新型法尼基转移酶抑制剂的发现及构效关系分析

本文选择法尼基转移酶(FTase)作为靶标,利用计算机辅助药物设计Schr?dinger软件包中Glide v4.0程序进行虚拟筛选,获得了13个结构新颖、具备中等活性法尼基转移酶抑制剂(FTIs)苗头化合物。通过分析代表性化合物8 (IC_(50)=2.29μmol·L^(-1))和18 (IC_(50)=0.41μmol·L^(-1))与法尼基转移酶的结合模式,本文发现化合物8和18并未和Zn^(2+)鳌合,说明抑制剂中极性官能团与Zn^(2+)是否鳌合并未对酶抑制活性起到决定性作用。通过分析代表性化合物的预测结合模式与构效关系,本文发现的法尼基转移酶抑制剂(FTIs)苗头化合物仍具有改造空间,为进一步的结构优化并获得高活性和高选择性抑制剂奠定基础。

部分取代芳烃发光菌毒性的HQSAR分析

采用分子全息定量构效关系(Holographic QSAR)对47个取代芳烃的发光菌生物毒性与化学分子结构之间的关系进行了研究和分析.分子全息表征方法所构建的结构活性模型比传统的理化表征和其他基于碎片的低连接性表征方法优越,由模型所得到的交互检验预测结果拟合相关系数为Q2=0.904.模型的质量随碎片大小而改变,碎片范围变化较大.因为分子全息方法表征的是有机污染物与配体之间相互作用的内在信息,所以这种相对简单的分子碎片表征方法能够反映出分子结构的细微性质.

演化自适应建模在QSAR研究中的应用

演化自适应建模利用自然选择的方法处理建模和模型优化问题,通过在模型空间中搜索问题的解来揭示输入与输出数据间存在的相关关系并以此来估计和外推系统的行为,该方法用于QSAR研究,具有稳定、适应性强、无需问题的背景知识等优点,可以获得多个较为准确描述药物构效关系的模型,既可以是线性模型,也可以是非线性模型,但对于自变量较多的问题,该方法的编码方式可能使效率下降。

调节生物被膜化合物的研究进展

细菌的生物被膜是其在自然界中一种常见的生存状态。生物被膜的形成是细菌耐药性产生的主要机制之一,也是许多感染性疾病难以控制的重要原因。由于生物被膜在传染性疾病中的突出地位和细菌多重耐药性的蔓延,目前急需研制开发出能够调节生物被膜形成的新型抗菌药物。文中对调节生物被膜形成和发育的小分子抑制剂进行了详细的综述。

新型2-苯基苯并呋喃-3-酰胺衍生物的设计、合成及对Sortase A的抑制活性

以金黄色葡萄球菌转肽酶Sortase A与底物LPXTG的结合构象为模板,设计合成了12个具有L-shape构象的2-苯基苯并呋喃-3-酰胺衍生物作为Sortase A抑制剂,并经核磁共振和高分辨质谱确认结构,其中10个目标化合物未见文献报道。体外抑制活性结果显示,9个目标化合物对Sortase A具有较好的抑制活性[IC50=(22.2~62.3)μmol/L]。构效关系分析结果表明,苯并呋喃3-位上的取代基为-CONHCH2CH(CH3)2时抑制活性较好,而为-COOH时则抑制活性丧失;2-位苄基上带有吸电子基如氰基时抑制活性较好,而为供电子基如羟基时抑制活性较差;苯并呋喃其他位置上的取代基对抑制活性未见明显影响。