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有向染色体组移位排序距离的快速算法
1
作者
刘燕
李辉智
+1 位作者
易东
敬培胜
《北京生物医学工程》
2007年第2期172-174,198,共4页
目的寻找一种有向染色体组织移位排序距离的快速算法,解决其计算的复杂性问题。方法引入长圈的分裂和新的长圈分组算法,降低计算复杂性。结果原有的排序最好算法的复杂度为O(n^2),改进算法的复杂度为O(nlg·n)。结论改进算法能大大...
目的寻找一种有向染色体组织移位排序距离的快速算法,解决其计算的复杂性问题。方法引入长圈的分裂和新的长圈分组算法,降低计算复杂性。结果原有的排序最好算法的复杂度为O(n^2),改进算法的复杂度为O(nlg·n)。结论改进算法能大大提高计算速度,避免了排序算法的NP难问题。
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关键词
染色体组排序
移位距离
计算分子生物学
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职称材料
题名
有向染色体组移位排序距离的快速算法
1
作者
刘燕
李辉智
易东
敬培胜
机构
第三军医大学卫生统计学教研室
西南政法学院刑侦系
出处
《北京生物医学工程》
2007年第2期172-174,198,共4页
基金
国家自然科学基金(60371034)资助
文摘
目的寻找一种有向染色体组织移位排序距离的快速算法,解决其计算的复杂性问题。方法引入长圈的分裂和新的长圈分组算法,降低计算复杂性。结果原有的排序最好算法的复杂度为O(n^2),改进算法的复杂度为O(nlg·n)。结论改进算法能大大提高计算速度,避免了排序算法的NP难问题。
关键词
染色体组排序
移位距离
计算分子生物学
Keywords
sorting genomes
translocation distance
computational molecular biology
分类号
R318.08 [医药卫生—生物医学工程]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
有向染色体组移位排序距离的快速算法
刘燕
李辉智
易东
敬培胜
《北京生物医学工程》
2007
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