非培养方法在土壤微生物生态学研究中的应用

由于有相当数量的土壤微生物是目前不可培养的 ,因此利用传统培养技术来研究土壤微生物 ,不仅费时费力 ,所得到的结果可能和真实的情况相差甚远。近年来发展了三类不需培养的方法来研究土壤微生物的种类和数量 ,这些方法大体上分为生物化学、生理学和分子生物学三类。生物化学方法主要根据细胞膜磷脂酸 (PLFA)的种类和数量来判定微生物的多样性 ;BIOLOG微量板分析系统是生理学方法的代表 ,它主要是根据土样细胞悬液对 95种单一碳源的利用模式来说明群落结构的变化 ;分子生物学方法是发展应用最广的方法 ,基本步骤是提取土壤的总DNA ,然后用通用引物或选择性高的引物来扩增 16SrRNA基因。由于对扩增产物分析方法的不同 ,该方法又可分为PCR DGGE ,PCR RFLP等。最近在PCR RFLP基础上发展起来的T RFLP分析方法 ,将微生物的多样性分析工作同RDP(ribosomaldatabaseproject)数据库结合 ,充分利用了Internet的数据资源共享的优势 ,具有分辨率高 ,可实现自动化等优点 ,是未来土壤微生物生态学研究的有力工具。

三七根腐病株根际土壤真菌群落组成与碳源利用特征研究

根腐病是药用植物三七Panax notoginseng的多发性病害,而土壤真菌群落组成与根腐病的发生存在一定的联系。利用末端限制性酶切片段长度多态性分析和Biolog技术研究了云南文山三七种植园健康和发病三七植株根际土壤真菌群落结构和碳源利用特征,结果表明健康和发病植株的根际土壤真菌多样性和代谢活性差异不显著,但是真菌群落组成存在差异。健康和发病植株根际土壤都以小茎点霉Phoma exigua及镰孢菌属Fusarium真菌为主要种群,而健康植株根际土壤中火丝菌属Pyronema和被孢霉属Mortierella等真菌类群的相对丰度显著高于发病植株根际土壤,尖孢镰孢菌F.ox‐ysporum和刺座霉属的Volutella colletotrichoides的相对丰度则显著低于发病植株。