利用结构基因座分析小尾寒羊、滩羊群体遗传分化水平

采用中心产区典型群随机抽样方法和多种电泳技术检测60只小尾寒羊、73只滩羊编码血液蛋白17个结构基因座上的变异,引用国内外14个绵羊群体相同资料进行比较分析,探讨其遗传分化水平。研究表明:(1)小尾寒羊、滩羊结构基因座平均杂合度分别为0.2360和0.2587;平均多态信息含量分别为0.1974、0.2102;平均有效等位基因数分别为1.5723和1.5751。(2)4个组合(分别为4个、6个、13个及16个绵羊群体)的基因分化系数分别为0.049323、0.059987、0.1728和0.201256,说明湖羊、同羊、小尾寒羊和滩羊4个绵羊群体结构基因座的基因分化程度低;这4种绵羊与蒙古国绵羊的基因分化程度次之;蒙古羊系绵羊和南亚羊及欧洲羊之间基因传分化程度较高。(3)前人关于小尾寒羊、滩羊由蒙古羊分化而来的考证得到遗传学实验的进一步证明,湖羊、同羊、小尾寒羊和滩羊受蒙古羊血统的影响递减。群体间亲缘关系远近与其所处地理位置远近并未表现出紧密相关。

荷斯坦牛12个STR基因座遗传多态性研究

选用牛的12个STR基因座,利用PCR和电泳银染技术对来自不同牛场的100头荷斯坦牛进行遗传多态性检测。结果表明,12个STR基因座的杂合度、多态信息含量、有效等位基因数的均值为0.8711,0.8574,8.1666,这些基因座的遗传杂合度及多态信息含量高,均为高度多态位点,适用于动物的遗传分析和个体鉴定。

柚品种的等位酶变异

研究柚的48个品种的等位酶变异。利用等位酶分析技术对柚的脂酶(EST)、6—磷酸葡萄糖异构酶(PDI)、6—磷酸葡萄糖变位酶(PGM)、莽草酸脱氢酶(SKD)、超氧化物歧化酶(SOD)

7个绵羊微卫星DNA标记在绵(山)羊群体中的多态性检测

选择分别位于绵羊2,4,6,9,17和19号染色体上的7个微卫星标记OarFCB11,OarFCB128,MAF70,OarAE101,MAF33,OarFCB48和OarFCB304,对湖羊、同羊及长江三角洲白山羊的典型群随机样本相应位点进行了PCR检测。结果表明,每个微卫星座位发现7个以上等位基因,且均存在多态;湖羊、同羊、长江三角洲白山羊群体杂合度(H)分别为0.9092,0.9177和0.8867,相应的群体基因平均多态信息含量(PIC)分别为0.9024,0.9116和0.8774,有效等位基因数(Ne)分别为11.7723,12.4538和11.6104,均以同羊为最高;以产生有效条带为标志,随机样本的PCR扩增效率存在明显的群体间和座位间差异,以长江三角洲白山羊和OarFCB128座位为最高;以7个座位微卫星等位基因频率推算群体间标准遗传距离,山羊与绵羊群体间遗传距离远大于绵羊群体之间,湖羊、同羊间亲缘距离系数R为0.1998。研究结果提示:选择的7个微卫星DNA座位均为多态座位;以7个微卫星标记为测度,湖羊、同羊及长江三角洲白山羊具有丰富的遗传多态性;7个微卫星标记可进一步用于绵山羊近缘种间遗传分析研究。

利用微卫星标记对蒙古马和纯血马遗传多样性的研究

通过13个微卫星座位对蒙古马和纯血马两大品种的60匹马进行了遗传检测。用8%非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳分离PCR扩增产物,并用银染法显色。通过软件计算了各微卫星座位的等位基因频率、有效等位基因数(Ne)、多态信息含量(PIC)和杂合度(H)。结果13个座位中UCDEQ440变异最大,TKY16变异最小;纯血马的Ne、PIC和H的平均值均稍高于蒙古马;总群体的平均遗传分化系数是0 0429。这些研究将为今后我国培育优良品种马提供思路。

