PMA激活内皮细胞早期应答基因谱分析

血管内皮细胞具有一系列重要生理功能 ,内皮细胞受外界刺激时可转录众多的mRNA ,体现了它们的生物学重要性 .内皮细胞的极早期应答基因 (Immediateearlyresponsegene ,ERG)是一类重要的介导基因 ,决定了外界刺激条件下细胞的最后反应模式 .以包含 40 96条各种人体基因的DNA芯片观察了血管内皮细胞受分化诱导剂PMA(phorbolmyristateacetate)激活后早期应答基因的表达谱 ,证实 17条ERG属已知基因 .数据处理聚类结果表明 ,多数ERG属蛋白质激酶及转录调控因子 ,2 3条上调新基因从功能上归类为ERG ;并且报道了其中的一条新基因的序列特征及其染色体位置和基因结构 ,为研究这个基因的功能提供了有力的实验依据 .

一个新的PMA诱导相关基因在Pichia pastoris酵母系统中的表达

利用包含 40 96条各种人类基因的DNA芯片研究了代谢增强剂PMA(phorbolmyristateacetate)激活的人单核巨噬细胞HTP 1的早期应答基因 ,根据已有的旧基因信息 ,实验结果基本反映了人单核巨噬细胞早期应答基因的表达谱 .选取其中一条候选早期应答基因为后续研究对象 ,并进行蛋白质的酵母表达 ,为下游的基因功能研究奠定一定的基础 .

一个新C_2H_2型锌指蛋白的功能的初步研究

通过筛选人 18周胎脑cDNA文库 ,得到一条编码 332AA的全长新基因 .生物信息学研究表明 ,该蛋白质序列有 2个C2 H2 型锌指结构 ,其中 1个锌指结构有RNA binding蛋白特异锌指的特征 .虽然同源比较发现与多种蛋白质精氨酸N端转甲基酶 (proteinarginineN methyltransferase)有一定的同源性 ,但新锌指蛋白不含转甲基酶的活性功能区域 ,属功能未知的基因 .利用基因芯片研究功能未知基因的表达是一种较好的手段 ,通过代谢增强剂PMA(phorbolmyristateacetate)刺激培养的血管内皮细胞 ,观察细胞受激活后新锌指蛋白基因的表达变化 ,结果表明新基因表达量提高了 11倍以上 ,证实新基因属内皮细胞的极早期应答基因 (Immediateearlyre sponsegene ,ERG) .