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“班菲”脐橙果皮油斑病相关基因的分析
1
作者
魏召新
程春振
+4 位作者
程昌凤
吴纯清
朱世平
漆巨容
洪林
《食品科学》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2013年第17期219-224,共6页
柑橘油斑病作为一种普遍发生的柑橘病害,严重影响着果实的外观和商品价值。以晚熟脐橙“班菲”为材料,利用抑制差减杂交技术分别构建油斑病诱导的正反向cDNA文库。文库插入片段多在100~700bp之间,从正反向文库中各随机挑取了150个菌...
柑橘油斑病作为一种普遍发生的柑橘病害,严重影响着果实的外观和商品价值。以晚熟脐橙“班菲”为材料,利用抑制差减杂交技术分别构建油斑病诱导的正反向cDNA文库。文库插入片段多在100~700bp之间,从正反向文库中各随机挑取了150个菌液PCR检测为阳性的克隆进行测序,成功获得了有效ESTs序列292条。通过BLASTx序列比对,有165条ESTs找到了55个基因的同源序列,且E值小于1.0×10-3。GO功能归类结果表明:这些差异表达的ESTs主要涉及氧化还原、抗逆防御、生物和非生物胁迫等多种相关的生物学过程,推测油斑病的形成与氧化胁迫有关。
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关键词
柑橘油斑病
抑制性差减文库
差异表达基因
氧化胁迫
实时定量PCR
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职称材料
题名
“班菲”脐橙果皮油斑病相关基因的分析
1
作者
魏召新
程春振
程昌凤
吴纯清
朱世平
漆巨容
洪林
机构
重庆市农业科学院果树研究所
西南大学柑桔研究所
出处
《食品科学》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2013年第17期219-224,共6页
基金
重庆市科技攻关计划项目(CSTC2009AB1107)
文摘
柑橘油斑病作为一种普遍发生的柑橘病害,严重影响着果实的外观和商品价值。以晚熟脐橙“班菲”为材料,利用抑制差减杂交技术分别构建油斑病诱导的正反向cDNA文库。文库插入片段多在100~700bp之间,从正反向文库中各随机挑取了150个菌液PCR检测为阳性的克隆进行测序,成功获得了有效ESTs序列292条。通过BLASTx序列比对,有165条ESTs找到了55个基因的同源序列,且E值小于1.0×10-3。GO功能归类结果表明:这些差异表达的ESTs主要涉及氧化还原、抗逆防御、生物和非生物胁迫等多种相关的生物学过程,推测油斑病的形成与氧化胁迫有关。
关键词
柑橘油斑病
抑制性差减文库
差异表达基因
氧化胁迫
实时定量PCR
Keywords
citrus oleocellosis
suppression subtractive hybridization (SSH)
differentially expressed genes (DEGs)
oxidative stress
real-time PCR
分类号
S609.3 [农业科学—园艺学]
S666.4 [农业科学—果树学]
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作者
出处
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1
“班菲”脐橙果皮油斑病相关基因的分析
魏召新
程春振
程昌凤
吴纯清
朱世平
漆巨容
洪林
《食品科学》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2013
0
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