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胡杨果糖-1,6-二磷酸醛羧酶基因PeALD的克隆及耐盐性分析
被引量:
6
1
作者
张帆
常李伟
+3 位作者
丁明全
侯佩臣
沈昕
陈少良
《基因组学与应用生物学》
CAS
CSCD
北大核心
2011年第3期257-267,共11页
胡杨(Populus euphratica Oliv)是优良的抗逆树种,有很强的耐盐碱性。前期胡杨转录组研究结果显示盐胁迫可诱导果糖-1,6-二磷酸醛羧酶基因(PeALD)转录上调,提示该基因可能对胡杨耐盐性方面有某种贡献。为分析PeALD基因在胡杨耐盐性中的...
胡杨(Populus euphratica Oliv)是优良的抗逆树种,有很强的耐盐碱性。前期胡杨转录组研究结果显示盐胁迫可诱导果糖-1,6-二磷酸醛羧酶基因(PeALD)转录上调,提示该基因可能对胡杨耐盐性方面有某种贡献。为分析PeALD基因在胡杨耐盐性中的作用,本研究以胡杨为材料,利用RT-PCR方法克隆了胡杨果糖-1,6-二磷酸醛羧酶基因的全长cDNA,通过基因转化法尝试在烟草中过量表达该基因,并对转基因株系的耐盐性进行初步分析。研究结果显示,克隆的cDNA编码果糖-1,6-二磷酸醛羧酶,ORF为1177bp,是由247个氨基酸编码的疏水性蛋白,理论等电点为6.84,分子量为26.79kD。PCR与RT-PCR检测结果表明,外源的PeALD基因通过转化已经整合到烟草的染色体中,并在4个株系中得到较强的表达。转化株系表型筛选实验表明,在200mmol/L NaCl的MS培养基中培养15d后,野生型烟草植株无明显高生长,叶片全部黄化并萎缩;而转基因烟草高生长基本没有受到抑制,植株生长良好。说明在烟草中过表达PeALD使转化植株的耐盐性显著提高。光合数据结果显示,ALD基因能够降低盐胁迫对烟草叶片净光合速率的影响,可能是PeALD过表达加速了卡尔文循环的运转,提高了CO2的固定速率,进而促进了光合活性,通过光合作用促进碳的积累,利于呼吸作用和氧化磷酸化产生ATP,为维持跨膜质子浓度梯度提供能量,从而有可能促进质膜上的Na+/H+逆向转运,利于细胞质膜保持拒盐性。这些结果初步验证了PeALD基因的耐盐性功能,为进一步深入研究该基因在耐盐机制中的作用奠定了良好基础。
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关键词
胡杨
果糖
-1
6-
二磷酸
醛
羧酶
基因
转基因烟草
碳流向
抗盐性
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职称材料
念珠菌优势抗体检测方法的建立及临床诊断价值评估
被引量:
9
2
作者
马春芳
陆静芬
+3 位作者
孔倩倩
韩丹丹
廖红
李芳秋
《医学研究生学报》
CAS
北大核心
2013年第11期1138-1141,共4页
目的侵袭性念珠菌病(invasive candidiasis,IC)是免疫功能损伤或低下患者常见的感染和死亡原因,近年来检测IC患者血清中特异性抗体的血清学诊断方法成为研究热点。本文旨在建立检测念珠菌烯醇化酶(Enolase,Eno)、果糖二磷酸醛羧酶(fruct...
