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ABINIT高通量第一性原理计算和数据管理集成框架的研发
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作者 周嘉欣 杨小渝 +1 位作者 王宗国 赵旭山 《科研信息化技术与应用》 2019年第1期48-58,共11页
构建集成的高通量材料集成计算平台和材料数据库已成为加快新材料研发的重要基础性工作,高通量材料计算平台Mat Cloud提供了一个集成的材料自动流程计算框架,软件ABINIT被广泛应用于第一性原理计算研究中。本文基于Mat Cloud平台研发了A... 构建集成的高通量材料集成计算平台和材料数据库已成为加快新材料研发的重要基础性工作,高通量材料计算平台Mat Cloud提供了一个集成的材料自动流程计算框架,软件ABINIT被广泛应用于第一性原理计算研究中。本文基于Mat Cloud平台研发了ABINIT软件的集成框架,实现了应用ABINIT软件开展结构优化和能量计算的自动计算流程。本文还基于Mat Cloud平台开发了能够进行数据知识产权保护的Handle标识。以AlxZr1-x合金为例,对其二元能量相图进行了计算,取得了与实验相吻合的结果。 展开更多
关键词 第一性原理计算 高通量材料计算 材料性质计算 ABINIT软件集成 Handle标识
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一种集成LAMMPS分子动力学软件的参数描述方法和规范 被引量:3
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作者 虞超 杨小渝 +1 位作者 赵旭山 王宗国 《科研信息化技术与应用》 2018年第4期3-14,共12页
分子动力学是从原子尺度研究材料性质的方法,相对于第一性原理计算方法,分子动力学适合于较大空间尺度和较长时间尺度的材料性质研究。分子动力学中模拟尺度常用的软件是LAMMPS。但LAMMPS软件参数较为复杂,给在第三方平台集成LAMMPS软... 分子动力学是从原子尺度研究材料性质的方法,相对于第一性原理计算方法,分子动力学适合于较大空间尺度和较长时间尺度的材料性质研究。分子动力学中模拟尺度常用的软件是LAMMPS。但LAMMPS软件参数较为复杂,给在第三方平台集成LAMMPS软件带来了难度。具体表现:首先LAMMPS软件中不同材料性质计算(如粘度计算、热导率计算等)参数组合不一致问题;其次LAMMPS软件中不同LAMMPS命令(如fix、pair_style、compute等)参数组合不一致问题;最后LAMMPS软件中同一个LAMMPS命令中参数组合不一致问题。为了使LAMMPS软件的集成开发用户高效的开展集成工作,本文提出LAMMPS参数数据规范和LAMMPS参数解析引擎。首先通过LAMMPS参数数据规范将LAMMPS软件中不同参数组合纳入参数数据规范体系。然后我们通过LAMMPS参数解析引擎来统一解析不同的参数组合,从而以通用且友好的方式集成LAMMPS软件中的不同材料性质计算工具。 展开更多
关键词 分子动力学 LAMMPS 参数描述方法 参数解析引擎 材料性质计算
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Two-dimensional Pd-based nanomaterials for bioapplications 被引量:4
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作者 Xiaolan Chen Saige Shi +2 位作者 Jingping wei Mei Chen Nanfeng Zheng 《Science Bulletin》 SCIE EI CAS CSCD 2017年第8期579-588,共10页
Noble metal nanomaterials have been extensively explored in cancer diagnostic and therapeutic applica- tions owing to their unique physical and chemical properties, such as facile synthesis, straightforward surface fu... Noble metal nanomaterials have been extensively explored in cancer diagnostic and therapeutic applica- tions owing to their unique physical and chemical properties, such as facile synthesis, straightforward surface functionalization, strong photothermal effect, and excellent biocompatibility. Herein, we summa- rize the recent development of two-dimensional (2D) Pd-based nanomaterials and their applications in cancer diagnosis and therapy. Different synthetic strategies for Pd nanosheets and the related nanostruc- tures, including Pd@Au, Pd@Ag nanoplates and mesocrystalline Pd nanocomlla, are first discussed. Together with their unique properties, the potential bioapplications of these 2D Pd nanomaterials are then demonstrated. With strong absorption in near-infrared (NIR) region, these nanomaterials have great potentials in cancer photothermal therapy (PTr). They also readily act as contrast agents in photoacoustic (PA) imaging or X-ray computed tomography (CT) to achieve image-guided cancer therapy. Moreover, significant efforts have been devoted to studying the combination of PTr and other treatment modalities (e.g., chemotherapy or photodynamic therapy) based on Pd nanomaterials. The remarkable synergistic or collaborative effects to achieve better therapeutic efficacy are discussed as well. Additionally, the biosaf- ety of 2D Pd-based nanomaterials in vitro and in vivo was evaluated. Finally, challenges for the applica- tions of Pd-based nanomaterials in cancer diagnosis and therapy, and future research prospects are highlighted. 展开更多
关键词 2D nanomaterials PALLADIUM Optical properties BIOIMAGING Photothermal therapy Combination therapy
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