2006BAD19B0204)
文摘
月月竹(Menstruocalamus sichuanensis)作为优良的园林绿化竹种,近几年在南京林业大学竹种园中出现开花现象。以月月竹为研究对象,运用石蜡切片技术对其大、小孢子的发生和雌、雄配子体的发育过程进行了研究。结果表明:月月竹花药具4个药室,花药壁由表皮、药室内壁、中层、绒毡层4层结构组成,花药壁发育为单子叶型,绒毡层为腺质型,小孢子母细胞减数分裂中的胞质分裂为连续型,产生左右对称型小孢子。成熟花粉大多二细胞型,具1个萌发孔。月月竹子房为2心皮1室,侧膜胎座,1个倒生胚珠,双珠被,薄珠心。大孢子母细胞由一个雌性孢原细胞直接发育而成,大孢子四分体呈线型,合点端一个大孢子分化为功能大孢子,由功能大孢子发育为蓼型成熟胚囊。
关键词
月月竹
大孢子发生
小孢子发生
雄配子体
雌配子体
Keywords
Menstruocalamus sichuanensis
megasporogenesis
microsporogenesis
male gametophyte
female gametophyte
分类号
S722 [农业科学—林木遗传育种]
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职称材料
题名
月月竹的花粉萌发力及贮藏力研究
被引量:
10
4
作者
林树燕
骆仁祥
丁雨龙
王福升
机构
南京林业大学竹类研究所
出处
《林业科技开发》
2008年第5期22-25,共4页
基金
"十一五"国家科技支撑计划课题"竹资源优良品种选择与育种技术研究"(编号:2006037032020)
文摘
对南京林业大学竹种园的开花竹种月月竹进行了花粉萌发力及贮藏力等方面的研究,结果表明:月月竹花粉在不同浓度的蔗糖硼酸培养基中培养萌发率不同,以20%的蔗糖浓度+0.001%硼酸培养基培养3h花粉萌发最好;一天之中以上午9时的萌发率最高;不同贮藏方法对花粉的萌发力有较大影响,月月竹花粉保存过程中不干燥好于干燥,-5℃保存萌发力相对较好,总之,月月竹花粉不耐贮藏,一般48 h内失去生活力。
关键词
月月竹
花粉
生活力
贮藏方法
Keywords
Pollen of Chimonobambusa szechuanensis
Vitality
Storage capacity
分类号
S661.101 [农业科学—果树学]
S791.240.1 [农业科学—林木遗传育种]
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职称材料
题名
探讨竹根雕艺术的特色表现
5
作者
叶新聪
机构
仙游县竹木雕刻工艺研究所
出处
《现代装饰(理论)》
2015年第9期176-177,共2页
文摘
竹文化源远流长,在中国传统文化中具有重要的地位。竹根雕是中华民族文化艺术领域中的一个重要艺术门类,有着独特的艺术特色,对于一件精美的竹根雕作品来说,基本都包含了用料考究,追求自然;精于设计,讲究创意;内涵丰富,意蕴深厚等三个方面的艺术特色。
关键词
竹
文化
艺术特色
文化艺术领域
意蕴深厚
中国传统文化
艺术构思
文人雅士
月月竹
设计造型
古朴典
分类号
J314.5 [艺术—美术]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
月月竹竹秆变色后全长转录组分析
邵欣瑜
熊星
杨峰
赵云飞
刘昌来
刘国华
《江苏农业学报》
CSCD
北大核心
2024
0
下载PDF
职称材料
2
中国竹类—新属——月月竹属
易同培
《竹子研究汇刊》
北大核心
1992
2
下载PDF
职称材料
3
月月竹大、小孢子发生和雌、雄配子体发育研究
林树燕
郝娟娟
辛华
丁雨龙
《南京林业大学学报(自然科学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2009
23
下载PDF
职称材料
4
月月竹的花粉萌发力及贮藏力研究
林树燕
骆仁祥
丁雨龙
王福升
《林业科技开发》
2008
10
下载PDF
职称材料
5
探讨竹根雕艺术的特色表现
叶新聪
《现代装饰(理论)》
2015
0
原文传递
已选择
0
条
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引用分析
参考文献
引证文献
统计分析
检索结果
已选文献
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