DNA指纹图谱技术发展及其在十字花科蔬菜育种中的应用

十字花科蔬菜作物在我国蔬菜生产和市场供应上占有重要地位。DNA指纹图谱技术是研究植物种质资源遗传多样性、种子纯度等的有效方法,近年来该技术逐渐成熟,可以快速且准确地检测物种的真实性并对其进行鉴定和分类。本文综述了十字花科蔬菜DNA指纹图谱技术研究进展及其在品种鉴定、遗传多样性分析、杂种优势群等遗传育种中的应用,并对该技术在十字花科蔬菜育种应用中存在的问题进行分析讨论。

基于转录组测序的玫瑰及其近缘种遗传多样性分析与指纹图谱构建

【目的】分析玫瑰及其近缘种之间的遗传多样性并构建指纹图谱,为玫瑰种质资源鉴定与开发利用奠定基础。【方法】在玫瑰的传统品种、杂交繁育品种和国内外引进品种中各选择1种,取其鲜嫩叶片进行转录组测序;基于测序得到的玫瑰转录组数据,使用MISA在reads覆盖的基因组数据中查找玫瑰的SSR位点,并根据SSR位点两端的保守序列使用Primer 3.0设计引物。选取10种玫瑰的DNA作为试验材料,筛选设计、合成后的引物。以48份玫瑰及其近缘种的DNA作为试验材料,利用筛选出的峰值较好的引物进行TP-M13-SSR PCR,并对其扩增产物进行毛细管电泳检测,应用GeneMarker 2.2.0(SoftGenetics,USA)读取毛细管电泳数据并用Excel进行整理;使用POPGEN VERSION 1.32计算筛选引物的观测杂合度、期望杂合度、Nei’s遗传多样性指数、观测等位基因数、有效等位基因数、Shannon信息指数,并用CERVUS version 3.0计算多态性信息含量。利用Powermarker计算玫瑰及其近缘种各种质之间的遗传距离;采用NTSYSpc 2.10e计算每2个种质之间的遗传相似性系数,并绘制UPGMA聚类树状图。最后采用引物与基因型组合的方式构建玫瑰及其近缘种的指纹图谱。【结果】基于玫瑰样品转录组测序数据,使用MISA共检测出48796个SSR位点,分布于139712条Unigene中,碱基重复类型数量最多的为二核苷酸重复和三核苷酸重复,分别为20628和12828个。使用Primer 3.0以SSR位点两端的保守序列为依据初步设计并合成了144对引物;以10个玫瑰品种的DNA作为模板筛选引物,共筛选出峰值较好的28对引物。以48份玫瑰及其近缘种的DNA为试验材料,28对引物在48份试验材料中均能扩增出峰型良好、多态性高的DNA片段;28对引物的观测杂合度、期望杂合度、Nei’s遗传多样性指数、观测等位基因数、有效等位基因数、Shannon信息指数和多态性信息含量的平均值分别为0.4101,0.7505,0.7011,4.607个,3.5116个,1.3442和0.6526。大多数供试样品间的遗传距离为0.6000~0.8000;聚类分析结果显示,在遗传相似系数为0.571时,48份玫瑰及其近缘种被分为两类。运用核心引物法筛选出的4对核心引物可将48份试验材料全部区分开,并构建了其指纹图谱。【结论】开发并筛选出28对多态性较好的SSR引物,可用于后续玫瑰的遗传多样性分析、遗传图谱构建、遗传稳定性鉴定等方面。

DNA指纹图谱技术及其在玉米遗传育种上的应用

DNA指纹技术所检测的是基因组DNA水平的差异,适合于品种资源、育种材料和杂种的鉴定工作。本文简要叙述了DNA指纹图谱技术的发展概况、特点,常用指纹图谱技术的原理及其优缺点,以及这些技术在玉米遗传育种中的应用。另外,对目前指纹技术存在的问题和发展前景进行了探讨。

DNA指纹图谱在遗传育种中的应用

ＤＮＡ指纹图谱在遗传育种中的应用孙金梅（西北农业大学动物科学系陕西杨陵７１２１００）生物的不同个体或不同种群在ＤＮＡ结构上存在着差异，即ＤＮＡ的多态性。个体的ＤＮＡ用内切酶切断后，片断的数目和长度具有高度的个体特异性，经过凝胶电泳，或以特定的探针作Ｓ...

