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尿道致病性大肠埃希菌UPEC4030株papA基因的克隆和序列分析
1
作者
吴庆刚
张敬平
+5 位作者
赵春城
诸建国
钮伟民
陈锦英
尤凤兴
姜永
《卫生研究》
CAS
CSCD
北大核心
2008年第5期574-577,共4页
目的比较尿道致病性大肠埃希菌UPEC4030株papA与相关序列的差异,明确是否为未知的基因型。方法采用PCR扩增、基因克隆与测序分析方法,分别对UPEC4030株papA进行基因与氨基酸序列分析,并与相关序列进行比较。结果UPEC4030papA由722个碱...
目的比较尿道致病性大肠埃希菌UPEC4030株papA与相关序列的差异,明确是否为未知的基因型。方法采用PCR扩增、基因克隆与测序分析方法,分别对UPEC4030株papA进行基因与氨基酸序列分析,并与相关序列进行比较。结果UPEC4030papA由722个碱基对组成,编码192个氨基酸的多肽。与10个基因型UPECpapA核苷酸序列和推导的氨基酸序列进行同源性比较,结果分别为36.11%~77.95%和22.20%~78.34%;与papA基因分型多重PCR引物序列比较,下游分型引物在UPEC4030papA相应位置上的序列同源性只有10%~66.67%,推测该菌株papA为未知的基因型。结论UPEC4030papA为未知的基因型,相关致病机制和流行病学意义值得深入研究。
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关键词
尿道致病性大肠埃希菌
基因
测序
未知
的
基因
型
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职称材料
一株未知黏附基因型的尿道致病性大肠埃希菌UPEC4030株的基因分析
被引量:
1
2
作者
吴庆刚
张敬平
+3 位作者
陈锦英
郑明寰
尤凤兴
姜永
《中华流行病学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2008年第11期1123-1127,共5页
目的比较尿道致病性大肠埃希菌UPEC4030株papG和papA基因与相关序列的差异,以明确UPEC4030 papA基因变异情况及与papG的组合形式,确定是否为未知基因型。方法采用基因克隆测序方法,分别对UPEC4030株papG和papA基因进行序列分析,并...
目的比较尿道致病性大肠埃希菌UPEC4030株papG和papA基因与相关序列的差异,以明确UPEC4030 papA基因变异情况及与papG的组合形式,确定是否为未知基因型。方法采用基因克隆测序方法,分别对UPEC4030株papG和papA基因进行序列分析,并与相关序列进行比较。结果UPEC4030 papA由722个碱基对组成,编码192个氨基酸的多肽。与10个基因型UPEC papA核苷酸序列和推导的氨基酸序列同源性比较,分别为36.11%~77.95%和22.20%~78.34%;与papA基因分型多重PCR引物序列比较,下游分型引物在UPECA030 papA相应位置上的序列同源性只有10.00%~66.67%,表明该菌株papA确实为未知的基因型。UPECA030菌株papG全基因片段由1100个碱基组成,编码337个氨基酸的多肽,其核苷酸及推导的氨基酸序列与Ⅱ型papG代表株UPECIA2相比较,同源性分别为99.00%和99.11%,表明UPEC4030 papG属于Ⅱ型。结论UPEC4030 papA为未知的基因型,其papG属于Ⅱ型。
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关键词
尿道致病性大肠埃希菌
基因
测序
未知基因型
原文传递
泰国输华斑节对虾传染性皮下和造血器官坏死病毒的检测与分析
3
作者
于力
刘莹
+4 位作者
郑晓聪
王津津
贾鹏
何俊强
刘荭
《中国动物检疫》
CAS
2016年第6期83-85,89,共4页
为研究进口斑节对虾传染性皮下和造血器官坏死病毒(Infectious Hypodermal and Hematopoietic Necrosis Virus,IHHNV)的风险,本文采用了世界动物卫生组织(OIE)2015版手册中推荐的PCR方法,对2015年从泰国输华的329批次斑节对虾进行了IHHN...