目的侵袭性念珠菌病(invasive candidiasis,IC)是免疫功能损伤或低下患者常见的感染和死亡原因,近年来检测IC患者血清中特异性抗体的血清学诊断方法成为研究热点。本文旨在建立检测念珠菌烯醇化酶(Enolase,Eno)、果糖二磷酸醛羧酶(fructose-bisphosphate aldolase,Fba1)特异性抗体的ELISA方法,评估其在IC早期诊断中的应用价值。方法利用基因重组技术获得的Eno、Fba1重组蛋白作为包被抗原,建立测定人血清相应抗体的ELISA,并对方法的敏感性、特异性进行考查。结果建立了检测IC患者血清抗Eno、抗Fba1抗体的ELISA,cut-off值分别为吸光度(A)值0.370和0.610。ELISA结果显示,IC患者血清中的抗Eno、抗Fba1抗体水平明显高于健康对照和非IC患者对照(P<0.001)。抗Eno和抗Fba1对诊断IC的敏感性和特异性分别为72.3%(73/101)和98%(196/200),87.1%(88/101)和96%(192/200),联合检测可提高敏感性至91.0%。且与细菌感染及其他真菌感染患者(如曲霉病)无交叉反应。IC患者中40.6%(41/101)可以在血培养阳性前检测到抗Eno、49.5%(50/101)可以在血培养阳性前检测到抗Fba1。结论建立了检测抗Eno、抗Fba1抗体的ELISA法,检测念珠菌菌丝相分泌蛋白IgG抗体特异性和灵敏度良好,在念珠菌感染诊断中具有潜在临床应用价值。
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关键词
念珠菌
烯醇化酶
果糖二磷酸醛羧酶
抗体
ELISA
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职称材料
广东水稻核心种质耐冷萌发全基因组关联分析
被引量:
3
3
作者
丁杰荣
孙炳蕊
+8 位作者
于航
江立群
张静
吕树伟
陈文丰
范芝兰
潘大建
李晨
刘清
《植物遗传资源学报》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第5期1425-1437,共13页
萌发期耐冷性的强弱直接影响水稻直播时的成苗率。为高效地培育萌发期耐冷性强的水稻品种,本研究通过统计309份广东省水稻核心种质资源的低温萌发比率,筛选到57份萌发期耐冷性强的水稻品种。同时,以低温萌发比率为表型数据和高密度的SN...
萌发期耐冷性的强弱直接影响水稻直播时的成苗率。为高效地培育萌发期耐冷性强的水稻品种,本研究通过统计309份广东省水稻核心种质资源的低温萌发比率,筛选到57份萌发期耐冷性强的水稻品种。同时,以低温萌发比率为表型数据和高密度的SNP标记为基因型数据,利用全基因组关联分析鉴定到11个水稻低温萌发QTLs。其中qLTG2-1、qLTG7-1、qLTG7-2和qLTG10-1与前人定位的水稻低温萌发QTL共定位。qLTG11-1是本研究新鉴定的最显著的水稻低温萌发QTL。利用RNA-seq和qRT-PCR对其进行候选基因预测和验证,发现在低温萌发期间,qLTG11-1区间内的LOC_Os11g07020在低温萌发比率高和低的品种中有不同的表达模式。LOC_Os11g07020编码果糖-1,6-二磷酸醛羧酶同工酶,可能通过调控糖酵解反应而影响水稻萌发期耐冷性。本研究筛选到多份耐冷性强的水稻品种,并找到可能调控水稻萌发期耐冷性的候选基因,可为培育萌发期耐冷性强的水稻品种提供参考。
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关键词
水稻
低温萌发
果糖
-1
6-
二磷酸
醛
羧酶
全基因组关联分析
下载PDF
职称材料
题名
胡杨果糖-1,6-二磷酸醛羧酶基因PeALD的克隆及耐盐性分析
被引量:
6
1
作者
张帆
常李伟
丁明全
侯佩臣
沈昕
陈少良
机构
北京林业大学生物科学与技术学院
出处
《基因组学与应用生物学》
CAS
CSCD
北大核心
2011年第3期257-267,共11页
