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BPA暴露对本体和子代胰岛β细胞转录组差异对比分析
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作者 姬晓彤 岳慧峰 +1 位作者 武美琼 白剑英 《环境化学》 CAS CSCD 北大核心 2021年第2期509-519,共11页
双酚A(BPA)作为一种典型的环境内分泌干扰物,与二型糖尿病和肥胖症等代谢类疾病密切相关.在这项研究中,旨在探讨BPA直接暴露以及围产期暴露对本体和子代胰岛β细胞影响的差异,从而实现对不同易感人群的精准预防与治疗.通过对GEO数据库中... 双酚A(BPA)作为一种典型的环境内分泌干扰物,与二型糖尿病和肥胖症等代谢类疾病密切相关.在这项研究中,旨在探讨BPA直接暴露以及围产期暴露对本体和子代胰岛β细胞影响的差异,从而实现对不同易感人群的精准预防与治疗.通过对GEO数据库中GSE126297和GSE82175两个数据集进行分析,共筛选出108个共有的差异基因,其中28个表达趋势一致,而另外80个表达趋势相反.随后对本体和子代单独的差异基因,以及共有差异基因进行了GO和KEGG对比分析.此外,利用String数据库和Cytoscape分析PPI网络中的紧密联系的基因,并将其可视化,进一步从28个表达趋势一致的基因中筛选出相互作用最为紧密的基因集1(Iqgap2,Igf2r和Rab18);从80个表达趋势相反的基因中筛选出相互作用紧密的基因集2(Polr2f,Ccnt2,Polr2e,Kdm7a,Fbl)和基因集3(Atp5g2,Atp5o和Ndufa6).最后,通过GEPIA在线验证上述基因在胰腺癌样本中的表达,研究发现Rab18,Polr2f,Polr2e,Fbl,Atp5g2,Atp5o和Ndufa6在胰腺癌病例中的表达均显著上升.同时,上述基因在本体中呈现显著上升趋势,而对于子代,只有Rab18显著上升,其他基因则呈下降趋势.综上,BPA对本体和子代的影响有一定的关联,其中关联的关键基因的异常表达可能会增加本体罹患胰腺癌的风险,而对于子代则会影响代谢过程和细胞结构. 展开更多
关键词 双酚A(BPA) 本体子代 胰岛Β细胞 生信分析
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SSR Analysis of Three Species from Primary Parent and Their First Generation of Litopenaeus vannamei 被引量:2
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作者 栗志民 谢丽 +1 位作者 叶富良 陈国良 《Agricultural Science & Technology》 CAS 2010年第3期57-61,共5页
Genetic variations of three species from primary parent (OI Q,SIS Q,Kona Bay Q) and their first filial generation (OI Z,SIS Z,Kona Bay Z) of Litopenaeus vannamei were detected using microsatellite marker technique... Genetic variations of three species from primary parent (OI Q,SIS Q,Kona Bay Q) and their first filial generation (OI Z,SIS Z,Kona Bay Z) of Litopenaeus vannamei were detected using microsatellite marker technique.The amplified products of genomic DNA with 8 microsatellite makers indicated that 8 loci presents polymorphism,the number of total alleles were 28 in 6 species;the number of allele of every loci was 2 to 6;mean allele number (Na) was 3.5;expected heterozygosity value (He) were higher than observed heterozygosity value (Ho);mean polymorphism information content (PIC) ranged from 0.479 4 to 0.769 9,which showed these 8 loci posses relatively high information content.Through analysis of genetic structure in primary parent and their first filial,allele and effective allele number,observed heterozygosity and expected heterozygosity values and mean polymorphism information content (PIC) in filial generation were little lower than their primary parents.However,genetic diversity of filial generation is not influenced,and still maintains a good heritability. 展开更多
关键词 Litopenaeus vanname MICROSATELLITE Brood and F1 stocks Genetic variation
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