为研究进口斑节对虾传染性皮下和造血器官坏死病毒(Infectious Hypodermal and Hematopoietic Necrosis Virus,IHHNV)的风险,本文采用了世界动物卫生组织(OIE)2015版手册中推荐的PCR方法,对2015年从泰国输华的329批次斑节对虾进行了IHHNV检测分析。结果发现,其阳性率高达36.8%,且主要是感染1型和2型,以及风险不明的未知型。因此,来自泰国的斑节对虾具有较高的IHHNV传入风险,应加强针对IHHNV的进口监测,减少其对我国对虾养殖的影响。
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关键词
传染性皮下和造血器官坏死病毒
斑节对虾
未知基因型
风险
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职称材料
题名
尿道致病性大肠埃希菌UPEC4030株papA基因的克隆和序列分析
1
作者
吴庆刚
张敬平
赵春城
诸建国
钮伟民
陈锦英
尤凤兴
姜永
机构
无锡市疾病预防控制中心
江苏省苏微生物研究有限公司
天津医科大学基础医学院
出处
《卫生研究》
CAS
CSCD
北大核心
2008年第5期574-577,共4页
基金
卫生部科研基金项目(No.WKJ2006-2-10)
文摘
目的比较尿道致病性大肠埃希菌UPEC4030株papA与相关序列的差异,明确是否为未知的基因型。方法采用PCR扩增、基因克隆与测序分析方法,分别对UPEC4030株papA进行基因与氨基酸序列分析,并与相关序列进行比较。结果UPEC4030papA由722个碱基对组成,编码192个氨基酸的多肽。与10个基因型UPECpapA核苷酸序列和推导的氨基酸序列进行同源性比较,结果分别为36.11%~77.95%和22.20%~78.34%;与papA基因分型多重PCR引物序列比较,下游分型引物在UPEC4030papA相应位置上的序列同源性只有10%~66.67%,推测该菌株papA为未知的基因型。结论UPEC4030papA为未知的基因型,相关致病机制和流行病学意义值得深入研究。
关键词
尿道致病性大肠埃希菌
基因
测序
未知
的
基因
型
Keywords
uropathogenic E.coli,gene sequencing,unkown genotype
分类号
R695 [医药卫生—泌尿科学]
R378.21 [医药卫生—病原生物学]
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职称材料
题名
一株未知黏附基因型的尿道致病性大肠埃希菌UPEC4030株的基因分析
被引量:
1
2
作者
吴庆刚
张敬平
陈锦英
郑明寰
尤凤兴
姜永
机构
无锡市疾病预防控制中心
天津医科大学基础医学院
中国疾病预防控制中心传染病预防控制所
出处
《中华流行病学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2008年第11期1123-1127,共5页
基金
卫生部科研基金资助项目(WKJ2006-2-10)
文摘
目的比较尿道致病性大肠埃希菌UPEC4030株papG和papA基因与相关序列的差异,以明确UPEC4030 papA基因变异情况及与papG的组合形式,确定是否为未知基因型。方法采用基因克隆测序方法,分别对UPEC4030株papG和papA基因进行序列分析,并与相关序列进行比较。结果UPEC4030 papA由722个碱基对组成,编码192个氨基酸的多肽。与10个基因型UPEC papA核苷酸序列和推导的氨基酸序列同源性比较,分别为36.11%~77.95%和22.20%~78.34%;与papA基因分型多重PCR引物序列比较,下游分型引物在UPECA030 papA相应位置上的序列同源性只有10.00%~66.67%,表明该菌株papA确实为未知的基因型。UPECA030菌株papG全基因片段由1100个碱基组成,编码337个氨基酸的多肽,其核苷酸及推导的氨基酸序列与Ⅱ型papG代表株UPECIA2相比较,同源性分别为99.00%和99.11%,表明UPEC4030 papG属于Ⅱ型。结论UPEC4030 papA为未知的基因型,其papG属于Ⅱ型。
关键词
尿道致病性大肠埃希菌
基因
测序
未知基因型
Keywords
Uropathogenic Escherichia coli
Gene sequencing
Unkown genotype
分类号
R378 [医药卫生—病原生物学]
原文传递
题名
泰国输华斑节对虾传染性皮下和造血器官坏死病毒的检测与分析
3
作者
于力
刘莹
郑晓聪
王津津
贾鹏
何俊强
刘荭
机构
深圳出入境检验检疫局动植物检验检疫技术中心
出处
《中国动物检疫》
CAS
2016年第6期83-85,89,共4页
基金
国家质检总局科技计划项目(2010IK007)
文摘
为研究进口斑节对虾传染性皮下和造血器官坏死病毒(Infectious Hypodermal and Hematopoietic Necrosis Virus,IHHNV)的风险,本文采用了世界动物卫生组织(OIE)2015版手册中推荐的PCR方法,对2015年从泰国输华的329批次斑节对虾进行了IHHNV检测分析。结果发现,其阳性率高达36.8%,且主要是感染1型和2型,以及风险不明的未知型。因此,来自泰国的斑节对虾具有较高的IHHNV传入风险,应加强针对IHHNV的进口监测,减少其对我国对虾养殖的影响。
关键词
传染性皮下和造血器官坏死病毒
斑节对虾
未知基因型
风险
Keywords
IHHNV
Penaeus monodon
unknown genotype
risks
分类号
S851.34 [农业科学—预防兽医学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
尿道致病性大肠埃希菌UPEC4030株papA基因的克隆和序列分析
吴庆刚
张敬平
赵春城
诸建国
钮伟民
陈锦英
尤凤兴
姜永
《卫生研究》
CAS
CSCD
北大核心
2008
0
下载PDF
职称材料
2
一株未知黏附基因型的尿道致病性大肠埃希菌UPEC4030株的基因分析
吴庆刚
张敬平
陈锦英
郑明寰
尤凤兴
姜永
《中华流行病学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2008
1
原文传递
3
泰国输华斑节对虾传染性皮下和造血器官坏死病毒的检测与分析
于力
刘莹
郑晓聪
王津津
贾鹏
何俊强
刘荭
《中国动物检疫》
CAS
2016
0
下载PDF
职称材料
已选择
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