基金
国家自然科学基金项目(30872005)
北京市优秀博士学位论文指导教师专项基金(YB20081002201)
+1 种基金
北京市自然科学基金项目(6112017)
中央高校基本科研业务费专项资金(JC2011-2)共同资助
文摘
胡杨(Populus euphratica Oliv)是优良的抗逆树种,有很强的耐盐碱性。前期胡杨转录组研究结果显示盐胁迫可诱导果糖-1,6-二磷酸醛羧酶基因(PeALD)转录上调,提示该基因可能对胡杨耐盐性方面有某种贡献。为分析PeALD基因在胡杨耐盐性中的作用,本研究以胡杨为材料,利用RT-PCR方法克隆了胡杨果糖-1,6-二磷酸醛羧酶基因的全长cDNA,通过基因转化法尝试在烟草中过量表达该基因,并对转基因株系的耐盐性进行初步分析。研究结果显示,克隆的cDNA编码果糖-1,6-二磷酸醛羧酶,ORF为1177bp,是由247个氨基酸编码的疏水性蛋白,理论等电点为6.84,分子量为26.79kD。PCR与RT-PCR检测结果表明,外源的PeALD基因通过转化已经整合到烟草的染色体中,并在4个株系中得到较强的表达。转化株系表型筛选实验表明,在200mmol/L NaCl的MS培养基中培养15d后,野生型烟草植株无明显高生长,叶片全部黄化并萎缩;而转基因烟草高生长基本没有受到抑制,植株生长良好。说明在烟草中过表达PeALD使转化植株的耐盐性显著提高。光合数据结果显示,ALD基因能够降低盐胁迫对烟草叶片净光合速率的影响,可能是PeALD过表达加速了卡尔文循环的运转,提高了CO2的固定速率,进而促进了光合活性,通过光合作用促进碳的积累,利于呼吸作用和氧化磷酸化产生ATP,为维持跨膜质子浓度梯度提供能量,从而有可能促进质膜上的Na+/H+逆向转运,利于细胞质膜保持拒盐性。这些结果初步验证了PeALD基因的耐盐性功能,为进一步深入研究该基因在耐盐机制中的作用奠定了良好基础。
关键词
胡杨
果糖
-1
6-
二磷酸
醛
羧酶
基因
转基因烟草
碳流向
抗盐性
Keywords
Populus euphratica Oliv
Fructose-1
6-bisphosphate aldolase gene
Transgenic tobacco
Carbon metabolism
Salt tolerance
分类号
Q943.2 [生物学—植物学]
S792.119 [农业科学—林木遗传育种]
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职称材料
题名
念珠菌优势抗体检测方法的建立及临床诊断价值评估
被引量:
9
2
作者
马春芳
陆静芬
孔倩倩
韩丹丹
廖红
李芳秋
机构
南京军区南京总医院解放军临床检验医学研究所
出处
《医学研究生学报》
CAS
北大核心
2013年第11期1138-1141,共4页
基金
江苏省科技支撑计划-社会发展项目(BE2009673)
南京军区医学科技创新重点课题(10Z027)
文摘
目的侵袭性念珠菌病(invasive candidiasis,IC)是免疫功能损伤或低下患者常见的感染和死亡原因,近年来检测IC患者血清中特异性抗体的血清学诊断方法成为研究热点。本文旨在建立检测念珠菌烯醇化酶(Enolase,Eno)、果糖二磷酸醛羧酶(fructose-bisphosphate aldolase,Fba1)特异性抗体的ELISA方法,评估其在IC早期诊断中的应用价值。方法利用基因重组技术获得的Eno、Fba1重组蛋白作为包被抗原,建立测定人血清相应抗体的ELISA,并对方法的敏感性、特异性进行考查。结果建立了检测IC患者血清抗Eno、抗Fba1抗体的ELISA,cut-off值分别为吸光度(A)值0.370和0.610。ELISA结果显示,IC患者血清中的抗Eno、抗Fba1抗体水平明显高于健康对照和非IC患者对照(P<0.001)。抗Eno和抗Fba1对诊断IC的敏感性和特异性分别为72.3%(73/101)和98%(196/200),87.1%(88/101)和96%(192/200),联合检测可提高敏感性至91.0%。且与细菌感染及其他真菌感染患者(如曲霉病)无交叉反应。IC患者中40.6%(41/101)可以在血培养阳性前检测到抗Eno、49.5%(50/101)可以在血培养阳性前检测到抗Fba1。结论建立了检测抗Eno、抗Fba1抗体的ELISA法,检测念珠菌菌丝相分泌蛋白IgG抗体特异性和灵敏度良好,在念珠菌感染诊断中具有潜在临床应用价值。