保康野生紫薇的遗传多样性研究

利用RAPD分子标记技术对湖北保康野生紫薇的遗传多样性进行分析 ,结果表明 ,保康野生紫薇具有较丰富的遗传多样性 ,其平均有效等位基因数为 1.72 5 7,平均基因多样度为 0 .4 0 89,平均shannon信息指数为 0 .5 95 2。

Z:ZCLA长爪沙鼠微卫星标记的遗传多态性研究

通过对9个微卫星座位的扩增,研究了Z :ZCLA长爪沙鼠的遗传多态性。结果表明,Z :ZCLA长爪沙鼠在其中1个位点上只有一个等位基因,在其它位点上均有2～4个等位基因,平均等位基因数2 6个。平均杂合度0 4 6 84 ,平均多态信息量0 4 16 6 ,平均有效等位基因数2 175 6。全群基因纯合度从0 1111～0 5 5 5 5 ,平均0 3389。

桂东南地区普通野生稻遗传多样性研究

利用25个微卫星位点对广西壮族自治区贺州、崇左、防城港3市8个居群301份普通野生稻材料的遗传多样性和遗传结构进行研究,结果表明桂东南地区普通野生稻遗传多样性丰富,平均等位基因数A=10.2400,有效等位基因数Ae=5.0221,平均期望杂合度He=0.7641,实际观察杂合度Ho=0.4840。根据固定指数(F=0.5653)计算出的异交率(t=0.2777)表明,普通野生稻的繁育系统是典型的混合繁育系统。对其遗传结构分析表明,总的遗传变异中有34.59%存在于居群间(Fst=0.3459)。进一步研究发现大多数居群偏离了Hardy-Weinberg平衡且杂合体不足(Fis=0.2680,Fit=0.4817)。最后根据各居群的遗传变异特点和遗传多样性比较,建议居群QT、YJ和TJ需要优先保护。

利用RAPD标记分析大麦种质资源的遗传多样性

利用RAPD标记对19份西藏近缘野生大麦材料、33份我国不同省市的地方品种以及8份国外引进大麦品种共6 0份大麦种质资源的遗传多样性进行检测。结果表明材料间遗传差异明显。32个RAPD引物中,有2 5个引物(占78 13% )可扩增出清晰且具多态性的条带,另外7个引物能扩增出1～3条清晰但无多态性的条带。每个引物可扩增出1～8条多态性带,平均为3 72条。32个引物共产生119条DNA片段,其中87条具有多态性,多态性比率(PPB)为73 11% ,平均多态信息量(PIC)为0 4 34;每个位点平均有效等位基因数(Ne)为2 30 4 ;材料间遗传相似系数GS变化范围为0 75 7～0 981,平均值为0 871。19份来源于西藏的近缘野生大麦材料间GS值变幅为0 818～0 96 9,平均为0 892 ;33份我国栽培大麦地方品种间的GS值变化范围为0 783～0 981,平均为0 879;8份分别来自8个国家的栽培大麦品种间的GS值变幅为0 82 0～0 95 6 ,平均为0 882。根据RAPD标记分析的结果,对6 0份大麦种质资源进行聚类分析,在平均GS值0 871水平上6 0份大麦材料可聚为5类,聚类结果能在一定程度上反应材料的地理分布关系,但某些相同地理来源的材料也较分散地分布在整个聚类树中。本研究从分子水平上进一步证明了我国栽培大麦丰富的遗传多样性。

荷叶铁线蕨自然居群的遗传多样性研究

荷叶铁线蕨(Adiantumreniformevar. sinense)为我国特有植物,具有重要的经济价值,目前仅分布于重庆的少数地区。近几十年来,由于过度开发,该种的分布范围日益缩小,已处于灭绝的边缘。本研究利用等位酶标记检测了荷叶铁线蕨 6个自然居群共 136个个体的遗传多样性,共检测到了 5个酶系统的 14个位点,获得了 7个多态位点。结果表明:与其他蕨类植物相比,荷叶铁线蕨居群内的遗传多样性水平比较低。平均每位点的有效等位基因数(Ae)为 1. 778,多态位点百分率(P)为 0. 441,期望杂合度(He)为 0. 199,观察杂合度 (Ho)为 0. 235。其居群间的遗传分化也很低,居群间的遗传变异仅占总变异的 1. 49%,而 98. 51%的变异存在于居群内部。采用Hardy Wein berg平衡和固定指数F对荷叶铁线蕨的居群遗传结构进行了分析,结果表明其种群可能是以配子体间异交为主的混合交配体系。导致荷叶铁线蕨濒危的主要原因是生境的破坏以及过度开采所导致的生境片断化使其居群变小、近交率加大、遗传变异趋低,降低了其生存以及进化的潜力。