分子标记技术在林木遗传育种中的应用

分子标记是一种新型的遗传标记，它为包括林木在内的植物遗传育种研究提供了新的手段，在缩短育种周期、提高育种效益等方面展现了广阔的应用前景。本文着重介绍分子标记技术在林木遗传育种中的应用：（１）指纹图谱绘制和基因型鉴定；（２）种质资源和育种群体的遗传结构分析；（３）遗传连锁图谱构建；（４）数量性状定位；（５）分子标记辅助选择；（６）目的基因定位与分离。

DNA和RAPD-PCR基因分析和指纹图谱在桉树遗传分析上的应用

对树种、亚种和后代的完全确定通常不是一件容易的事情,有的仅靠生物形态学是根本不可能区分的。因此,人们急切寻求一种可信度高,重复性强和具有对树种有独一识别能力的基因分析技术。分子标记的出现提供了这样的技术,满足了人们的需要。它具有对按树在 DNA 水平上的种间和种内的多形态变化的识别和评估能力。在本研究中。我们应用随机扩增多态性DNA 的专一的引导物探针(RAPD-PCR)去分析小帽桉树 E.microcorys 的四个重复,以及他们和山桉 E.dalrympleanna 和 Grevillea树的区别之处。这种技术具有较灵活的变异性.特别是对所提取的 DNA 分子的起源和质量可进行分析,我们已论证了该技术的过程和使用条款可应用于所有植株类型的组织类别,我们的结果显示了 PAPD 技术是一个快捷、精确、敏捷和相对便宜的林木基因分析方法。

9种鱼类非放射性DNA指纹图谱

用DIG标记Jeffreys人源小卫星 33.6和 33.15为探针 ,与青鱼、草鱼、鲢、鳙、鲤、团头鲂、鳜鱼、尼罗罗非鱼、奥利亚罗非鱼基因组DNA进行Southern杂交 ,获得多态性丰富的个体特异性DNA指纹图谱 ,建立了 9种鱼类的非放射性DNA指纹图谱。用DIG标记小卫星探针制作鱼类DNA指纹图谱安全可靠 ,克服了用放射性元素标记探针制作鱼类DNA指纹图谱的限制和不足 ,拓宽了鱼类DNA指纹图谱的应用范围。 9种鱼类的非放射性DNA指纹图谱研究也表明不同的DNA指纹探针在不同的鱼类上揭示的遗传信息不同 ,对鱼类的DNA指纹图谱研究应选择数个适宜的限制酶

DNA指纹图谱技术及其在中药研究中的应用

目的介绍DNA指纹图谱技术,阐述其在中药研究中的作用。方法综合介绍建立DNA指纹图谱的一般技术步骤,结合近年来国内外在这方面的研究,探讨其在中药有关领域的应用。结论作为中药指纹图谱的一个组成部分,DNA指纹图谱这一现代分子生物学技术在现代中药研究中有其独特的作用,目前应用于中药研究的DNA指纹技术有RFLP、PCR、RAPD、PCR-RFLP、RAPD-RFLP、AFLP等。DNA指纹图谱技术在药材鉴别、GAP实施、道地药材研究、遗传育种和种质资源研究及中成药质量控制等领域有重要价值和广阔的应用前景。

桑树多倍体育种材料遗传背景的AFLP分析

利用AFLP(AmplifiedFragmentLengthPolymorphism)分子标记技术 ,即扩增片段长度多态性 ,从DNA分子水平对 19份人工三倍体桑育种材料进行了遗传背景分析 ,构建了指纹图谱。 19份育种材料可组配 70个杂交组合 ,各材料间AFLP相似系数大于 0 75 0 0的有 5 4个组合 ,经AFLP分析认为 ,它们不宜作亲本间杂交组合 ;AFLP相似系数小于 0 75 0 0的有 16个组合 ,经AFLP分析认为它们适于作亲本间杂交组合。

广西马尾松第一代育种群体遗传多样性

利用SSR分子标记技术构建了广西马尾松第一代育种群体464个无性系的指纹图谱,并分析了该育种群体的遗传多样性。研究结果表明,广西马尾松第一代群体的平均等位基因数为3.19,多态率为100%;平均有效等位基因数为1.79;Shannon多样性指数平均为0.65,平均观测杂合度为0.40,表明该育种群体具有较高的遗传多样性。同时发现,来源于人工林优树无性系的平均等位基因数高于来源于天然林优树无性系,而天然林优树无性系的近交系数低于人工林优树无性系。

RAPD技术及其在林木遗传研究中的应用

阐述了RAPD分子标记技术的基本原理及其在林木指纹图谱构建、群体遗传变异和系统进化及分类、遗传连锁图谱构建、数量性状定位等方面的应用 并对存在的问题进行了讨论 。