关键词
念珠菌
烯醇化酶
果糖二磷酸醛羧酶
抗体
ELISA
Keywords
Candida albicans
Enolase
Fructose-bisphosphate aldolase
Antibody
ELISA
分类号
R392.11 [医药卫生—免疫学]
下载PDF
职称材料
题名
广东水稻核心种质耐冷萌发全基因组关联分析
被引量:
3
3
作者
丁杰荣
孙炳蕊
于航
江立群
张静
吕树伟
陈文丰
范芝兰
潘大建
李晨
刘清
机构
广东省农业科学院水稻研究所/广东省水稻育种新技术重点实验室/广东省水稻工程实验室
出处
《植物遗传资源学报》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第5期1425-1437,共13页
基金
广东省农作物种质资源专项(省长专项2018-2019)
广东省广州市国家野生稻种质资源圃项目(粤发改农经[2021]272号)
+2 种基金
科技创新战略专项资金-广东省农科院高水平人才建设(R2020PY-JX001)
广东省重点实验室运行费(2020B1212060047)
广东省重点领域研发计划项目(2020B0202090003)。
文摘
萌发期耐冷性的强弱直接影响水稻直播时的成苗率。为高效地培育萌发期耐冷性强的水稻品种,本研究通过统计309份广东省水稻核心种质资源的低温萌发比率,筛选到57份萌发期耐冷性强的水稻品种。同时,以低温萌发比率为表型数据和高密度的SNP标记为基因型数据,利用全基因组关联分析鉴定到11个水稻低温萌发QTLs。其中qLTG2-1、qLTG7-1、qLTG7-2和qLTG10-1与前人定位的水稻低温萌发QTL共定位。qLTG11-1是本研究新鉴定的最显著的水稻低温萌发QTL。利用RNA-seq和qRT-PCR对其进行候选基因预测和验证,发现在低温萌发期间,qLTG11-1区间内的LOC_Os11g07020在低温萌发比率高和低的品种中有不同的表达模式。LOC_Os11g07020编码果糖-1,6-二磷酸醛羧酶同工酶,可能通过调控糖酵解反应而影响水稻萌发期耐冷性。本研究筛选到多份耐冷性强的水稻品种,并找到可能调控水稻萌发期耐冷性的候选基因,可为培育萌发期耐冷性强的水稻品种提供参考。
关键词
水稻
低温萌发
果糖
-1
6-
二磷酸
醛
羧酶
全基因组关联分析
Keywords
rice(Oryza sativa L.)
low temperature germination(LTG)
fructose-1,6-bisphosphate aldolase(FBA)
genome-wide association study(GWAS)
分类号
S511 [农业科学—作物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
胡杨果糖-1,6-二磷酸醛羧酶基因PeALD的克隆及耐盐性分析
张帆
常李伟
丁明全
侯佩臣
沈昕
陈少良
《基因组学与应用生物学》
CAS
CSCD
北大核心
2011
6
下载PDF
职称材料
2
念珠菌优势抗体检测方法的建立及临床诊断价值评估
马春芳
陆静芬
孔倩倩
韩丹丹
廖红
李芳秋
《医学研究生学报》
CAS
北大核心
2013
9
下载PDF
职称材料
3
广东水稻核心种质耐冷萌发全基因组关联分析
丁杰荣
孙炳蕊
于航
江立群
张静
吕树伟
陈文丰
范芝兰
潘大建
李晨
刘清
《植物遗传资源学报》
CAS
CSCD
北大核心
2022
3
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