T细胞急性淋巴细胞白血病染色体碎裂化发病率及相关遗传事件分析

目的 分析T细胞急性淋巴细胞白血病染色体碎裂化的发病率及相关遗传事件。方法 纳入T细胞急性淋巴细胞白血病患者32例,年龄23~61岁,平均年龄(26.49±8.49)岁。其中起源于早期前体T细胞(ETP)的急性淋巴细胞白血病14例,为ETP组;非ETP的急性淋巴细胞白血病18例,为non-ETP组。单核苷酸多态性阵列(SNPa)和全基因组测序(WGS)检测染色体碎裂化并分析与T细胞急性淋巴细胞白血病发生发展的相关遗传事件。结果 SNPa总计检测到249个基因组变异事件,其中有160个丢失,67个获得和22个拷贝中性杂合度损失。在ETP组中发现的基因组变异事件数量明显高于non-ETP组(P<0.05)。在32例患者中有9例检测到染色体碎裂化(28.13%),均为ETP组,并涉及两条(3例)、三条(4例)、四条(2例)染色体。染色体5、6、7、9、12和17经常受到影响。9例染色体碎裂化病例中主要的基因组变异基因包括SET-NUP214重排(5例)、SQSTM1-NUP214重排(1例)、TRB-HOXA重排(3例)。染色体碎裂化阳性病例的基因组变异事件发生率明显高于染色体碎裂化阴性病例(P<0.05)。相反,染色体碎裂化阴性病例中,基因组变异事件的发生率在ETP组和non-ETP组之间没有显著差异。结论 T细胞急性淋巴细胞白血病的染色体碎裂化发病率为28.13%,并且都是发生在ETP,染色体碎裂化相关的主要基因组变异事件是SET-NUP214、SQSTM1-NUP214、TRB-HOXA重排。

染色体碎裂化在肿瘤中的作用及其检测技术研究进展

染色体碎裂化是指在一次细胞灾难性事件当中,染色体片段被全部打碎,然后这些片段以另一种顺序重组。经过染色体碎裂化的细胞一般会死亡,仅极少数细胞幸存下来,可能是由于大规模基因组重排让细胞有转化为癌细胞的趋势。染色体碎裂化导致的后果包括癌基因的扩增、抑癌基因的丢失以及融合基因的形成等。在染色体碎裂化的过程中,那些未参与重组的碎裂片段,一些会丢失,另一些则作为染色体外DNA(Extrachromosomal DNA,ecDNA)持续存在。这些ecDNA中的一些促进了癌细胞的生长,并能形成微小尺寸染色体,称为双微体。目前染色体碎裂化检测技术可分为常规检测技术与高通量基因测序检测技术。常规检测技术有荧光原位杂交、外周淋巴细胞核型分析和染色体微阵列技术,高通量基因测序检测技术有下一代测序技术以及长读长基因测序技术。在分析染色体碎裂化技术上,长读长基因测序技术具有更大的优势,它不仅可准确检测出染色体碎裂的断点位置,还可对破碎的片段进行定向识别与排序,检测出复杂重排位点,弥补短读长基因测序和常规检测技术上的缺陷。本文主要对染色体碎裂化在促进肿瘤进展和耐药中的作用以及当前相关检测技术的优缺点进行综述。