AFLP标记及其在园艺植物遗传育种中的应用

AFLP(扩增片段长度多态性)标记是一种新的 DNA 分子标记技术.对其基本原理、方法及特点做了简要介绍。从遗传多样性和亲缘关系分析、品种鉴定和指纹图谱构建、遗传图谱构建、基因定位与克隆、QTL 定位、标记辅助选择育种、基因表达与调控研究等方面概述了 AFLP 标记在园艺植物上的应用进展,并对其存在的问题和应用前景做了探讨。

SNP分子标记及其在木本植物遗传育种的应用

木本植物因其生命周期长、基因组杂合度高、基因组较大、遗传背景不清晰等特性,制约了其研究进程。随着现代生物技术的发展,DNA分子标记技术在木本植物研究领域的应用越来越多,其中单核苷酸多态性(SNP)作为第三代分子标记技术以其高效、快速、稳定、可靠等诸多优点得到广泛应用。本文简述SNP标记的特点、开发方法、检测方法及其在木本植物遗传多样性和亲缘关系分析、品种鉴定、连锁图谱构建和辅助育种等方面的研究进展,为更好地应用SNP技术开展木本植物研究提供参考。

分子标记在小麦遗传育种中的应用

在遗传育种工作中,遗传标记是重要工具,对遗传标记在杂交后代的分离类型进行分析,是了解这些标记以及它们紧密连锁的基因所控制性状的遗传性的主要途径.

AFLP技术在马铃薯育种中的应用

AFLP技术因其高效、稳定而被广泛应用于多种作物,本文详细阐述了AFLP技术的原理、特点及其在马铃薯育种中的应用,主要包括遗传多样性分析,构建高密度遗传连锁图,基因定位及克隆,DNA指纹图谱等。

分子标记在蔬菜种质资源和育种上的应用

介绍了分子标记技术在蔬菜遗传图谱构建、遗传多样性和亲缘关系、品种(系)指纹图谱构建以及杂种纯度鉴定、基因定位和分子标记辅助选择等领域的应用,并探讨了其应用前景和存在的问题。

斑鳢Channa.maculata(♀)×乌鳢C.argus(♂)杂交子代及其亲本的遗传关系分析与鉴定

应用RAPD技术研究闽香鳢及其亲本之间在遗传结构、种群多样性上的相互关系,由此为探讨种质鉴定提供依据。在所用的90个随机引物中,有35个引物在闽香鳢及其亲本之间呈现多态。通过RAPD分析,获取了闽香鳢及其亲本的RAPD指纹图带。结果表明闽香鳢与斑鳢或乌鳢的遗传距离要比其父母本之间的遗传距离近,即闽香鳢为父母本杂交所产生的后代。闽香鳢种群的多态性比例47.9%与杂合度H=0.122,可作为闽香鳢遗传育种的指标来检测后代的群体遗传多样性。通过多态性比较,获得2条具有群体差异性的DNA片断,大小分别为910 bp和1 011 bp,经过测序后合成特异性引物,此引物可特异性区分上述3种鱼。

AFLP技术及其在小麦遗传研究中的应用

AFLP(Amp lified Fragm ent length Polymorph ism扩增性片段长度多态性)是一种新的DNA分子标记,近年来已应用于小麦及小麦种质资源遗传多样性、种质指纹图谱构建及遗传材料鉴定、小麦遗传连锁图谱的构建、目的基因的分子定位、分子标记辅助选择等方面的研究。本文对AFLP技术原理及其在小麦遗传研究中的应用进展及前景进行了综述。

油茶高产无性系的ISSR分子鉴别

采用ISSR分子标记方法,对江西25个每hm2产量达到750 kg的油茶高产无性系进行分子鉴别研究.结果表明:从100条ISSR引物中筛选出9条具有多态性的引物进行PCR扩增,得到108个位点,其中95个为多态位点,多态比率达87.96%;建立了25个油茶无性系的DNA指纹库,并分析出这些油茶无性系分子鉴别的最优引物组合;聚类分析显示,各无性系遗传背景复杂.研究结果可为油茶新品种的登记和保护及分子标记辅助选择育种提供分子依据.

果树分子标记技术研究进展

随着分子生物学及分子克隆技术的发展和完善,诞生了直接从DNA水平上进行遗传分析的分子标记技术。为果树新品种的定向选育、加速育种进程和提高选育效率提供了新的技术手段。本文介绍了分子标记的原理、特点及其在果树上的研究进展,并对其在果树的分子遗传图谱和指纹图谱的构建、品种鉴别、系谱分析和分类、基因定位等方面的应用进行了综述。