白皮松保育遗传学——天然群体遗传多样性评价与保护策略

在白皮松天然林中采取分层取样 ,抽取 10个群体 2 10个单株。测定分析 16种酶系统 ,得到 31个酶位点。白皮松物种水平遗传多样性参数为 :平均等位基因数AS=1 74 2 ,平均有效等位基因数AeS=1 4 9,多态位点百分率PS=5 4 8% ,期望杂合度HeS=0 16 2 ;白皮松群体水平遗传多样性参数为 :平均等位基因数AP=1 39± 0 11,平均有效等位基因数AeP=1 30± 0 12 ,多态位点百分率PP=34 85 %± 8 4 6 % ,期望杂合度HeP=0 0 99± 0 0 4 9,观测杂合度HoP =0 0 95± 0 0 4 2。白皮松遗传多样性在松属树种中属于中等偏下 ,群体间分化明显 ,遗传分化系数FST =0 133,群体间遗传距离 D =0 12 8,大于松属平均水平。根据Nei’s遗传一致度将 10个群体分为 3组。白皮松群体遗传多样性中心与资源分布中心和表型多样性分布中心吻合 ,适宜采取中心群体原地保护和多群体异地联合保存相结合的保护策略。

明光小耳猪遗传多样性分析

为深入了解明光小耳猪群体遗传结构，使之得到更好的保护和利用，采用分布在家猪19对染色体上的76个微卫星标记对该猪种65个样品进行群体遗传变异分析。共检测到343个等位基因，每个座位的等位基因数从2到9不等，有效等位基因数在1．2239～4．8079之间，平均每个座位等位基因数为（4．5132±1．2055）个，有效等位基因数为（3．2169±0．7736）个，群体平均表观杂合度、期望杂合度及平均多态信息含量分别为0．9442±0．1595、0．6685±0．0945和0．6103±0．1083。结果表明，明光小耳猪群体遗传变异丰富。

应用两类遗传标记方法分析湖羊和同羊的遗传多样性

随机抽取湖羊 6 3只、同羊 6 5只分别进行 14个结构基因座和 7个微卫星标记的遗传检测 ,比较由两种遗传标记获得的群体基因平均杂合度 (H)、多态信息含量 (PIC)及群体有效等位基因数 (Ne)。结果表明 :由微卫星等位基因频率获得的群体基因平均杂合度、多态信息含量及有效等位基因数显著大于由结构基因座获得的 ,且在两群体中变化趋势一致。提示 :结构基因座和微卫星标记是绵羊群体遗传多样性研究的可靠遗传标记 ,而微卫星标记揭示更为丰富的遗传变异 ;两绵羊群体在结构基因座和微卫星DNA两个层次上具相当的遗传多样性 ;微卫星标记可有效用于近缘群体间的遗传分析。

西林水牛群体的RAPD遗传多样性分析

【目的】了解西林水牛群体的遗传变异和遗传结构,为其辅助标记育种、遗传资源保护及利用提供参考依据。【方法】从广西西林县的8个乡（镇）采集184份西林水牛血样,采用优化后的RAPD技术检测其多态性DNA,统计多态性条带数,并应用Popgene32软件对西林水牛群体的有效等位基因数、Nei氏基因多样性指数及Shannon多样性指数进行分析。【结果】从18条RAPD引物中筛选出8条扩增产物稳定、条带清晰可辨的引物,扩增出的DNA片段分子量为100-1000 bp;从184个样本中共扩增出4968个多态性条带,平均每条引物可扩增出621个多态性条带,多态性频率达60.0%-100.0%,平均为89.7%。西林水牛群体的平均有效等位基因数为1.6745,平均Nei氏基因多样度指数为0.3583,平均Shannon多样性指数为0.5510。【结论】西林水牛群体的遗传变异、遗传分化及遗传多样性均较高,但选育程度较低,育种潜力较大,有待进一步保种和开发利用。

