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杧果CPP转录因子家族基因的鉴定及表达分析
被引量:
2
1
作者
杨楠
孙瑞青
+6 位作者
孙宇
夏煜琪
刘志鑫
高庆远
蒲金基
党志国
张贺
《植物遗传资源学报》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第5期1452-1462,共11页
为了探索杧果(Mangifera indica L.)CPP(cysteine-rich polycomb-like protein)基因家族的序列特征与表达特征,通过生物信息学的方法对杧果CPP基因家族进行序列分析,并通过q RT-PCR技术研究杧果细菌性黑斑病菌(Xcm,Xanthomonas campestr...
为了探索杧果(Mangifera indica L.)CPP(cysteine-rich polycomb-like protein)基因家族的序列特征与表达特征,通过生物信息学的方法对杧果CPP基因家族进行序列分析,并通过q RT-PCR技术研究杧果细菌性黑斑病菌(Xcm,Xanthomonas campestris pv.mangiferaeindicae)和胶孢炭疽菌(Cg,Colletotrichum gloeosporioides)侵染过程中杧果CPP家族基因的转录水平和组织特异性表达水平。结果表明,从杧果基因组中鉴定了10个CPP基因家族成员,均含有保守的CRC结构域,均为不稳定疏水蛋白。与梨、长春花、胡杨、水稻、葡萄和拟南芥等6个物种69个CPP转录因子成员构建系统进化树,分为7个进化分支,杧果的10个CPPs基因分布在5个进化分支中,多和梨的CPP家族成员聚类在一起。qRT-PCR分析表明,在杧果细菌性黑斑病菌(Xcm)侵染过程中,MiCPP1和MiCPP2在侵染3 h、6 h、12 h时上调表达;杧果胶孢炭疽菌(Cg)侵染的0~72 h时,MiCPP8呈上调表达,而MiCPP9则为下调表达;为后续开展杧果CPP基因家族成员响应病原菌侵染的机制研究奠定基础。qRT-PCR分析表明,MiCPP8在幼叶、花、芽中的相对表达量均很高,而MiCPP7在幼叶、花、芽中的相对表达量很低,MiCPP4与MiCPP9在幼叶、花中的相对表达量高而在芽中的表达量却很低,MiCPP6在花中的相对表达量很低,说明杧果MiCPPs基因家族成员在不同组织中具有表达的特异性。
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关键词
杧果
CPP转录因子
杧果细菌性黑斑病菌
杧果胶孢炭疽菌
qRT-PCR
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题名
杧果CPP转录因子家族基因的鉴定及表达分析
被引量:
2
1
作者
杨楠
孙瑞青
孙宇
夏煜琪
刘志鑫
高庆远
蒲金基
党志国
张贺
机构
海南大学热带作物学院
中国热带农业科学院环境与植物保护研究所/农业农村部热带作物有害生物综合治理重点实验室
中国热带农业科学院热带生物技术研究所
中国热带农业科学院热带作物品种资源研究所
出处
《植物遗传资源学报》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第5期1452-1462,共11页
基金
国家重点研发计划(2019YFD1000504,2019YFD1001103)
中国热带农业科学院基本科研业务费专项资金(1630042021022,1630042017019)~~。
文摘
为了探索杧果(Mangifera indica L.)CPP(cysteine-rich polycomb-like protein)基因家族的序列特征与表达特征,通过生物信息学的方法对杧果CPP基因家族进行序列分析,并通过q RT-PCR技术研究杧果细菌性黑斑病菌(Xcm,Xanthomonas campestris pv.mangiferaeindicae)和胶孢炭疽菌(Cg,Colletotrichum gloeosporioides)侵染过程中杧果CPP家族基因的转录水平和组织特异性表达水平。结果表明,从杧果基因组中鉴定了10个CPP基因家族成员,均含有保守的CRC结构域,均为不稳定疏水蛋白。与梨、长春花、胡杨、水稻、葡萄和拟南芥等6个物种69个CPP转录因子成员构建系统进化树,分为7个进化分支,杧果的10个CPPs基因分布在5个进化分支中,多和梨的CPP家族成员聚类在一起。qRT-PCR分析表明,在杧果细菌性黑斑病菌(Xcm)侵染过程中,MiCPP1和MiCPP2在侵染3 h、6 h、12 h时上调表达;杧果胶孢炭疽菌(Cg)侵染的0~72 h时,MiCPP8呈上调表达,而MiCPP9则为下调表达;为后续开展杧果CPP基因家族成员响应病原菌侵染的机制研究奠定基础。qRT-PCR分析表明,MiCPP8在幼叶、花、芽中的相对表达量均很高,而MiCPP7在幼叶、花、芽中的相对表达量很低,MiCPP4与MiCPP9在幼叶、花中的相对表达量高而在芽中的表达量却很低,MiCPP6在花中的相对表达量很低,说明杧果MiCPPs基因家族成员在不同组织中具有表达的特异性。
关键词
杧果
CPP转录因子
杧果细菌性黑斑病菌
杧果胶孢炭疽菌
qRT-PCR
Keywords
Mangifera indica L.
CPP transcription factor
Xanthomonas campestris pv.mangiferaeindicae
Colletotrichum gloeosporioides
qRT-PCR
分类号
S667.7 [农业科学—果树学]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
杧果CPP转录因子家族基因的鉴定及表达分析
杨楠
孙瑞青
孙宇
夏煜琪
刘志鑫
高庆远
蒲金基
党志国
张贺
《植物遗传资源学报》
CAS
CSCD
北大核心
2021
2
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