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尿道致病性大肠埃希菌UPEC4030株papA基因的克隆和序列分析
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作者 吴庆刚 张敬平 +5 位作者 赵春城 诸建国 钮伟民 陈锦英 尤凤兴 姜永 《卫生研究》 CAS CSCD 北大核心 2008年第5期574-577,共4页
目的比较尿道致病性大肠埃希菌UPEC4030株papA与相关序列的差异,明确是否为未知的基因型。方法采用PCR扩增、基因克隆与测序分析方法,分别对UPEC4030株papA进行基因与氨基酸序列分析,并与相关序列进行比较。结果UPEC4030papA由722个碱... 目的比较尿道致病性大肠埃希菌UPEC4030株papA与相关序列的差异,明确是否为未知的基因型。方法采用PCR扩增、基因克隆与测序分析方法,分别对UPEC4030株papA进行基因与氨基酸序列分析,并与相关序列进行比较。结果UPEC4030papA由722个碱基对组成,编码192个氨基酸的多肽。与10个基因型UPECpapA核苷酸序列和推导的氨基酸序列进行同源性比较,结果分别为36.11%~77.95%和22.20%~78.34%;与papA基因分型多重PCR引物序列比较,下游分型引物在UPEC4030papA相应位置上的序列同源性只有10%~66.67%,推测该菌株papA为未知的基因型。结论UPEC4030papA为未知的基因型,相关致病机制和流行病学意义值得深入研究。 展开更多
关键词 尿道致病性大肠埃希菌 基因测序 未知基因
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一株未知黏附基因型的尿道致病性大肠埃希菌UPEC4030株的基因分析 被引量:1
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作者 吴庆刚 张敬平 +3 位作者 陈锦英 郑明寰 尤凤兴 姜永 《中华流行病学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2008年第11期1123-1127,共5页
目的比较尿道致病性大肠埃希菌UPEC4030株papG和papA基因与相关序列的差异,以明确UPEC4030 papA基因变异情况及与papG的组合形式,确定是否为未知基因型。方法采用基因克隆测序方法,分别对UPEC4030株papG和papA基因进行序列分析,并... 目的比较尿道致病性大肠埃希菌UPEC4030株papG和papA基因与相关序列的差异,以明确UPEC4030 papA基因变异情况及与papG的组合形式,确定是否为未知基因型。方法采用基因克隆测序方法,分别对UPEC4030株papG和papA基因进行序列分析,并与相关序列进行比较。结果UPEC4030 papA由722个碱基对组成,编码192个氨基酸的多肽。与10个基因型UPEC papA核苷酸序列和推导的氨基酸序列同源性比较,分别为36.11%~77.95%和22.20%~78.34%;与papA基因分型多重PCR引物序列比较,下游分型引物在UPECA030 papA相应位置上的序列同源性只有10.00%~66.67%,表明该菌株papA确实为未知的基因型。UPECA030菌株papG全基因片段由1100个碱基组成,编码337个氨基酸的多肽,其核苷酸及推导的氨基酸序列与Ⅱ型papG代表株UPECIA2相比较,同源性分别为99.00%和99.11%,表明UPEC4030 papG属于Ⅱ型。结论UPEC4030 papA为未知的基因型,其papG属于Ⅱ型。 展开更多
关键词 尿道致病性大肠埃希菌 基因测序 未知基因型
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泰国输华斑节对虾传染性皮下和造血器官坏死病毒的检测与分析
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作者 于力 刘莹 +4 位作者 郑晓聪 王津津 贾鹏 何俊强 刘荭 《中国动物检疫》 CAS 2016年第6期83-85,89,共4页
为研究进口斑节对虾传染性皮下和造血器官坏死病毒(Infectious Hypodermal and Hematopoietic Necrosis Virus,IHHNV)的风险,本文采用了世界动物卫生组织(OIE)2015版手册中推荐的PCR方法,对2015年从泰国输华的329批次斑节对虾进行了IHHN... 为研究进口斑节对虾传染性皮下和造血器官坏死病毒(Infectious Hypodermal and Hematopoietic Necrosis Virus,IHHNV)的风险,本文采用了世界动物卫生组织(OIE)2015版手册中推荐的PCR方法,对2015年从泰国输华的329批次斑节对虾进行了IHHNV检测分析。结果发现,其阳性率高达36.8%,且主要是感染1型和2型,以及风险不明的未知型。因此,来自泰国的斑节对虾具有较高的IHHNV传入风险,应加强针对IHHNV的进口监测,减少其对我国对虾养殖的影响。 展开更多
关键词 传染性皮下和造血器官坏死病毒 斑节对虾 未知基因型 风险
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