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大白菜遗传图谱的构建及与染色体关联分析
被引量:
13
1
作者
原玉香
张晓伟
+5 位作者
孙日飞
王晓武
张慧
蒋武生
姚秋菊
耿建峰
《华北农学报》
CSCD
北大核心
2010年第3期80-86,共7页
为构建大白菜遗传图谱,并与国际上公认的白菜参照图谱相关联。以大白菜晚抽薹DH系Y177-12和早抽薹DH系Y195-93为亲本建立的183个DH系为作图群体,利用SRAP、SSR、AFLP、STS、ESTP和CAPS等多种分子标记和形态标记构建大白菜遗传图谱,通过...
为构建大白菜遗传图谱,并与国际上公认的白菜参照图谱相关联。以大白菜晚抽薹DH系Y177-12和早抽薹DH系Y195-93为亲本建立的183个DH系为作图群体,利用SRAP、SSR、AFLP、STS、ESTP和CAPS等多种分子标记和形态标记构建大白菜遗传图谱,通过参照图上的锚定标记确定连锁群,并用最新的连锁群命名法进行命名。构建了包含10个连锁群、233个标记位点的分子遗传图谱,其中包括145个SRAP标记、62个SSR标记、12个AFLP标记、6个STS标记、4个ESTP标记、3个形态标记和1个CAPS标记。图谱总长度1 036 cM,标记间的平均图距为4.4cM。通过其中的38个SSR,4个ESTP和2个STS标记将各个连锁群与国际上认可A1-A10的参照连锁群相关联。该图谱的构建将为不同图谱的比较与整合及重要农艺性状的基因定位奠定基础。
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关键词
大白菜
分子标记
遗传图谱
染色体关联
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职称材料
细胞分化周期蛋白27基因沉默抑制GH3细胞迁移及其分泌功能
2
作者
苏星
王安平
+1 位作者
郭清华
母义明
《解放军医学院学报》
CAS
2018年第4期324-331,352,共9页
目的进行3种全基因组外显子测序所得基因体外的功能验证,为垂体柄中断综合征病因研究的体内实验提供理论依据。方法将细胞分化周期蛋白27(cell division cycle protein 27,CDC27)、神经纤维瘤病1型(neurofibromatosis type1,NF1)、X染...
目的进行3种全基因组外显子测序所得基因体外的功能验证,为垂体柄中断综合征病因研究的体内实验提供理论依据。方法将细胞分化周期蛋白27(cell division cycle protein 27,CDC27)、神经纤维瘤病1型(neurofibromatosis type1,NF1)、X染色体关联的泛素特异性蛋白酶9(ubiquitin specific peptidase 9,X-Linked,USP9X)三种基因经由小干扰RNA(si RNA)分别转染至细胞内,每种基因均设置实验组、阴性对照(negative control,NC)组、空白细胞组。通过RTPCR筛选出各基因最佳的si RNA敲低序列以用于复筛,Western bolt复筛各基因最佳敲低序列在蛋白水平的表达,以确定目标基因进行下一步研究。依次运用CCK-8检测细胞增殖能力及形态,细胞划痕实验检测细胞迁移,酶联免疫吸附试验(enzyme linked immunosorbent assay,ELISA)检测细胞分泌功能,Western bolt检测垂体特异性转录因子-1(pit-oct-unc class 1homeobox 1,POU1F1)和垂体特异性转录因子祖先蛋白(homeobox protein prophet of pit-1,PROP1)表达水平。结果 1)CDC27在si RNA 117和1968序列时能够达到稳定的沉默效率,并且在mRNA及蛋白两个水平上均能够被敲低,NF1和UPS9X仅能在mRNA水平上实现敲低而未实现蛋白水平的敲低,无法进行后续实验;2)CDC27沉默对于细胞的增殖及形态无明显影响(P>0.05);3)CDC27沉默能够明显抑制细胞的迁移能力(P<0.05);4)CDC27沉默能够明显抑制细胞分泌生长激素(growth hormone,GH)、泌乳素(prolactin,PRL)分泌(P均<0.05),对促甲状腺激素(thyroid stimulating hormone,TSH)的分泌无明显影响(P>0.05);5)CDC27沉默能够明显下调POU1F1与PROP1的表达水平(P<0.05)。结论 CDC27沉默可以抑制GH3细胞的迁移及其生长激素、泌乳素的分泌。
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关键词
细胞分化周期蛋白27
神经纤维瘤病Ⅰ型基因
X
染色体关联
的泛素特异性蛋白酶9
垂体柄中断综合征
垂体特异性转录因子-1
垂体特异性转录因子祖先蛋白
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职称材料
题名
大白菜遗传图谱的构建及与染色体关联分析
被引量:
13
1
作者
原玉香
张晓伟
孙日飞
王晓武
张慧
蒋武生
姚秋菊
耿建峰
机构
河南省农业科学院园艺研究所
中国农业科学院蔬菜花卉研究所
出处
《华北农学报》
CSCD
北大核心
2010年第3期80-86,共7页
基金
国家"863"计划项目(2008AA10Z148)
