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全基因组关联分析SGRQ遗传变异与吸烟的关系(英文)
被引量:
1
1
作者
郝心颖
朱军
《浙江大学学报(农业与生命科学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2014年第4期431-439,共9页
慢性阻塞性肺病作为人类第四大疾病,它的遗传倾向和性别影响一直是热门话题,而吸烟被认为是肺疾病的主要危险因素.本文基于从dbGaP下载的数据,运用我们提出的混合线性模型方法和关联分析软件QTLNetwork,分析了慢性阻塞性肺病复杂性状的...
慢性阻塞性肺病作为人类第四大疾病,它的遗传倾向和性别影响一直是热门话题,而吸烟被认为是肺疾病的主要危险因素.本文基于从dbGaP下载的数据,运用我们提出的混合线性模型方法和关联分析软件QTLNetwork,分析了慢性阻塞性肺病复杂性状的遗传变异.运用全基因组关联条件定位的方法,检测到与吸烟无关的8个基因(CSMD1,CAPN8,TNS1,LOC643037,LRFN2,DGKH,FOXL1,DNAH11)、被吸烟诱导的6个基因(CSMD1,CNTNAP5,DGKH,MACROD2,CNIH3,DNAH11)和被吸烟抑制的5个基因(GSDMC,DGKH,LINC00426,METTL4,BMP2)及1对上位基因(CSMD1,LOC643037).其中,具有显著的高遗传性的基因有TNS1,DGKH,MACROD2,CNIH3,LINC00426,METTL4和GSDMC.讨论了吸烟及性别对SGRQ疾病基因表达的影响.
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关键词
慢性阻塞性肺病
全
基因
组关联分析
混合线性模型
条件基因定位
数量性状单核苷酸多态性
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职称材料
题名
全基因组关联分析SGRQ遗传变异与吸烟的关系(英文)
被引量:
1
1
作者
郝心颖
朱军
机构
浙江大学数学系
浙江大学农业与生物技术学院农学系
浙江大学空气污染与健康研究中心
出处
《浙江大学学报(农业与生命科学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2014年第4期431-439,共9页
基金
Project supported by the National Science Foundation of China(No.31371250)
文摘
慢性阻塞性肺病作为人类第四大疾病,它的遗传倾向和性别影响一直是热门话题,而吸烟被认为是肺疾病的主要危险因素.本文基于从dbGaP下载的数据,运用我们提出的混合线性模型方法和关联分析软件QTLNetwork,分析了慢性阻塞性肺病复杂性状的遗传变异.运用全基因组关联条件定位的方法,检测到与吸烟无关的8个基因(CSMD1,CAPN8,TNS1,LOC643037,LRFN2,DGKH,FOXL1,DNAH11)、被吸烟诱导的6个基因(CSMD1,CNTNAP5,DGKH,MACROD2,CNIH3,DNAH11)和被吸烟抑制的5个基因(GSDMC,DGKH,LINC00426,METTL4,BMP2)及1对上位基因(CSMD1,LOC643037).其中,具有显著的高遗传性的基因有TNS1,DGKH,MACROD2,CNIH3,LINC00426,METTL4和GSDMC.讨论了吸烟及性别对SGRQ疾病基因表达的影响.
关键词
慢性阻塞性肺病
全
基因
组关联分析
混合线性模型
条件基因定位
数量性状单核苷酸多态性
Keywords
chronic obstructive pulmonary disease (COPD)
genome-wide association study (GWAS)
linearmixed model
conditional gene mapping
quantitative trait single nucleotide polymorphism (QTS)
分类号
Q811.4 [生物学—生物工程]
R394.3 [医药卫生—医学遗传学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
全基因组关联分析SGRQ遗传变异与吸烟的关系(英文)
郝心颖
朱军
《浙江大学学报(农业与生命科学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2014
1
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