美国梧桐种质资源遗传变异的分子研究

采用RAPD标记的方法从分子水平上研究美国梧桐的 12个种源, 18个随机引物扩增的多态性位点为 80个,高达 66%。研究结果表明:美国梧桐地理种源的有效等位基因数和基因多样度为中等水平;其变异主要来自于种源间,其基因多样性占总量的 77%,种源内的基因多样性仅占 23%。聚类分析将 12个种源划分为 3个类群:来自阿肯色州种源自成一类、I和T种源为一类、其余的 9个种源为一类。

4个微卫星标记对3个绵羊品种肉用性状多态性的研究

选用无角陶赛特、萨福克与中国美利奴肉用绵羊161只,经耳组织提取其基因组DNA,并通过4对微卫星引物对其进行PCR扩增,然后通过电泳分型、凝胶成像系统分析各位点等位基因及全部个体的标记基因型,计算基因频率、多态信息含量(PIC)和杂合度等遗传多态性指标.结果表明,BM3413,BP33,MCM38,MCMA26位点的等位基因数分别为12、15、13、13,多态信息含量丰富,杂合度高,均属于高度多态性位点,用于绵羊肉用形状较理想的遗传标记.

微卫星标记OarAE101和MCM38在三个山羊品种中的遗传多态性研究

本文利用两个微卫星标记OarAE10 1和MCM 38对波尔山羊、太行山羊和河北奶山羊的等位基因频率、群体多态信息含量、有效等位基因数和杂合度进行了遗传检测 ,结果表明 :微卫星位点OarAE10 1和MCM38在三个山羊品种中存在多态性 ,可以用于山羊遗传多样性的评估 ;位点OarAE10 1比位点MCM 38变异较大 ,从不同品种来看 ,波尔山羊的遗传变异程度最大 ,而河北奶山羊的遗传变异程度相对较小。

4对微卫星DNA标记在3个绵羊品种中多态性的研究

选用无角道塞特、萨福克与中国美利奴肉羊品种群体,耳组织提取基因组DNA,用4对微卫星引物进行PCR扩增,通过电泳分型、凝胶成像系统分析各位点等位基因及全部个体的标记基因型,计算基因频率、多态信息含量(PIC)和杂合度等,从分子水平上分析4个位点的遗传多态性。结果表明,CSSM18,OB2,MCM38,MCMA26这4个位点的等位基因数分别为14、151、3、13,多态信息含量(PIC)丰富,杂合度高,均属于高度多态性位点,用于作为与生产性能相关的遗传标记是较理想的。

用微卫星标记对宁夏固原地区两个鸡群体遗传多样性的分析

利用微卫星标记对中国宁夏固原地区地方品种鸡固原鸡和培育品种鸡固原红鸡两个群体DNA水平上的遗传多态性进行了研究,探讨群体内的遗传多态性,为种质资源的保护、开发、利用等提供理论依据。结果表明,利用微卫星标记分析6个位点,共检测到38个等位基因,固原鸡和固原红鸡分别发现29个和20个等位基因;平均有效等位基因数分别为4.6983和3.9385个;群体内平均杂合度分别为0.7198和0.6944。固原鸡和固原红鸡平均多态信含量分别为0.6456和0.5584,表明两个鸡群均为高度多态,均具有较为丰富的遗传多态性。

藏獒血液蛋白多态性研究

[目的]了解藏獒血液蛋白基因座的遗传变异状况,为藏獒品种资源保护及合理开发利用提供理论依据。[方法]采用不连续垂直板聚丙烯酰胺凝胶电泳技术,对河曲藏獒、青海藏獒、青海藏狮犬和青海土种犬共4个群体103只犬的7个血液蛋白基因座(Tf、Po、Sα2、Hb、Alb、Pr、Amy)的多态性进行研究,并分析不同群体的群体内遗传变异。[结果]4个犬群中,Tf、Po和Sα23个基因座上存在多态性,其中Tf和Po分别由3个等位基因控制,Sα2由2个等位基因控制,Hb、Alb、Pr和Amy基因座均呈现单态;藏獒群体的有效等位基因数(Ne)和Nei氏平均预期基因杂合度(H)分别为1.5324和0.2303,均高于其他犬群。[结论]藏獒群体内在血液蛋白位点上存在丰富的遗传变异。