"十一五"国家科技支撑计划子课题(2006BAD01A7-1-06)
文摘
为构建大白菜遗传图谱,并与国际上公认的白菜参照图谱相关联。以大白菜晚抽薹DH系Y177-12和早抽薹DH系Y195-93为亲本建立的183个DH系为作图群体,利用SRAP、SSR、AFLP、STS、ESTP和CAPS等多种分子标记和形态标记构建大白菜遗传图谱,通过参照图上的锚定标记确定连锁群,并用最新的连锁群命名法进行命名。构建了包含10个连锁群、233个标记位点的分子遗传图谱,其中包括145个SRAP标记、62个SSR标记、12个AFLP标记、6个STS标记、4个ESTP标记、3个形态标记和1个CAPS标记。图谱总长度1 036 cM,标记间的平均图距为4.4cM。通过其中的38个SSR,4个ESTP和2个STS标记将各个连锁群与国际上认可A1-A10的参照连锁群相关联。该图谱的构建将为不同图谱的比较与整合及重要农艺性状的基因定位奠定基础。
关键词
大白菜
分子标记
遗传图谱
染色体关联
Keywords
Chinese cabbage
Molecular marker
Genetic linkage map
Chromosome assignment
分类号
S634.03 [农业科学—蔬菜学]
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职称材料
题名
细胞分化周期蛋白27基因沉默抑制GH3细胞迁移及其分泌功能
2
作者
苏星
王安平
郭清华
母义明
机构
解放军总医院内分泌科
解放军总医院海南分院内分泌科
出处
《解放军医学院学报》
CAS
2018年第4期324-331,352,共9页
基金
国家自然科学基金项目(81570705
81270866)
+1 种基金
海南省自然科学基金项目(20168353)
海南省卫计委课题(15A200071)~~
文摘
目的进行3种全基因组外显子测序所得基因体外的功能验证,为垂体柄中断综合征病因研究的体内实验提供理论依据。方法将细胞分化周期蛋白27(cell division cycle protein 27,CDC27)、神经纤维瘤病1型(neurofibromatosis type1,NF1)、X染色体关联的泛素特异性蛋白酶9(ubiquitin specific peptidase 9,X-Linked,USP9X)三种基因经由小干扰RNA(si RNA)分别转染至细胞内,每种基因均设置实验组、阴性对照(negative control,NC)组、空白细胞组。通过RTPCR筛选出各基因最佳的si RNA敲低序列以用于复筛,Western bolt复筛各基因最佳敲低序列在蛋白水平的表达,以确定目标基因进行下一步研究。依次运用CCK-8检测细胞增殖能力及形态,细胞划痕实验检测细胞迁移,酶联免疫吸附试验(enzyme linked immunosorbent assay,ELISA)检测细胞分泌功能,Western bolt检测垂体特异性转录因子-1(pit-oct-unc class 1homeobox 1,POU1F1)和垂体特异性转录因子祖先蛋白(homeobox protein prophet of pit-1,PROP1)表达水平。结果 1)CDC27在si RNA 117和1968序列时能够达到稳定的沉默效率,并且在mRNA及蛋白两个水平上均能够被敲低,NF1和UPS9X仅能在mRNA水平上实现敲低而未实现蛋白水平的敲低,无法进行后续实验;2)CDC27沉默对于细胞的增殖及形态无明显影响(P>0.05);3)CDC27沉默能够明显抑制细胞的迁移能力(P<0.05);4)CDC27沉默能够明显抑制细胞分泌生长激素(growth hormone,GH)、泌乳素(prolactin,PRL)分泌(P均<0.05),对促甲状腺激素(thyroid stimulating hormone,TSH)的分泌无明显影响(P>0.05);5)CDC27沉默能够明显下调POU1F1与PROP1的表达水平(P<0.05)。结论 CDC27沉默可以抑制GH3细胞的迁移及其生长激素、泌乳素的分泌。
关键词
细胞分化周期蛋白27
神经纤维瘤病Ⅰ型基因
X
染色体关联
的泛素特异性蛋白酶9
垂体柄中断综合征
垂体特异性转录因子-1
垂体特异性转录因子祖先蛋白
Keywords
cell division cycle protein 27
neurofibromatosis type 1 gene
ubiquitin specific peptidase 9, X-Linked
pituitary stalkinterruption syndrome
pit-oct-unc class 1 homeobox 1
homeobox protein prophet of pit-1
分类号
R329.2 [医药卫生—人体解剖和组织胚胎学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
大白菜遗传图谱的构建及与染色体关联分析
原玉香
张晓伟
孙日飞
王晓武
张慧
蒋武生
姚秋菊
耿建峰
《华北农学报》
CSCD
北大核心
2010
13
下载PDF
职称材料
2
细胞分化周期蛋白27基因沉默抑制GH3细胞迁移及其分泌功能
苏星
王安平
郭清华
母义明
《解放军医学院学报》
CAS
2018
0
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